1985年春，喬布斯和斯卡利之間出現了裂痕。原因是多方面的。有些只是業務上的分歧，譬如，斯卡利意圖維持麥金塔的高價來達到利潤最大化，而喬布斯則想要讓它的價格更實惠。另一些就是奇怪的心理因素，源自他們最初對彼此的狂熱和不現實的迷戀。斯卡利苦苦渴求喬布斯的喜愛，而喬布斯則渴望在斯卡利身上獲得父親和良師益友般的感覺。當兩人的熱情開始降溫時，就產生了情緒上的反彈。但是，造成兩人之間裂痕日益加深的根本原因仍在他們自己身上。
對喬布斯來說，問題在於斯卡利從來都沒有成為一個懂產品的人。他沒有努力，也沒有顯示出自己有能力理解蘋果公司所做產品的精妙之處。相反，斯卡利覺得喬布斯太過沉迷於細微的技術調整和設計細節，沒有效率。他過去做的工作是銷售汽水和零食，產品的配方在很大程度上與自己無關。他對產品也沒有天生的熱情，而這正是喬布斯所能想像的最深重的罪孽之一。 “我試圖教會他工程上的細節，”喬布斯後來回憶說，“但是，他不知道產品是怎樣創造出來的，一段時間以後，這種培養變成了爭論。但我知道，我的觀點是正確的。產品就是一切。”他覺得斯卡利很愚蠢。但斯卡利渴望得到喬布斯的喜愛，並且產生了自己和他很相似的幻覺，這更加劇了喬布斯對他的蔑視。
而斯卡利覺得問題出在喬布斯身上，當喬布斯不再處於“求愛期”或有所圖時，就常常很令人討厭、粗魯、自私並且對其他人脾氣不好。斯卡利經歷過寄宿學校和大客戶銷售工作的打磨，他覺得喬布斯的行為粗魯可鄙，這程度就和喬布斯鄙視他對產品細節缺乏激情一樣。斯卡利能和善、關切、彬彬有禮地對待錯誤，喬布斯則做不到。有一回，他們計劃與施樂公司董事會副主席比爾·格拉文（Bill Glavin）會面，斯卡利乞求喬布斯到時候不要失禮。然而，剛一就座，喬布斯就跟格拉文說：“你們這些傢伙完全不知道自己在做什麼。”會面不歡而散。 “對不起，但我控制不住自己。”喬布斯告訴斯卡利。這只是許多類似情況中的一例。正如雅達利公司的阿爾·奧爾康後來評論的，“斯卡利想讓別人高興，並會顧及人際關係。史蒂夫對此則不屑一顧。但他對產品的關注又是斯卡利永遠達不到的，而且喬布斯會侮辱任何一個算不上一流隊員的人，以避免蘋果出現太多的笨蛋。”
董事會對於兩人關係的動盪越發警覺。 1985年初，亞瑟·羅克及其他一些心懷不滿的董事對他們倆進行了嚴厲的訓誡。他們告訴斯卡利，本來應該由他來運營公司，他應該用更大的權力履行管理蘋果公司的職責，而少花些心思同喬布斯交好。他們告訴喬布斯，他應該解決麥金塔部門內部的混亂狀況，而不應該告訴別的部門如何做好本職工作。之後，喬布斯回到辦公室，在自己的電腦上打著：“我不再批評公司其他部門，我不再批評公司其他部門。”
1985年3月，麥金塔電腦的表現持續令人失望，其銷量只有預測的10%,喬布斯躲在自己的辦公室裡生氣，或是在大廳裡訓斥其他人。他的情緒起伏更大，對周圍人的辱罵也更甚。中層主管們開始起來反抗他。營銷主管邁克·默里在一個行業會議上與斯卡利私下會面。兩人走向斯卡利的酒店房間時，喬布斯看到了，於是要求一起去。默里叫他不要跟過來。默里告訴斯卡利，喬布斯正在造成嚴重的破壞，必須把他從麥金塔部門的管理層踢走。斯卡利回答說，自己還沒有到要和喬布斯攤牌的地步。默里後來直接給喬布斯發了一份備忘錄，批評他對待同事的方式，並譴責其“人身攻擊的管理方式”。
有好幾個星期的時甸，兩人之間的問題似乎存在某種解決的可能。喬布斯開始著迷於一種平板顯示屏技術，這是帕洛奧圖附近的伍德賽德設計公司（Woodside Design）研發的，管理這家設計公司的是一位名叫史蒂夫·基欽（Steve Kitchen）的古怪工程師。另一家創業公司做出的觸摸屏也讓喬布斯興致很濃，利用這種技術，用戶可以直接用手指控制設備，而無需鼠標。這兩種技術可能有助於實現喬布斯創造“Mac書”（Mac in a book）的願景。同基欽的一次散步中，在門洛帕克附近的一幢建築旁，喬布斯說道，他們可以開設一處科研基地，以實現這些想法。它可以叫蘋果實驗室（Apple Labs），由喬布斯來管理，這樣，他又能重回帶領小團隊開發偉大新產品的喜悅之中。
斯卡利對這種可能性感到高興。這將使喬布斯回到自己最擅長的領域，並且能讓他遠離庫比蒂諾，不再給公司造成破壞，從而可以解決兩人之間的大部分管理問題。他還物色了一個候選人，替代喬布斯擔任麥金塔部門的管理者：讓-路易·加西，他是蘋果公司在法國的主管，曾在喬布斯造訪法國時與之對抗。加西乘飛機前往庫比蒂諾，並表示，只要能保證自己管理整個項目而不是在喬布斯手下工作，他就會接受這份工作。董事會成員之一，梅西百貨的菲爾·施萊因竭力說服喬布斯，他如果能發明新產品並激勵一個充滿激情的小團隊會更好。但經過一番思考，喬布斯認為這並非他想走的路。他拒絕將控制權棄讓給加西，後者明智地回到了巴黎，以躲開無可避免的權力衝突。在這個春季之後的日子裡，喬布斯搖擺不定。他有時想要維護自己作為企業管理者的身份，甚至寫下備忘錄，要求取消免費飲料和頭等艙航空旅行的福利，以節省開支；有時候，他又想離開，去管理新的蘋果實驗室研發團隊。
