在西行求法運動大張旗鼓進行的時候，中印兩國人民之間的商業貿易也在進行。而且，在南北朝時期，政府間的往來也增多了。
《晉書·四夷傳》“大秦國”條下記載說：“安息、天竺人與之交市於海中，其利百倍。”《苻堅傳》中又提到，苻堅平定北方以後，“凡六十有二王，皆遣使貢其方物”。其中有“天竺獻火浣布”。苻堅很重視西域的經營，也控制了富庶的蜀地。應當說，晉時西北和西南的交通都不曾斷絕。當時僧人的往來更能證明這一點。
劉宋元嘉五年(公元428年)，有一份來自印度的國書保存在《宋書·夷蠻傳》裡。這是天竺迦毗黎國(大約在南印度卡維利河流域)國王月愛致宋文帝的。梁武帝天監初年(公元502年)，又有印度屈多王致梁武帝的國書保存在《梁書·諸夷傳》中。這些國書言辭懇切，表達了強烈的通好願望。此外，正史中還記載了不少印度諸國遣使貢獻的事例，如《宋書》記載：“太宗泰始二年，又遣使貢獻，以其使主竺扶大、竺阿彌並為建威將軍。”與南朝保持聯繫的主要是南印度的國家，其交通路線是南海道。
《魏書》各《本紀》中也有若干記載。根據這些記載統計，從451至521年的70來年間，印度各地派使者(其中有若干商人)來北魏，至少有27次。與北魏保持聯繫的主要是北印度諸國，其交通路線是西域道。
俗話說，來而不往非禮也，中國南北政府派使者去印度的事也一定不少，只是史書中記載不多罷了。但不管怎樣，這種頻繁的交往，既促進了中印間的文化交流，也增進了彼此的友誼和了解。
這一時期，印度的友好使者們給中國帶來了許多奇珍異寶和一些稀有動物，而中國傳到印度的主要是絲和絲製品。在科學技術方面，由於佛經的大量翻譯，以及印度僧人來華，印度的一些天文曆算知識和醫藥衛生知識也傳到中國。例如，《隋書·經籍志》中就記載有《婆羅門天文經》、《婆羅門竭伽仙人天文說》、《婆羅門陰陽算歷》和《婆羅門算經》等天文曆算方面的書籍，同時還記載有《龍樹菩薩藥方》、《西域婆羅仙人方》、《婆羅門諸仙藥方》、《婆羅門藥方》、《龍樹菩薩和香法》和《龍樹菩薩養性方》等醫藥養生方面的書籍。這些書籍雖然記錄在《隋書》裡，但傳入時間應當在隋以前。它們在中國流傳，勢必對中國的天文曆算和醫藥養生髮生影響。
下面讓我們舉兩個具體的例子。
《高僧傳》卷四《於法開傳》說：於法開，“不知何許人”，“祖術耆婆，妙通醫法”。一次，他到一家，正趕上那家婦人難產，無法治療，全家人急得沒辦法。於法開說，這好辦。便讓婦人喝下少許羊肉湯，然後針灸，不一會兒，孩子生下來，母子平安。
於法開有可能是西域于闐人，或者祖上是于闐人。 “耆婆”，是印度古代著名的醫生。於法開“祖術耆婆”，意思是他學習的醫術是從印度傳來的。他同時還會針灸，這顯然是中國的傳統醫術。從這條記載看，於法開是把中印醫術結合起來了，是當時的“中西醫結合”。
南朝陶弘景是我國古代的大醫學家之一。他曾將晉代葛洪編的醫書《肘後救卒方》增刪改編為101篇的《補闕肘後百一方》。他少年時代喜歡道教，老年皈依了佛教。在這部書的自序中，他說：“佛經云：人用四大成身，一大輒有一百一病。”印度古人認為，世界上有四大元素，即地、水、風、火；人體也是由“四大”組成，四大協調，人就健康，四大不調，人就生病，一大不調，就會引起101種病。陶弘景顯然是接受了這一理論。