兩晉南北朝時期，雖然處在社會比較動蕩的時代，但是圖書著作的內容範圍比以前擴大了，數量也增多了。經學、玄學、史學、文學、佛學等學科發展的消長，帶來了圖書數量和結構的劇烈變化。
首先，歷史和地理著作大大超過了前代。漢代《七略》沒有設立歷史書籍一類，僅收於“六藝略”的春秋類中。東漢以前歷史、地理方面的書籍增多了。兩晉時荀勖整理藏書，將圖書分為甲、乙、丙、丁四大部類，其中丙部就是獨立的歷史類(包括地志)。這時期出現的歷史和地理著作有：晉陳壽的《三國志》、宋范曄的《後漢書》、梁沈約的《宋書》、梁蕭子顯的《南齊書》、北齊魏收的《魏書》以及《晉太康三年地志》、《地記》、《週地圖記》等。這一時期，私家修史之風很盛，先後出現史書近一百多種，儘管大部分已散失，但是對我國歷史文化的貢獻很大。
第二，別集與總集大量產生。別集是指總匯一個人多種著作的書，也稱文集。總集是指匯總多人著作為一書。東漢以前沒有個人文集，當時文學著作都以單篇流傳。到東漢時才出現，魏晉以後逐步增多。最早的是西晉摯虞的《文章流別集》，這是選編“總集”的最初嘗試，到了南朝蕭樑時期，出現了《文選》、《玉台新詠》這兩部重要的文學總集。
《文選》是梁武帝的長子蕭統(昭明太子)選編的，又稱《昭明文選》。 《文選》原書三十卷，唐朝李善作注時分為六十卷。全書選錄了從先秦到梁各種體裁、風格的優秀詩文作品。 《文選》對後世文學的影響很大。 《玉台新詠》是徐陵(507～583)選編的，書成於梁代。 《古詩為焦仲卿妻作》(《孔雀東南飛》)就是通過它保存下來的。
《昭明文選》書影
第三，文學批評著作開始出現。西晉文學家陸機的《文賦》是古代極為重要的文學論文。 《文賦》以賦的體裁來論述文學創作。文中所涉及的意和辭的關係，以及對構思、感興、獨創和文章弊病等的認識都是很有見地的，對文體、風格的分析簡明扼要。劉勰的是一部文學批評理論專著。幾乎涉及了文學中所有的問題，如對文藝與社會政治的關係、創作思想、文體、文藝批評的原則等都有所討論，是我國古代文學理論的大總結。南朝梁文學批評家鍾嶸的《詩品》則是論詩的巨著，作為一部專門評論詩歌的文學批評名著，鍾嶸借用東漢以來品評人物的辦法來品評詩歌，對漢魏以來的五言詩作了總結。
第四，出現了許多科學技術方面的著作。在南朝宋、齊時，我國出現了一個偉大的科學家祖沖之。他在天文、曆法、機械等方面都作出過傑出貢獻。他是第一個把圓周率π精確到七位小數的人，還註釋過《九章算經》，編過一本《綴術》。 《綴術》在唐代被定為數學課的主要教科書。 《齊民要術》是我國一部重要的農業科學著作，作者是賈思勰。書中記載了自西周以來，特別是當時我國黃河中下游一帶農業生產的經驗，介紹了耕田、播種的方法，穀物、蔬菜、果樹和樹木的栽培方法，家畜、家禽和魚類的飼養方法，食品的製造方法等，是一部系統論述農業科學的專著，直到今天仍是研究農業科學史的寶貴資料。另外，《水經註》是北魏時期另一部有關我國古代以全國水道為綱的地理方面的科學著作。
第五，語言文字學方面的著作增多了。有魏李登的《聲類》和梁沈約的《四聲譜》，它們是音韻學研究的重要成果。
第六，哲學思想方面有了更大的發展，產生了魏王弼的《老子注》、晉郭象《莊子注》、梁范縝的《神滅論》等重要的哲學著作。其中范縝的《神滅論》是我國古代一部唯物主義思想的傑作。
《昭明文選》書影