清人入關後，明代士大夫激烈反抗，尤其以江南一帶最盛。當時清人武力不足，對漢人初甚寬容，即容許開科取士，並開放政權，對傳統漢人之政制接納讓步。
首先，北方之士大夫與清政府妥協。但清政府頗用手段，一面照舊制保持漢人習俗，一面嚴行剃髮令，要漢人文化上屈服。在清軍高壓政策下，漢人不得不屈服，而南方士人反抗之心仍較烈。但為了應舉做官，不陷入耕農經商之窮途，則唯有與清政府妥協，參加科舉。而明末遺民，不屈服於清代科舉者，則有如下幾項出路，如：方密之之出家，呂晚村之行醫，孫夏峰、顏習齋、張楊園之務農，張楊園之設處館講學，李二曲、王船山之隱居，劉繼莊、李恕谷之擔任遊幕以及顧亭林、呂晚村之經商等。明末遺老們不願轉職者，則致力於學術文化工作，他們為了反清復明，竟有主張恢復封建者，蓋有封建，便會有大門第，便容易在社會分裂情況下推翻舊制度。士大夫之篤實學風與堅貞志氣保持數百年之久直至清末。此股力量，使清以武力奪得政權以後，不得不考慮應維護人心之安定。
於是清政府一面解放其政權，一面盡量推行漢化。此點於清初康熙帝尤為用力。
康熙由青年時勤學以致咳血而仍不放棄苦讀，即使三藩亂起，仍勤讀不輟，終於到達無不通曉之境地。而在委曲求全下之中國士人，亦以明末遺民為榜樣，因此在參與吏治方面亦甚用心而踏實，遂使清初政況稍勝於明代中葉。
清初以來，反抗清政權較烈的江浙一帶，因鄙視清政權而影響及於輕視科舉制。
當時江浙士人以不應科舉之家傳經訓為最有聲望，最有骨氣。
當時清代只有官辦的書院收買貧苦之士人，如當時有名儒如全祖望、錢大昕、李兆濟等，無志仕途，則唯有入書院講學以維生。
當時江浙地區較其他省份富庶，因此藏書亦多於他省，如乾隆朝之《四庫全書》共七套，內廷佔四套，而江浙佔三套，存於揚州、鎮江及杭州各一套。可見江浙之學術氣氛較他省為高。故江浙考證漢學之風在抗異族抗現實之情況下，始終持之不衰，不過卻由愛好民族文化轉變為純學術之探討，而脫離了現實。