蔣介石宣布重新擔任總統後，國民黨進入歷史上空前未有的最危險的時期。
（台灣，1950年3月—5月）
如今的台北市中心，風格新穎、造型考究的高樓大廈鱗次柿比，使城市顯示出現代化的氛圍。這棟只五層樓面、聳有一高塔的建築，在那些高樓群落中，已經不是最高最大最堂皇的樓房。這棟五層樓房，屬於歐洲文藝復興式建築，樓身為鋼筋混凝上結構，牆外貼紅色面磚，結構嚴謹堅實，於一九一二年六月一日動工建造，一九一九年三月正式竣工落成。從繪圖到啟用，歷時十三載，在當時，是全台灣島最宏偉壯觀的五層大樓。在二次大戰日本佔領年代的末期，曾遭美國飛機炸毀。日本投降台灣收歸中國，又於一九四六年間開始按原樣重建。一九四七年完工，正逢蔣介石六十歲；當時台灣省主席魏道明為討好蔣介石，將此樓改名為“介壽館”。不久，又當作東南軍政長官公署。在一九四九年，國民黨從大陸撤到台灣時，這棟建築仍不失為全台灣島最堂皇的大樓。
一九五零年三月一日，蔣介石宣布恢復總統職務，便選中了這棟樓房作“總統府”。這棟大樓是台灣島上最風光的建築，可是，當時在這棟樓里當總統，可並不是風光的總統。其時，法律上的代總統李宗仁赴美國後，以治病為名，滯留在紐約，住不起賓館，就在新澤西州買了一所木匠的普通房子，當起寓公來。中華民國政府自一九四九年十二月退遷至台灣，其總統位置等於虛懸。蔣介石以國民黨總裁名義，掌握著陸海空三軍實權，這當然屬於名不正言不順，不符合憲法精神；於是，蔣介石玩弄了政治手腕，重新戴起了中華民國總統的帽子。說實在話，當時台灣島的形勢危如累卵，也有人形容它“只是個等待爆炸的火藥庫”；這個總統也不是好當的，也可以算是勉為其難、苦撐危局了！
台灣島的面積三萬六千平方公里，山脈佔去三分之二，但可耕地不及三分之一，人口六百萬。經濟上，在一九四九年剛剛恢復到抗戰前的水平。可是，一下子從大陸退湧來二百多萬軍民，人口驟增，經濟惡化，生產失調，通貨膨脹極為嚴重。根據台灣政府當局頒布之平均物價指數，一九四九年的物價是一九四五年抗戰勝利時的七千餘倍。但據台灣經濟界人士嚴演存先生計算，漲幅不止於政府公佈的數字；他記得當年小販在巷口唱：“油炸脆散子，每隻八千塊，要買呵，快買呀！”而抗戰勝利那年，此類小食，每隻不過一二毛錢。嚴先生說，就此項物品而言，漲幅是四萬至八萬倍之間！此種漲幅比大陸上的金圓券，是小巫見大巫，民眾百姓，已苦不堪言。
與經濟狀況一樣嚴重的，是人心不穩。當時，有過大陸上潰退經驗的外省人，許多人已產生了“恐怕快完了”的心理；有的已在私下暗說“天快亮了”。有的從大陸遷台的企業家，機器設備剛運到台灣，終於放心不下，又高價僱船，將機器遷到南美去了。有的政界人士，也紛紛出走海外，如曾擔任台灣省主席的魏道明，就寓居巴西；擔任過東北大員的熊式輝，也滯留香港，不願來台。
蔣介石的正統傳記撰稿人董顯光，對蔣恢復總統職位，是這樣說的——
當然，蔣總統如復職，他所遭遇的困難自多，他如專為自身打算，自仍以引退為宜，復職後如不幸失敗，不是有生命的危險，便是飽受指責，蔣總統所享受中國的尊榮已過於最高峰。今後所遭遇者或不免有下坡之事，故從個人利便的原則而論，他最好是置身局外，而避免最後奮鬥的艱鉅責任。
