第二天早朝，沒待皇上問話，恆春就當先把一個折子遞上去。
咸豐帝展開折子看了一遍，忽然問跪著候旨的恆春：“恆春哪，照你說來，琦善還是不服氣。不過，你讓朕撤換主審大員，朕可不能答應，你是刑部尚書啊！”
恆春低頭回答：“回皇上的話，奴才近日頭昏腦漲，實在是不堪繁劇呀！”
咸豐帝把頭往上抬了抬，忽然道：“穆彰阿呀，琦善這件事你看怎麼辦好啊？”
穆彰阿出班奏道：“回皇上話，奴才昨日監審，看琦善的樣子，好像的確有些冤情。奴才以為，不召回寧夏將軍薩迎阿，事情不能水落石出，請皇上明察。”
“嗯……”咸豐帝沉吟了許久，說一句，“你們兩個先退下吧。”把兩眼掃向眾大臣：“你們都是怎麼看的呀，只能召回薩迎阿了？”見兩班沉默不語，又加問一句：“你們怎麼不講話呀？”
曾國藩見王公大臣們都把頭低下故作耳聾狀，只好出班奏道：“啟禀皇上，微臣以為千萬不可召薩迎阿回朝！”
咸豐帝一愣，反問：“曾國藩哪，你說說，怎麼不可以召薩迎阿回朝啊？”
曾國藩大聲道：“皇上聖明，新疆事急，臣想那薩迎阿剿匪正酣，如此時被召回，不止前功盡棄，勢必要釀成新疆大亂！廣西的亂子已鬧得夠大了，新疆、寧夏、甘肅等偏遠地區是怎麼也不能再出亂子了啊！請皇上明察。”
咸豐帝點了點頭，接著反問道：“可琦善不認罪伏法呀？薩迎阿已奉朕的旨意查明琦善確曾濫殺無辜，可琦善卻一口咬定薩迎阿是栽贓陷害！”
曾國藩答道：“禀皇上，依微臣想來，押琦善進京的兵丁必然知道內情，問他們和召回薩迎阿有異曲同工之妙！請皇上明察。”
咸豐帝擺擺手：“你下去吧。杜師傅啊，你認為呢？”
杜受田出班奏道：“回皇上話，老臣以《四書》《五經》為主課，於刑律不甚精通，老臣不敢妄言。請皇上明察。”
幾名大學士都開始摀嘴笑，杜受田答非所問。
穆彰阿一步搶出來奏道：“禀皇上，奴才深知，杜大人學貫古今！奴才向皇上舉薦，琦善一案，非大德大才之人不能主審，杜大人做主審官最合適不過！請皇上恩准。”
杜受田急忙抬高音量，大叫：“皇上聖明，老臣昨夜思慮了許久，老臣以為琦善有爵位在身，由刑部主審不合情理，該由吏部主審。”
吏部和戶部是大學士穆彰阿的管理範圍。
咸豐帝愣了半晌，問杜受田：“杜師傅，琦善已被革職你不知道嗎？”杜受田不敢言語。
穆彰阿這時卻道：“啟禀皇上，杜大人飽讀詩書，卻講出如此不倫不類的渾話。奴才懇求皇上，將滿嘴胡言亂語的杜受田開缺回籍，永不敘用！”
咸豐帝卻不耐煩地攔住話頭道：“好了，你們都下去吧，朕再斟酎斟酎。”眾王公大臣跪安，依次魚貫退出。內閣學士肅順卻被當值太監召進御書房。
曾國藩回到禮部辦事房不久，咸豐帝聖諭便下到禮部：“著曾國藩即日起兼署刑部右侍郎，望該侍郎忠誠為國，一心為公。欽此。”
曾國藩此時的職銜與署銜有：實授禮部右侍郎，署兵部侍郎，署工部侍郎，署刑部侍郎。
到了午後，曾國藩依老例到勤政殿具折謝恩，得蒙召見。
咸豐帝一個人在空蕩蕩的大殿裡一瘸一拐地走來走去，幾名當值的太監規規矩矩地在四周站著。
曾國藩謝恩畢。
咸豐帝嘆一口氣道：“曾國藩哪，朕讓你兼署刑部侍郎，是想讓你主審琦善。你說的有些道理，薩迎阿這個時節怎麼能離開新疆呢？曾國藩啊，明天就重新審琦善吧！”
曾國藩低頭答道：“回皇上話，微臣不敢接旨！”
“怎麼……”咸豐帝立住腳不動。
曾國藩道：“皇上聖明，琦善雖被革職，但爵位尚在。恆大人官居一品，琦善尚不把他放在眼裡，微臣一介侍郎，如何審得了侯爺！”
咸豐帝怒道：“朕下特旨審他，如何就審不了他！他難道還敢造反不成？”
曾國藩道：“皇上聖明，按我大清官制，公、侯犯法，只能由皇上欽判，或革職，或流放，或殺頭，請皇上明察。”
咸豐帝道：“王子犯法，與庶民同罪；刑部能管得民，就能管得官，就能管得公、侯！曾國藩哪，你是先皇比較倚重的老臣，朕交辦的事，你就辦。”
曾國藩邊磕頭邊道：“禀皇上，臣不敢抗旨不遵。但臣以為，皇上對琦善，完全可以依老例。如證據確鑿，或革職、或充軍，下道諭旨就行了，何必非要三法司會審不可呢？”
咸豐帝想了想道：“琦善祖輩有功於大清，琦善也是本朝的老臣。像他這種年紀又有爵位的人，早該回京享清福了！可琦善仍然替朕鎮守著邊關。像這樣的享大位有大功的人，只憑朕的一旨決斷，不是太草率了嗎？你領旨謝恩吧。”
曾國藩大聲道：“謝皇上！微臣還有話說。”
咸豐帝道：“你講吧。”