當年3月，默里發出了另一份備忘錄，並標明“請勿流傳”，發送給了多位同事。 “過去90天裡，蘋果公司出現如此多的混亂、恐懼和運轉失常，是我在蘋果這3年裡從未見過的。”他在開頭這樣寫道，“普通員工覺得我們就是一艘沒有舵的船，在迷霧中漂流。”默里曾兩頭倒，有幾次他還與喬布斯密謀詆毀斯卡利。但是在這份備忘錄中，他把錯誤歸咎於喬布斯。 “無論公司的運轉失常是原因還是結果，史蒂夫·喬布斯現在都在掌控著一個看似堅不可摧的權力基礎。”
3月底，斯卡利終於鼓起勇氣告訴喬布斯，他應該放棄麥金塔部門的管理權。一天傍晚，他走進喬布斯的辦公室，為了讓兩人的會面更加正式，他還帶上了人力資源部經理傑伊·埃利奧特。 “沒有人比我更欽佩你的才華和遠見。”斯卡利開場道。他以前也說過這樣的奉承話，但這次，顯然後面會出現一個“但是”來打斷這些讚美。事實確實如此。 “但是，這真的行不通。”他說道。被“但是”打斷的恭維話又繼續下去。 “我們彼此之間已經發展出深厚的友誼，”他繼續說道，有些自作多情，“但是我對你管理麥金塔部門的能力失去了信心。”斯卡利還斥責喬布斯在背後說自己的壞話，把他當笨蛋。
喬布斯看上去驚呆了，說出了一句奇怪的反駁，意思是在這方面斯卡利應該多給他點兒幫助和指導。 “你得花更多時間與我相處。”他說。接著他開始回擊。他說斯卡利對電腦一無所知，管理公司一塌糊塗，並且自從斯卡利進蘋果公司以來，就不斷地令自己失望。然後，喬布斯又出現了第三個反應，他哭了起來。斯卡利則坐在那兒咬指甲。
“我會把現在的情況反映給董事會，”斯卡利說道，“我會建議他們讓你離開麥金塔部門的管理崗位。我希望你知道這些。”他力勸喬布斯不要抵抗，並同意去開發新技術與產品。
喬布斯從座位上跳了起來，轉過身來，目不轉睛地盯著斯卡利。 “我不相信你會這麼做，”他說，“如果你做了，會毀掉公司的。”
在接下來的幾個星期，喬布斯的行為出現了很大波動。他一會兒說自己要離開公司總部去管理蘋果實驗室，一會兒又開始爭取支持去推翻斯卡利。剛同斯卡利示好，轉眼又在背後大肆抨擊斯卡利，有時候這種反復會發生在同一天晚上。一天晚上9點，他打電話給蘋果公司法律總顧問阿爾·艾森斯塔特，說自己對斯卡利失去了信心，並需要艾森斯塔特的幫助來說服董事會；而兩個小時後，他又一個電話吵醒斯卡利，對他說：“你很了不起，我只想要你知道，我喜歡跟你合作。”
4月11日的董事會會議上，斯卡利正式提出，自己想要喬布斯離開麥金塔部門負責人的職位並專注於新產品開發。接著，最頑固最獨立的董事會成員亞瑟·羅克說話了。他受夠他們兩個人了：在過去一年裡，斯卡利沒膽量負責指揮管理，而喬布斯則“像個任性的小孩兒”。董事會需要替他們解決這一爭端，為此，董事會會跟他們分別進行談話。
斯卡利離開了會議室，這樣喬布斯可以先陳述。喬布斯堅持認為斯卡利才是問題所在，說斯卡利不懂電腦。羅克的回复則是對喬布斯的訓斥。他怒吼道，喬布斯這一年的所作所為很愚蠢，而且他無權管理一個部門。即便是喬布斯最堅定的支持者，梅西百貨的菲爾·施萊因，也試圖勸喬布斯優雅退位，去為公司管理研究實驗室。
輪到斯卡利單獨與董事會見面時，他發出了最後通牒。 “你們要么支持我，那我就負起掌管公司的責任；要么你們什麼都不做，再去給蘋果找一個新的CEO來。”斯卡利說，如果獲權，他不會貿然行動，但會在接下來的幾個月安撫喬布斯進入新的角色。董事會一致支持斯卡利。他有權在自己認為正確的時機將喬布斯革職。此時，喬布斯正在會議室外等著，他完全明白自己要輸了；看到老同事德爾·約克姆，喬布斯哭了起來。
董事會作出決定後，斯卡利試圖與喬布斯和解。喬布斯要求在接下來的幾個月裡慢慢過渡，斯卡利同意了。當天晚上，斯卡利的行政助理南妮特·巴克霍特（Nanette Buckhout）打電話給喬布斯，想知道他現在怎麼樣。喬布斯還待在自己的辦公室裡，精神沮喪。斯卡利已離開了，喬布斯就過來同巴克霍特交談。他對於斯卡利的態度又開始瘋狂地搖擺。 “約翰為什麼要這樣對我呢？”他說道，“他背叛了我。”然後，他又換了另一種態度，認為自己或許應該花些時間來修復同斯卡利的關係。 “約翰的友誼比任何事物都重要，我覺得自己也許應該這樣做，專注於我們的友誼。”