蔣介石恢復總統職務，其實也是在明眼人意料之中事。這種“以退為進”的辦法，他已經在早年政治生涯中用過兩次了，並不顯得新鮮。這次，面對台灣島“危危乎殆哉”的實際情況，他是像陶希聖所說，“明知其不能也要為”。
蔣介石耍了政治手段重新上台，因而格外注意各方面的反應，尤其是來自美國方面的反應。流亡美國的政治對手李宗仁的反應，是蔣介石意料之中的。宋美齡從英文電訊中得到消息，美國各報刊刊登了李宗仁的發言人甘介侯的聲明。甘介侯代表李宗仁聲明邀責蔣介石恢復總統職位，稱之為違憲行動，理由是蔣介石將總統職務移交李宗仁之後，他已經成為一個平民。甘介侯向記者們問道：“一個平民怎能自稱為中國總統？”
蔣介石得知，只是苦然一笑。他宣布正式複職的當日，便給李宗仁發去一封電報，通知李，由於時勢與環境的需要，他已於三月一日在台北復任總統，希望李以副總統的身分在美國作他的專使，在友邦爭取外援云云。李宗仁通過甘介侯作如此反應，他並不驚異。
蔣介石更為關注的是美國當局的反應。當他在三月一日宣布“復職視事”的當晚，從外交部長葉公超那兒得到報告，稱美國總統杜魯門仍將於三月二日中午在白宮宴請並會見李宗仁時，他的反應已是從痛苦而至憤怒，可是卻不能對外發洩出來；他只能讓葉公超囑咐駐美大使顧維鈞，要盡快詳細向台北方面報告杜魯門請李的宴會及招待會的情況。葉公超特別關照顧維鈞，委員長特別急於了解杜魯門總統是如何稱呼李宗仁的，是否稱李為代總統。
在三月二日上午白宮舉行的記者招待會上，有記者問杜魯門總統，他將如何並按什麼身分接待李宗仁。這正是美國記者的特點，越是令人為難的問題，他們就越愛問。杜魯門總統當時答复說：“作為中國的代總統。”當記者問到他是否知道蔣委員長已經恢復總統職位時，杜魯門答复說，他一直沒有同委員長直接聯繫。
三月二日這天一大早，葉公超外交部長又給顧維鉤大使來指示說，如果杜魯門的午宴是把李宗仁作為代總統而舉行的，作為中華民國駐美大使的顧維鈞就根本不要參加，並向美國務院正式說明不出席的原因。顧維鉤接到指示後判斷，這是委員長在台北見到甘介侯攻擊他的聲明而命令葉發出的指示。顧維鉤是一個老練而成熟的外交家，他覺得蔣介石這個要求顯然是不切實際的。如果顧按照指示辦理，他覺得將會引起一場與美國政府之間的政治風波，會使情況對台灣當局十分不利。顧維鈞還是決定出面陪同李宗仁與甘介侯去見杜魯門，並在駛往白宮的汽車裡，與甘介侯商量由甘出面介紹李宗仁的身分。當時白宮在修繕中，杜魯門以白宮對面的布萊爾大廈為總部。會見與宴會是在布萊爾大廈舉行的。參加宴會的除了杜魯門、李宗仁、顧維鈞與甘介侯，還育美國國務卿艾奇遜與國防部長約翰遜。據《李宗仁回憶錄》記述，“杜氏致歡迎詞後，按外交禮節，應請顧大使翻譯，然杜氏一反常例，卻請介侯翻譯，終席未與顧氏交一言。”
