《文淵閣書目》
明正統六年(公元1441年)，由楊士奇主持編修而成。它不按經、史、子、集四部分類，而首先以千字文排次為序，自天字至往字，分成20號，每號下分若干櫥，櫥下再分類，依類登錄圖書。目錄共收圖書7200餘部，多不著撰者姓名，有冊而無卷數，目錄學史上對此書目評價不高。
《明史·藝文志》
從漢到宋，歷代正史藝文志，基本上都是反映當時政府藏書的官修目錄，而《明史·藝文志》只記載明代人的著述。 《明史·藝文志》仍取四部分類，每部之下分成35類，共收明人著作4462種，105794卷。這種只收本朝著述的辦法，為後來各種增補史志與民國時期撰修的《清史稿·藝文志》所採納。
《古今圖書集成·經籍典》
這是清代康熙、雍正兩帝先後命陳夢雷及蔣廷錫編制的官修目錄。經籍典是將以前歷代正志、專史的藝文志、經籍志加以匯總的大型目錄，從而為讀者提供了從先秦至清代2000多年間典籍存亡的豐富資料。它將所收圖書分為65類，雖未標出四部之名，但實際上以四部為序。
《四庫全書總目》
《四庫全書總目》，也稱《四庫全書總目提要》。經乾隆帝批准，由《四庫全書》總纂修官紀昀主持，將所徵集的圖書“詳細校正，依經、史、子、集四部名目，分類匯列，另編目錄一書，具載部分、卷數、撰人姓名，垂示永久”(《辦理四庫全書檔案》)。根據著錄收入圖書3461種，79309卷；未收的存目6793種，93550卷。基本包括了清代乾隆以前的中國古代書籍。總目含經部10類，史部15類，子部14類，集部5類。四部前有總序，大小類前都有小序，書附提要，一目了然。由於卷帙太大，乾隆四十九年(公元1784年)仍由紀昀刪節提要，不錄存目，編成《四庫全書簡明目錄》。
《讀書敏求記》
它是我國第一部研究版本目錄學的專著。作者錢曾是明末清初著名藏書樓絳雲樓主人錢謙益的族孫，對於鑑別古本，評定價值有很高的造詣。 《讀書敏求記》收錄634種宋、元精刻本。書以四部為序，經部6類，史部10類，子部20類，集部3類，共計39類。對於各書次第完缺，古今異同，都加以標明與考訂，從版式、行款、字體、刀刻、筆墨斷定雕印年代，從祖本、子本、原版、修版來確定版本價值。是一本有價值的善本書目。
《士禮居藏書題跋記》
清代乾嘉時期的著名藏書家黃丕烈，精於版本鑑定之學，每得一善本，輒作題跋。光緒時，潘祖蔭多方覓求，得黃丕烈所作題跋350篇，以《士禮居藏書題跋記》為名刊行。該書雖以題跋記的形式出現，但涉及圖書的版本、校勘、流傳，仍起到目錄的作用。
明清兩代還有許多著名私家目錄，如《菉竹堂書目》、《百川書志》、《澹生堂書目》、《世善堂書目》、《紅雨樓書目》、《傳是樓書目》、《振倚堂書目》等，這裡不再一一介紹。