告別瀛海威的張樹新轉型為三個角色：風險投資人、互聯網思考者和NGO活動家。
她創辦了聯和運通控股有限公司，在江蘇、北京等地投資多家信息、廣告、置地及顧問公司。在生意之外，她投入大量精力於“互聯網與中國社會”這一命題，組織了一個跨學科的專家小組，從哲學、傳播學、社會學及新技術等多個角度展開研究，並出版了系列圖書。有人認為她是當今中國對互聯網思考最深刻的人士之一。
此外，她還是阿拉善SEE生態協會的發起人之一，在社會公益事業上十分活躍。
張樹新似乎不願意人們老是將她與瀛海威聯繫在一起，在一次大學演講時，她說：“長久以來，公眾對於瀛海威的感情顯然比我還深。”2001年6月，新浪網的創辦人王志東被董事會免職，成為中國互聯網繼瀛海威事件後最大的一起人事風波，張樹新評論說：“出局是好事，不然就變成雞肋了。一下子什麼都沒有了，才會有機會。”