劉錦棠返回古城大營三日後，金順所部人馬便移駐阜康城。
當日晚，在劉錦棠的反复勸說下，兩部人馬突然對古牧地的外圍黃田發起攻擊。經一夜激戰，將阿古柏守軍全線擊潰，首戰告捷。
收復黃田的當日，劉錦棠委員辦理黃田善後，自己親統各營和金順五營馬隊，直奔古牧地，搶在阿古柏援軍來到之前，將毫無戒備的古牧地一舉收復，旋回殲阿古柏派來的援軍，來了個以逸待勞，打亂了阿古柏的全盤防守計劃，掌握了戰爭的主動權。古牧地守將王治、金中萬雙雙戰死，殘部逃往南疆。
收復古牧地之後，金順統自己所部人馬到城東駐紮，老湘各營則到城西安營，劉錦棠親統親兵五營住城內料理善後。劉錦棠將自己的行轅設在王治、金中萬生前的辦事衙門裡。
當日晚飯後，劉錦棠先將攻克古牧地的捷報派快馬送走，然後便開始清理王治、金中萬未及燒毀的一些函牘、公文。
清理中，劉錦棠發現了一封王治、金中萬二人聯名向烏魯木齊求救的信件一封，上有烏魯木齊守城頭目馬人得的批复。劉錦棠把這封信拿到燈前，細細看馬人得的批复。
馬人得在這封信的空白處批了這樣一行蠅頭小字：“烏城精壯已悉數遣來，現在三城防守乏人，南疆之兵不能速至，爾等可守則守，否則退回烏城，並力固守亦可。”
劉錦棠推斷馬人得批復中的三城當指烏魯木齊、迪化州城及妥明所住的王城，而南疆之兵，不言而喻，指的是阿古柏的嫡系軍隊。
劉錦棠把馬人得的批复看了又看，料定都是真話，於是傳人備馬，他要連夜去見金順。
金順把馬人得的批复讀過一遍後，沉吟道：“老哥料定，這是馬人得這個老犢子使的一個奸計，誘我兵髮烏城，他好埋伏人馬在半路截殺，這斷不會錯。毅齋老弟，我們不能上這個當！何況，進攻古牧地之初，左爵相就已有話過來，收復古牧地之後，不可貿然前進，一定要等他老的回文到後再定進止。關外非比內地，每前進一步，都要慎之又慎，不可稍涉大意。”
劉錦棠見金順說得入情入理，何況左宗棠也的確在官軍進攻古牧地之前，說過不可貿然前進的話，就苦笑一聲道：“回頭細細想來，都帥所言也的確在情在理。古牧地已僥倖成功，烏魯木齊豈能便輕易攻取？”劉錦棠辭別金順回城，腦海裡卻仍在反复咀嚼馬人得的批复。
他連夜把十幾名古牧地投降過來的軍兵召集到一起，讓他們辨認馬人得的筆跡，以防當真有詐。
其中一人看了半晌說道：“禀大人，馬人得的筆跡，小人沒有見過，但安集延人的字，小人卻是見過的，他們寫不出這麼好看的字，這或許當真就是馬人得寫上去的。”
劉錦棠打發降兵去後，他一個人又對馬人得的批复看了又看，越看越覺著馬人得沒有偽造此批复的必要。
劉錦棠至此已經敢肯定，馬人得的批復是真的，不僅烏魯木齊防守空虛，連迪化州城及王城的防守，也是極度空虛的，這個千載難逢的好機會，不可錯過。
當時已是夜半，各營因連日作戰，均已熄燈安歇。
但劉錦棠仍把門外當值的侍衛傳進房裡，吩咐道：“你持本官令牌，速到城西傳命老湘各營，明日三更起灶，四更開拔，各營不得有誤，違者按營規處治——去吧！”
侍衛去後，劉錦棠又提筆給金順書函一封，通報老湘各營開拔情況，希望金順在老湘營離開古牧地後，也率部跟進，作為偏師，一為接應，一為助攻烏城。
