戴笠的一番話，使葉獨開由憂轉喜。雖然走了亞德利，但可以跟學長溫毓慶共事了，這也是他回國以來的心願之一。他當然不知道，中國幾大黑室機構的頭目，正在為即將成立的“軍事委員會技術研究所”的領導權而相互攻訐、激烈爭鬥。
原來，從1938年開始，蔣介石的機要室主任毛慶祥，打著蔣先生的旗號，在軍委會辦公廳機要室內設立密電研究組，整合當時中國幾大密碼研譯機構。他首先聘請密碼檢譯所主任溫毓慶、中統實際負責人徐恩曾。軍統二號人物鄭介民為顧問，自任研究組組長。密碼檢譯所來的霍實子為主任，中統李直峰為副主任，具體領導研究破譯。抽調密電所、中統、軍統各單位人員參與。中統局徐恩曾態度最為爽快明朗，將中統局國際密電室連經費帶器材完全合併到軍委會密電研究組。其他兩個單位則像徵性地派幾個人應付。
中統人多勢眾，毛慶祥又身兼數職無暇顧及，這個以集中力量減少內耗為目的的密電研究組，很快成了中統派徐恩曾、李直峰的天下。各派陽奉陰違、相互防備、出工不出力，所以這個機構成立兩年竟然一無所成。
毛慶祥又施一計，向蔣介石上了一份簽呈。指出目前的局面人力物力分散，不利於對日密電的深入研究，建議這類機構合併集中，籌組一個新的機構——軍委會技術研究室，統一領導和管理黑室事務。蔣介石很快批准了這一建議，確定溫毓慶為技術研究室中將主任，毛慶祥、軍統的魏大銘、中統的李直峰為副主任，毛慶祥兼主任秘書，具體負責人事和日常工作。
戴笠和徐恩曾都不甘心毛慶祥大權獨攬，被中央收了這塊出功績的自留地，便唆使兩個副主任魏大銘和李直峰找溫毓慶訴苦，理由是擔心外行領導內行不利於工作。書生意氣的溫毓慶哪懂這些伎倆，果然中招，三人一拍即合，聯手打壓毛慶祥，以專家主政更有利於提高密電偵研的效率和水平為由，聯名上書蔣介石。
1940年4月1日，軍事委員會技術研究室在重慶正式成立，原密碼檢譯所、軍統局密電組、交通部研究組、軍委會辦公廳機要室研究組等各機構人員、電台和其他設備資料，全部歸併到技術研究室。毛慶樣獨攬大權的目的沒有達到，倒是溫毓慶漁人得利撿了個便宜。他匆匆從桂林趕到重慶赴任，葉獨開才有機會在回國兩年多之後，第一次拜見他。
溫毓慶熱情地到辦公室門口迎接這個軍統部下。他還是老樣子，細高個，瘦長臉，一口廣東口音；風度翩翩、洋派十足、英俊瀟灑、文質彬彬。不像大權在握的黑室首腦，倒像一個學貫中西的大學者。他跟葉獨開客氣地握手、倒茶，公事公辦地稱讚葉獨開破譯空軍密碼的成績。
“多謝主任誇獎！”葉獨開謙遜了一番，反問道，“聽說密碼檢譯所破外交密碼成績突出，不知是如何著手的？”溫毓慶笑而不答，令人尷尬的冷場之後，才沒話找話地談起了天氣：“怎麼樣，你是東北人，適應重慶的天氣了嗎？”他連連抱怨重慶陰沉、潮濕的氣候，“這不，剛來十幾天，我的滌蟲病就犯了，真受不了！”
看來溫毓慶因在上海時有萬馨、陳榮光打入內部的前車之鑑，對已經加入軍統的葉獨開不但不敢信任，甚至開始嚴加防範起來了。葉獨開心裡暗自感嘆了一回，陪他寒暄了幾句，便告辭出來。
“談得怎麼樣？”葉獨開剛走到樓梯口，魏大銘從天而降般出現在他面前。
“沒什麼。”葉獨開淡淡地說，“老朋友嘛，於情於理自然要拜見一下的。”
“呵呵，你這老朋友太不夠朋友，一闊臉就變，是吧？知道嗎？他有大麻煩了。”魏大銘看看四周無人，才壓低聲音說，“貪污經費。密碼檢譯所每月結餘一萬多元，全部進了他的私囊。這還不算，他還把密碼檢譯所破譯的日本重要情報，高價秘密售給英國特務。團體已經掌握了鐵證，正要報請逮捕法辦。你們是老朋友，我送你這個人情，自己斟酌著辦吧。”
望著魏大銘遠去的背影，葉獨開沉思了片刻，毅然轉身向樓上走去。
聽完葉獨開的陳述，溫毓慶一張精緻的白臉漲得通紅：“逼人太甚，逼人太甚！告訴戴笠，我意只在研究，不在官位名利，不然也不會把機構拉到重慶。罷了罷了！”他長嘆一口氣，氣惱地說，“我還是走吧，去香港治我的滌蟲病。這個攤子就讓魏大銘去打理好了！”他垂頭喪氣地靠在椅背上，不再理睬葉獨開。
溫毓慶來也匆匆，去也匆匆，這一赴港治病就杳如黃鶴，一去不復返。原來他已經負氣從香港出走，投奔遠在美國主政援華辦事處工作的老上司宋子文去了。