我國古代圍棋制度，歷代都有一些變革。如漢、魏、南北朝時，棋局由縱橫各17道逐漸演變，最後統一為19道。而在西漢以前又經歷了由11道、13道、15道而17道棋盤的變革，這些在上節古代圍棋盤的變革中已有交代，這裡僅就棋子形狀、先後走的規定、結局的勝負計算方法等方面，簡要介紹圍棋棋制的沿革。
漢時，圍棋用木頭做成棋子，所謂“斷木為棋”。當時棋子形狀是方形的。後來，覺得木質棋子質輕，落子輕飄不穩，就改用小石子做棋子，於是棋字寫成“石”旁，成了“碁”字。考古學家從安徽亳縣元寶坑東漢墓中出土石質圍棋子117粒。棋子11.5毫米見方，厚三毫米，有粉綠色和墨綠色兩種，說明我國漢魏時期的圍棋子是石質方形的。唐宋時期，圍棋子已由方形改成圓形。如江蘇丹陽出土了黑白圓形棋子83枚，淮安宋代楊公佐墓出土黑白圓形石棋子50枚，安徽亳縣宋墓也出土了圓形石質圍棋子等，都說明了這一變化。
我國現代圍棋，規定黑棋先走，白棋后走。但古代棋制與此相反，規定白先黑後。只有在讓先時，被讓棋者持黑棋先走。從古譜中看，白先或黑先，相當紊亂，並無明確規定。明末國手蘇亦瞻在《弈藪·凡例》中，提出一律改為白先。後來編寫的圍棋譜據此均統一為白先。日本的近代圍棋制度明確規定黑先白後。中華人民共和國成立後，我國為便於開展圍棋的國際交往活動，與日本棋制取得統一，從1956年起才由白先黑後改為黑先白後。
圍棋的勝負計算，我國古代有過兩次重大改革。唐宋時用的是填目數空法，所謂“填路法”，與今日日本的數空法類似。到了明清之際，填路法棄而不用，改為數一邊的實子，同時根據塊頭的多少退子，那一邊的塊頭數越多，退子也越多。一般每多一塊退一子。這從《金瓶梅詞話》第五十四回中的敘述可得到證明：
“……於是填完了官著，就數起來，白來創作五塊棋，常峙節只得兩塊，白來創又該找常峙節三子，口裡說，輸在這三著了！連忙數自家棋子，輸了五個子。”