軍機稍縱即逝，劉錦棠顧不得再照顧金順的顏面了。
金順第二日見到劉錦棠信時，老湘軍除留兩營防守古牧地外，各營已於一個時辰前全部離去。金順無奈，只好一面緊急派快馬向左宗棠通報情況，一面也傳命拔營，快速跟進。
左宗棠接到金順的禀報，頓足道：“毅齋如此性急，這不是要誤事嗎？大軍孤懸塞外，一旦有失，不是前功盡棄嗎？這可如何是好啊！”
劉錦棠率所部向烏魯木齊飛趕的時候，馬人得卻正在烏魯木齊城中的大帥府裡，和屬下各將商量防守的事。
當時，城中只有五千人馬，其中兩千是阿古柏的嫡系（安集延人），兩千是馬人得的嫡系（當地回兵），另有一千是原來的守軍。
這時是早餐過後，馬人得對著屬將們說道：“多年的戰爭經驗告訴本老爺，古牧地一戰，劉錦棠小魔鬼元氣大傷，他已喪失了攻打烏城的能力！各位請看……”
馬人得順桌上舉起一封信道：“今兒一早，本老爺就收到了畢條勒特汗陛下的聖諭。特汗對本老爺說，他受神靈的暗示，已調五千精騎趕往這裡，大概午時就能到達。”
屬將們一聽這話，對著阿古柏的聖諭不得不跪下去，一人極其虔誠地說道：“英明的畢條勒特大汗，您調來的五千精騎，就是五千隻雄鷹，它會吸乾劉錦棠小魔鬼的鮮血，它會讓金順這個老魔鬼葬身沙海。馬元帥，我們見了大汗的聖諭，終於明白了一個道理：我們雖然失去了古牧地，但我們卻掌握了勝利。這是英明的畢條勒特大汗早就擺好的一步棋。馬元帥，您難道沒有同感嗎？”
馬人得示意屬將們起身，然後說道：“我們都是哲德沙爾國的子民，戰無不勝的畢條勒特大汗，是不會撇下我們不管的。為了歡迎從南疆飛過來的五千隻雄鷹，本老爺已讓大阿訇宰殺了二十隻肥羊。”
一名安集延首領笑著接口道：“在浩罕的時候，有人就曾經提示過我，美麗的姑娘能讓一具乾屍充滿活力。馬帥，我的話您聽懂了嗎？”
馬人得笑著搖頭說道：“英雄的懷裡有了美女，英雄就會把戰場擺在姑娘的肚皮上。為了讓大清國的人馬盡快滾出哲德沙爾汗國，我們眼下，只能為南疆飛過來的雄鷹，準備肥美的羊肉和甘甜的馬奶。”
屬將們未及講話，一名侍從慌慌張張地闖進來禀道：“禀馬元帥大人閣下，城頭瞭望台傳來了消息，城北起了濃煙，這股濃煙正向這裡狂刮過來。”
馬人得一愣，隨即撲通跪倒，舉起雙手道：“戰無不勝的畢條勒特汗萬歲呀，難道是您派過來的五千雄鷹到了嗎？”
馬人得話畢，帶著屬將們便來到城頭之上的瞭望台，伸長脖頸向遠處張望。但見烏魯木齊正北一帶地方，彷彿在天邊，又彷佛百里左右，揚起老大一團沙塵，分明有千軍萬馬向這里疾奔。
馬人得內心一陣狂喜，不由自言自語道：“偉大的畢條勒特汗啊，您派來的雄鷹，就要飛到這裡了！”
一名屬將卻大叫道：“不對！烏城正北，是劉錦棠小魔鬼剛剛奪去的古牧地，畢條勒特汗的雄鷹，只能從南面飛過來，不會從古牧地飛過來！”
馬人得一聽這話，臉色頓變。他一邊往瞭望台下走，一邊果斷地說道：“我們必須集中優勢兵力，才能化險為夷。我們把所有兵力，都集中到迪化州城，那里城牆高厚，彈藥充足。那裡原有守軍三千，我們過去以後便是八千，再加上畢條勒特汗陛下派過來的五千雄鷹，迪化州城的守軍將過萬。我敢肯定，迪化州城的城垣之下，將會成為劉錦棠、金順二魔鬼的墓地！”