宴會結束後，杜魯門總統首先步出宴會廳，李宗仁跟著出去。顧維鉤正要陪李往前走時，艾奇遜忽然伸手扯住顧說：“我們在這邊談一談。”艾奇遜並請甘介侯為李和杜的談話作翻譯。這樣，顧維鉤被艾奇遜拉住，與約翰遜一起在大客廳裡談話。李宗仁和杜魯門得以避開顧維鈞，在小客廳裡談話。其實，據李宗仁透露，杜魯門也只是對其說了一些禮儀上的話。杜魯門說，現在發生的情況他都了解，只是來日方長，勸李必須暫時忍耐，並與他保持接觸。言語之間，李宗仁得知杜魯門已決定應付現實環境，李覺得別的內容就不必談了。但是，作為駐美大使的顧維鈞被排除在李宗仁。杜魯門的談話之外，這顯然是事先的安排。蔣介石及其在美國的親信，對此十分惱火，然而卻無可奈何。
美國人其實是對蔣介石耍了一下手腕而已。在當天晚間，國務院新聞發布官麥克德英特發表聲明說，國務院收到了蔣介石恢復總統職位的正式通知，美國承認蔣介石是中國政府的首腦。聲明還說，關於誰是中國總統的問題是一個由中國政府自己決定的問題。
蔣介石復職以後，在一次總理紀念週的集會上，面對兩卜千多名高中級幹部，作了一次動人的演講，說動人，因為蔣介石作為獨裁者，多年來講話都是訓人的。這次演講，調子截然不同，聽眾沒有受到訓斥，而是蔣介石以總裁及總統的身分，作了對自己的痛定恩痛的檢討。演說要點是：（1）虛心接受大陸失敗的教訓。 （2）不惜犧牲感情與顏面，徹底改造。 （3）他自己將鞠躬盡瘁，爭取最後勝利。
蔣介石說了這番動了感情的真話，能起到籠絡人心的作用。聽他這次演講的國民黨幹部，亡命海外，同病相憐，多有落淚者。
復職以後，蔣介石急切地採取措施，安定台灣局面。在人事上，他讓陳誠代替閻錫山，出任新的行政院長，組織台灣內閣。重用美國人欣賞的吳國幀及孫立人。他復職前已任命吳國幀接替陳誠，任台灣省主席；復職後任命孫立人擔任重要的陸軍總司令一職。海軍司令不變，由桂永清擔任；空軍司令由參謀總長周至柔兼任。並發布由蔣經國擔任國防部政治部主任。功高的老將何應欽、顧祝同等均靠邊站。三軍首領年輕化，也算是蔣介石對軍隊的一項“革新”。
四月底，他還讓行政院發布緊急命令，防止官兵逃亡，規定人民出國探親遊歷，一律禁止；政府官員因公出國，須行政院審核批准。這一措施，剎住了當時台灣島上的外逃風。
在蔣介石復職前後，在經濟上也採取了一些改革措施。早在一九四九年夏秋間，當嚴家塗任台灣省財政廳長之時，將市製改為新台市，以從上海偷運來的二百萬兩庫存黃金為準備，限額發行新台幣二億元。每新台市一元合舊台市四萬元，每五元新台幣合一美元。此項市製改革，遏制了通貨膨脹，使之不演變為惡性。蔣介石還通過陳誠，在台灣實施土地改革政策。在以前，台灣佃農要繳納高達收穫量的五成至七成給地主。從一九四九年底開始，搞土地改革實行“三十七點五減租”，也就是“從佃農的收穫量中減除肥料等實際費用的百分之二十五，其餘則由地主與佃農各分百分之三十六點五的平均分配方式。”在二十年代大革命時期和抗戰初期，中共都曾促使和希望國民黨政府實行孫中山的“二五減租”政策，但都遭到蔣介石反對。亡命到台灣之後，痛定思痛，儘管為時已晚，還是實行了土地改革政策。蔣介石這些措施，對於發展台灣經濟，起到了促進的作用。
