李自成倉皇撤離北京城以後，京城內外，社會秩序在經過兩次換主之後已經相當混亂，人們對後入主北京的滿洲貴族懷有嚴重的恐懼心理。更為嚴重的問題是，之前李自成農民軍大量佔用糧草，撤離時又將京城中的糧草運走，造成百姓生活極其困難的局面。形勢嚴峻，刻不容緩，穩定北京，站穩腳跟，對清朝未來的發展，以及能否實現全國統一，關係重大。還沒有決定遷都時，攝政王多爾袞就果斷採取了措施，實施新政策，力圖扭轉混亂的局面。
在經過深思熟慮並和諸貝勒大臣商討後，他擬定了一套方案，針對現狀徹底改變了往日的一些策略，把重點放在贏得民心上。他認為，雖然得了京城，如果沒有得民心，這和守著一塊空地沒什麼區別，相反還有可能滋生民眾起義的苗頭。按照現在的形式來看，政策需一步一步來實施，這樣會避免不少問題。順治七年十二月，攝政王多爾袞病逝。順治八年正月，順治剛剛十四歲，正式親政。他繼續多爾袞攝政時期的各項政策，繼續嚴整吏治，嚴懲貪污行賄等犯罪者，力圖建立一代廉明政治。
順治帝和先前的清帝不同的是，他是在安定的環境中成長起來的皇帝，雖然沒有先帝般驍勇善戰，但在理論學識上更加博學。多爾袞在政期間所做的事，他早就看在眼裡，在嚴懲貪官上，多爾袞雖然屢次嘗試改善，卻沒有得到實質性的效果。順治認為，問題恰恰出在時間和力度上，以當時的背景而言，多爾袞能夠做到這一點已經實屬不易。而現在自己親政正好可以抓住這一點，一來可以證實自己的實力，二來則可以讓國家更為安定。他把這點作為親政後首先要解決的問題，經過一番深思熟慮後，他認為，如果想杜絕貪污受賄之風，必須從各個角度，下大力氣去解決。
他開始不斷發出指示，在各省設總督、巡撫、都御史、巡方、巡鹽、巡視茶馬等御史，以作監督。他對各御史說道：“我封你們這樣的官，並不是要讓你們貪圖富貴，而是讓你們安民，貪官禍害的是國家和人民，最為可恨，你們一定要把貪官一個個全給我揪出來！”但是到了順治十二年，“貪風”依然不息。於是順治加大了力度，制定了更為嚴厲的法律，同貪官污吏進行鬥爭。同年十一月，他宣布：從今以後，內外大小官員，凡收贓十兩白銀以上者，除了依律定罪外，不分什麼枉法不枉法，其家產全部充入國庫。如此一再增加力度，似乎並沒有在實質上起到什麼效果。終於，順治想到了一個想法，大案、要案，自己都要親自審訊並處理，這樣一來，可以震懾貪官。
順治十二年，發生了順天巡按顧仁受賄案，是最為引起震動的一件大案。這是一件血淋淋的案件，告發者是吏部書吏章冕。十月十九日，章冕屢次揭發顧仁不成，於是下了狠心自盡，用死來告發顧仁貪贓枉法，陷害無辜。順治聞訊很是震怒，顧仁本是自己欽點的欽差，以刑部主事任巡按銜。讓顧仁查訪地方百姓的疾苦，並且主抓貪污受賄者，臨行前順治一再叮囑。然而顧仁一出城就揭去了臉上清廉的假面，膽大妄為，開始以權賣權。
王琦、章冕等人，欲謀取巡按書辦的職位，便託了顧仁的熟人刑部司官賀繩烈為其求情，並各自送了二百兩銀子作為好處費給顧仁。但官位只有一個，狼多肉少。王琦暗中又送給了顧仁二百兩銀子，顧仁便接受了王琦，其餘人全都白花了銀子，被堵在門外。章冕送了“無頭銀”沒得到想要的，那二百兩本是家裡的全部家當，這樣一弄，自己就連家也沒了。章冕心中按捺不住，那份剛開始的諂媚也一併隨著銀子給扔掉了，他開始想辦法揭發顧仁的行為。自古官官相護，他剛一揭發，這邊就把事情轉給了顧仁。顧仁剛開始並不理會，因為先前也曾出現過類似的情況。有他們這些官壓著，揭發的人往往在揭發的過程中自己就退出去了。但是章冕不同，他是個性情中人，心想：我就是死，也要揭發顧仁的醜行。於是，他揚言道：“你這是貪贓枉法，我雖然也有錯，但我會以死抵罪，足夠償還我先前犯下的罪。但是你卻不同，我要揭發你，以少一些人陷入你的利誘。”