曾國藩道：“皇上讓微臣審琦善，臣遵旨，但須請皇上格外開恩。明日微臣在刑部大堂主審琦善，請皇上賞恩，臣請借皇冠一用。只要皇冠供奉在大堂，就等於聖上在側為微臣壯膽。請皇上明察。”
咸豐帝沉吟了一下道：“朕明日早朝過後，即著人將皇冠送到刑部大堂。你跪安吧。”
曾國藩退出大殿，徑直來到刑部。依老例，他要向恆春請安，要和刑部的侍郎以下官員見面。
恆春此時偏偏沒在刑部，到軍機處去找穆彰阿辦私事去了。
曾國藩和刑部的官員見了禮，當值的官員熱情地領著曾國藩到各辦事房轉了轉。
在刑部侍郎辦事房，曾國藩品了口當值郎中李文安端上來的茶水，忽然道：“李大人，琦善現在押在刑部大牢，不知押解他的解差在哪裡？”
李文安恭恭敬敬答道：“回大人話，押解琦善的解差共是十二名，現在兵部京師驛站歇息；拿到刑部回文，他們才能迴轉復命。”
曾國藩“嗯”了一聲，沉思了一會兒道：“煩李大人開張火票去兵部驛站，傳那十二名解差來刑部一趟，本部堂有幾句話要問他們。”
李文安道：“下官這就去辦，請大人稍候。”
過了兩刻光景，李文安帶著十二名解差依次走進來。
眾解差一見曾國藩的紅頂戴，就一齊行禮問安。
李文安這時道：“大人但請問話，下官先行告退。”便退出去，到自己的郎中辦事房去喝茶。
曾國藩笑著道：“本部堂傳幾位來，是想問幾句話，望實話實說，不得有半點隱瞞！琦善是如何革職的？薩軍門是如何奉旨查辦的？請幾位複述一遍。”
一名解差大聲道：“琦善本是去圍剿薩拉回匪，卻險些被薩拉圍剿，於是就拿其他部落的回民出氣，一下子就殺了上千人！回民們如何咽得下這口冤氣？就寫了聯名狀子，告到寧夏將軍府。可薩將軍本是受琦善節制的，如何敢管這事兒？只好用八百里快騎傳遞進京。”曾國藩靜靜地問：“你們幾位原在總督衙門供差還是在將軍府供差？”
有六名解差道：“我們幾個是督標的人，他們幾個是軍標的人。琦善剿薩拉因準備不足確是吃了敗仗，而殺無辜的回民確是打了勝仗，還從各回民部落掠獲了上萬隻羊、幾百頭牛，全軍吃了三天的羊肉和牛肉也是真的。”
另外六人道：“薩將軍接護陝甘總督關防那天，怕琦善回京翻供，就從督標營和將軍營各撥了六名解差，說是到了關鍵時刻，也可做個活見證。”
曾國藩在心裡讚歎一句：好個心細的薩迎阿！沉思了片刻，曾國藩道：“明日公審琦善，還要勞幾位當堂出證。你們督標來的幾位，可會怕他？”
六個人一齊道：“一個革職的總督怕他作甚！”
曾國藩道：“琦善雖被革職爵位尚在，他可是一等侯爵啊！比總督的品級都大呀！”
一個高個子笑道：“咱一個兵丁供大人們差遣的人，有什麼可怕的呢？何況咱是給皇上當的差，又不是誰的家奴。”
曾國藩站起身道：“好，各位先回驛站歇息，明日需要各位的時候，自會傳喚你們。”
解差們走後，曾國藩把解差們的證言整理了一下，便讓李文安拿到兵部驛站找十二名解差挨個畫了押。
李文安回來後，曾國藩把畫過押的證言袖起來，這才乘轎回府。
是夜月明星稀，朔風驟起，氣溫陡然下降，為歷年來最低；太僕寺的皇家馬場，一夜凍傷差官四人、凍死戰馬五六十匹，時人稱奇。莫不是琦善位列公侯，不應該在刑部大堂公審？咸豐帝這次做錯了？
這一天早朝，眾王公大臣雖被召進大殿，但咸豐帝卻還沒到，曾國藩見幾名大學士湊在一處悄悄地在議論什麼。從幾位大學士的臉部表情看，肅穆里透著詭秘，悲哀裡透著膽怯，好像又有一件什麼大事情發生了。
咸豐帝紅腫著眼睛走進來，王公大臣們一齊跪倒請安，誰也不敢抬頭。咸豐帝冷漠地坐下，擺擺手，口諭平身。
文武大臣都爬起來，互相看看，誰也沒言語。
咸豐帝愣了許久，終於嘆口氣道：“朕昨晚收到週天爵由廣西巡撫衙門發來的折子，稱廣西會匪洪秀全於昨天公開宣布成立太平天國，自封天王，另立朝廷。廣西除省府桂林尚安穩外，各州縣已無一處完整。廣西已鬧到這個樣子，林則徐怎麼還沒有一點消息？穆彰阿呀，下朝後，軍機處用八百里快騎給福建發個兵部火票。廣西不能一誤再誤了！”穆彰阿答應一聲“奴才下去就辦”。
當值御前太監這時宣布聖諭：琦善一案，著禮部右侍郎、署兵部侍郎、署工部侍郎、署刑部侍郎曾國藩牽頭主審，監審為大學士祁寯藻、文慶，副主審是刑部尚書恒春、都察院左都御史花沙納、內閣學士兼署禮部侍郎肅順及大理寺卿倭仁。各部、院侍郎以上官員陪審。
祁寯藻此時是體仁閣大學士署禮部尚書，是道光帝年間的重臣。