在治安方面，蔣介石的措施更為嚴厲。除了上面說的實行出入境管制，同時，禁止集會、遊行、請願、罷工、罷市、罷課，管理書刊出版。是共產黨人者當然槍斃。左傾或者有些牽連者也是長期坐牢或甚至槍斃。有“通共嫌疑”者，一律投進監獄，或用麻袋捆紮，不必經司法程序，丟到海裡，無辜受害者不計其數。台北市郊植物園附近的馬場叮，是槍斃人的刑場；在那些歲月，頻頻傳出槍斃“匪諜”的槍聲。那時的大逮捕大屠殺，令人恐怖異常。
就在蔣介石復職視事的一九五零年三月間，發生了震驚全島的台灣最大兩企業台糖、台電事件。台糖公司的總經理沈鎮南、人事室主任林良桐被槍斃，部下多人被判刑。沈鎮南之罪狀，據說是故意不出售糖，保留物資讓共黨來接收；準備以台糖鐵路供共軍登陸用。但熟悉沈鎮南總經理的人，沒有人相信他會是共產黨。台電公司總經理劉晉鈺及一個職員嚴惠先也均被槍斃。劉晉任的罪狀聞說是：（1）其於在台大因參加左傾團體被捕，劉保釋出獄後縱之赴大陸。 （2）隨翁文灝投共的台電董事長陳中熙曾經有信寫給劉。 （3）嚴惠先於大陸失守後滯留一個時期方來台，有通共嫌疑，而嚴住劉家，劉對之甚親，有以女許之的謠言。
以今日的眼光來看，台糖、台電的案件，根本還構不成什麼罪名。台灣這兩大公司的總經理們，只是被當局尋一個藉口槍斃而已。為什麼要槍斃他們？主要與他們的頂頭上司有關。當時主管民國公營事業的資源委員會正副主管翁文灝、錢昌照、孫越崎等先後投奔了大陸新中國。而台灣公營事業的主管均係翁文灝等委派，或追隨甚久，對翁、錢、孫之向心力甚強。錢昌照、孫越崎從香港起義到北京後，受到新中國重用。擔任過行政院長的翁文灝，在撤出大陸時不願跟隨蔣介石而寓居香港觀望形勢。台灣當局請翁由港來台，如不欲來台，由經濟部長劉航琛致贈美金五萬元，請翁赴法國研究及講學，以免翁文灝北上投奔新中國。翁文灝到法國，住了一年多，思鄉心切，嚮往新中國，終於葉落歸根，輾轉回到北京，受到周恩來總理等的熱烈歡迎。當時台灣當局深恐台灣公營事業的高級主管人員受錢、孫、翁等的影響，特以最大的糖、電兩企業開刀，殺雞給猴子看。
當時台灣當局還稱破獲中共地下組織，如吳石案、蔡孝乾案、《新生報》董事長李友邦案等，一九五零年上半年的《中央日報》，“匪諜×××數犯被槍決伏法”等標題，一星期要出現好幾次，連諾貝爾獎得主李政道的母親張明璋女士和兒子李崇道，因在家裡留宿一位舊時廣西大學同窗，竟然也被課以“掩護匪諜”罪投進監獄。
對大陸，蔣介石向國民黨空軍提出了“攻勢防禦”的要求，加緊了對東南沿海城市、港口和船隻的轟炸。由台灣起飛的作戰飛機到舟山群島定海機場加油後，其航程可達華東乃至武漢。在一九五零年一二月間，國民黨空軍對上海及華東沿海港口連續轟炸，以破壞大陸的國民經濟恢復，並阻撓解放軍三野部隊向華東沿海集結船隻。二月六日，在有名的對上海的“二六大轟炸”中，國民黨空軍機群分四批輪番轟炸發電設施。炸死炸傷上海市民一千四百多入，使上海電力喪失百分之九十，多數工廠停產癱瘓。使蔣介石惱火的是蘇聯空軍協防上海，斯大林在《中蘇友好同盟互助條約》簽訂後，於一九五零年二三月間派出一個空軍師到上海、徐州擔負內地防空任務。