顧仁怕事情鬧大了對自己不利，便起了殺人滅口之心，等派了殺手過去以後，卻發現章冕早已經在家中自刎而死了。章冕的事情鬧得滿城風雨，街頭巷尾，閒著的、忙著的、說書的，幾乎沒人不提。直到這件事傳到了宮裡，傳到了順治的耳朵裡。
順治大怒，同時心裡也有些自責，自己看走了眼，讓這麼一個貪官去懲治貪官，只會讓官一個個變得更貪。思慮在三，他決定親自主抓這個案子。
經過核實，順治了解了其中的緣由，便召集滿漢文武大小官員，把顧仁押到了大殿之上。眾官早就猜到了順治的用意，其中和顧仁有些牽連的官員開始有些擔心後怕起來。
順治在大殿上來回走了幾步，雙手背在後面，沉默不語。這種沉默讓眾官感到心裡寒寒的。終於，他在沉默了好一會兒後說道：“朕不知如何開口，今日召集眾官來殿其實沒別的事……”說著，他用手指著跪在地下，渾身如篩糠般抖個不停的顧仁說道：“是想問問朕親自禦點的欽差功績如何，顧愛卿能粗略地報一報麼？”
顧仁埋頭跪在地上，顫聲說道：“臣有罪，罪不可恕，還望皇上開恩，念在我也曾為大清立過不少功績，饒臣一死。”
眾官同時發出一陣噓聲，心想：你這罪就算再長十個腦袋都不夠砍的，還是祈禱自己能死個痛快，並且少牽連點人吧。
順治臉上剛開始還是溫和的詢問之色，顧仁的話剛一說完，他的臉色頓時變得深沉了，語氣也鏗鏘有力起來：“顧仁，朕正是看你曾立過不少功績，才委重任於你。但是你給朕帶來了什麼？給我大清帶來了什麼？是災難！”說著，他把臉面向眾官說道：“顧仁背旨違法，貪污受賄，給我大清帶來了嚴重的負面影響。朕自當慚愧，沒有看清。顧仁，朕本該判你凌遲處死，念你也曾為我大清做出功績，現在改判你立即斬首，妻子、子女、家產全部充公。”
順治召集群臣的本意，其實還有另一個警示的目的，以顧仁的下場來警示即將或者正在貪污的官員盡快收手，顧仁的下場就是違令者的下場。眾官哪有不明白的道理，紛紛跪在地上叩首齊喊道：“皇上英明，大清萬代。”
幾日後，順治追究是哪個人舉薦顧仁，科舉何人錄取，並且是怎麼混入朝廷為官的。經過內大臣鰲拜確查，顧仁的推薦人是刑部尚書與刑部侍郎王爾祿，錄取顧仁考選者是吏部尚書王永吉等五人，順治分別給予他們降級處分。
其後，順治親自經手處理了好幾個大案。
順治十五年十一月，江南按察使盧慎言貪贓數万兩銀子，數額巨大。順治核實後，將盧慎言凌遲處死。
類似的大小案件有很多。自順治八年到十七年，九年中，順治親自處理的貪污案件達四十五件。可以肯定，對貪污受賄的從嚴懲治，是對腐敗勢力的沉重打擊。除了不斷加大打擊貪污腐敗的力度，同時還不忘及時提拔重用賢德的人。清除貪官污吏，淘汰一些庸官，選用優勝有賢的委予重任。順治把發現和選拔人才看做吏治的一個極為重要的方面，從一定意義上來說，這是“澄清吏治”的根本保證。順治把懲貪和用賢結合起來，兩者相輔相成，在其後的時間裡確實有了實質性的改善。
從政治體制上來說，清朝的政治體制沿用了明朝的政治體制。在體制上沿用的同時，也讓明朝官場的腐敗氣息順勢滲透進來。當然這種官場的腐敗也並不是明朝特有的，但卻是明朝末年最為突出的問題，也是明朝滅亡最根本的原因。清朝作為一個剛剛建立的新政權，整頓吏治也是一種必不可少的圖強之法。順治皇帝在打擊貪污腐敗方面所做的努力，使得清朝這一時期的官場風氣相對較為清廉，也為之後的康乾盛世奠定了很好的政治基礎。