該師裝備了米格15和拉12飛機共九十九架。當時，先進的米格噴氣式飛機在上海機場出現使國民黨軍十分驚慌，國民黨空軍連續被擊落五架飛機，從此，已不大敢進入上海地區。一九五零年五月，解放軍空軍在南京組建空軍第四混成旅，終於有了一支可以配合陸軍作戰的空軍力量，五月間，可以用於侮上作戰的華東海軍第四艦隊也在上海組建，裝備了大型坦克登陸艦10艘，中型坦克登陸艦9艘。大批的船隻也在浙東、蘇南沿海集結。
蔣介石已經得到消息，解放軍三野陳毅、粟裕部隊正積極準備對舟山群島的登陸作戰。正在這時，五月一日傳來消息，林彪四野部隊已全部攻占海南島，薛岳十萬守軍只撤出三分之二。蔣介石判斷解放軍將以陸海空三軍發起對舟山群島的攻擊，其打擊力量勢必大大超過海南島作戰。國民黨部隊在舟山的守軍有十五萬人，是國民黨僅剩的陸軍部隊的三分之一，亦是蔣介石的主力部隊。如再蒙受重大損失，守衛台灣就更加困難。
五月十一日，蔣介石給在舟山的國防部副參謀總長郭寄嶠、浙江省政府主席兼舟山群島防衛部司令官石覺寫了親筆手諭，部署秘密撤退，規定“明（十二日）晚間即應開始登艦，井期於本月十五日至遲十六日上午，必須完成全部工作”。
十一日晚二十一時，蔣介石在上床睡覺之前還覺得不放心，又動筆寫了一條手諭要舟山撤退注意燈火管制：“想起各運艦燈火必須一律管制與熄滅燈光，千萬注意實施為要。”
五月十三日，舟山撤退秘密開始，守島的國民黨軍十二萬人分批登船，同時把島上兩萬多名青年男女強行拉上船運往台灣，並炸毀了島上的重要設施。花費了四千萬銀元修築的定海機場也被徹底炸毀。
五月十六日，解放軍發現國民黨從舟山撤退，立即以三個軍的部隊渡海，十六日占領了舟山本島。
海南島失守，舟山群島撤守，毛澤東的下一步棋就是進攻台灣島，台灣頓時進入戰時狀態。台灣是不是守得住？已經成為台北街頭巷尾人們議論紛紛的話題。有人說，三百年前荷蘭大鼻子都抵擋不了鄭成功的海師，從大陸潰敗下來的國民黨殘餘部隊，能夠確保台灣嗎？ ！台灣島上，沉浸著一片悲觀與惶恐的氣氛。
一九五零年的六月，國民黨進入它歷史上最危險的時刻。就是《中央日報》的社論也在大聲疾呼：“我們國家實在已到空前未有的危險時期，每個處在這個孤島上的人也已沒有什麼可以撤退和逃避的地方。”而蔣經國主持的政治部，發動各部隊歃血連盟，“誓死效忠領袖”，要做到“成功成仁誓為國死”。
蔣介石為了台灣防衛，從日本請來軍事將校一批，其中包括前日本華北派遣軍根本博中將。蔣還親自跟日本將領去澎湖察看，商討防衛計劃。
六月五日，蔣介石在“台灣保安司令部”官兵大會上宣布由吳國幀任台灣保安司令，彭孟緝任副司令。蔣在大會上向官兵們訓話，聲稱防守台灣已完成集結兵力，軍事上已無問題，關鍵在於能否維持台灣的治安，必須組織民眾肅清中共地下人員，才能守住台灣，“光復大陸”。
蔣介石接著又開殺戒，殺了幾個大人物以鎮壓人心。先以通共罪槍斃國防部參謀次長吳石中將和第四兵站總監陳寶全中將，接著，又以通共策反湯恩伯罪，判處原浙江省主席陳儀死刑，執行槍決。