馬人得很快傳令下去，命城內守軍快速打點行裝，並集結牛羊、駱駝，又將糧草裝運上車，準備棄城南逃。
城中百姓見軍兵瘋狂掠搶每戶的牛羊、糧食，連年輕的男人和女人也不放過，便知官軍離此不遠了，就紛紛趁亂出城，迎著塵煙，去向官軍報告馬人得欲棄城逃跑的消息。
當地百姓累年受這些侵略者的欺凌，已經恨透了他們。劉錦棠率軍來到距烏魯木齊約有十餘里處，便得到了烏魯木齊守敵正要棄城南逃的消息。
劉錦棠當機立斷，命餘虎恩率騎兵三營、譚拔萃率步兵四營，由左路追擊；命黃萬鵬率騎兵一部、譚上連率步兵四營，由右路追擊；命譚慎典等率步兵三營，向烏城疾進，務期搶在守敵逃跑之前將城池包圍。
軍令下達，一時濃煙滾滾，馬蹄疾馳，大小龍旗遮天蔽日，甚為壯觀。馬人得率五千人馬，押運著大批的牛羊、糧草，脅裹了兩千餘當地青壯百姓，其中有近千名年輕女子，倉皇出城潰逃，直奔迪化州城。
馬人得率眾剛至迪化州城城垣，尚未進城，餘虎恩、譚拔萃二將率騎兵營緊跟著就到了。馬人得見官軍勇猛，不敢進城，帶著部眾轉奔王城，因過於匆忙，大批的牛羊、糧草以及脅裹在軍中的男女百姓，俱被官軍截獲。
馬人得只顧逃命，不再顧及其他。迪化州城守敵見官軍突至，慌忙打出白旗一面，餘虎恩、譚拔萃二將順利收復城池。
幾乎與此同時，王城被黃萬鵬、譚上連收復。王城守將妥明投降。馬人得一見形勢不妙，帶著人馬轉頭便向南疆達坂一帶狂奔，中途儘管遇著阿古柏派來的五千精騎，但仍不敢回頭來戰，一路向南疾進。
捷報由劉錦棠大營飛速遞往肅州。左宗棠接報大喜，一面上折為劉錦棠、金順等人請功，一面連夜致函劉錦棠。
左宗棠函稱：“接閱尊處兩捷報，兩覆堅巢，兩下堅城，摧朽拉枯，莫喻其易，軍威之盛，近無倫比。拊髀稱快，遐爾攸同。”
左宗棠又說：“然非將新復之區一一經畫週妥，可守可戰，務期久遠，則亦未可恃以為安。”
顯然，左宗棠此時已不再擔心戰事能否順遂，卻在擔心克復城郭後的善後等事能否料理妥當。
從收復古牧地到連克烏魯木齊、迪化州城及偽王城，劉錦棠只用了兩天的時間，創造了晚清軍事史上的一個奇蹟，中外無不驚詫。
自古兵事大家，不僅要會用兵，更要會用將。左宗棠把劉錦棠推到關外最高指揮官的位置，可謂知人善任。
不久，阿古柏在北疆佔據的最後一個堡壘瑪納斯北城被收復。
至此，北疆各城除伊犁外全部克復。
劉錦棠一面傳令各路官軍迅速籌糧，作短期休整，一面將結果報給左宗棠。
左宗棠接報大悅，仰天祈曰：“多虧毅齋臨機果斷！若按老夫與之原定穩紮穩打之方針，各軍定然陷入困頓之中而無端延長功期耳！毅齋敢否老夫之略，此天佑我大清也！”
左宗棠一面連夜拜折為劉錦棠、金順等人請功，一面飛檄劉錦棠，命劉錦棠務期將殘匪清剿乾淨後方可南下，萬不能操之過急，導致全軍功虧一簣。左宗棠同時又飭張曜和徐佔彪二將，命其率所部，按劉錦棠號令穩步搜索西趨，先期穩定北疆局勢。
左宗棠在檄飭中，再次飭命各路人馬：“因張曜、徐佔彪兩軍防所距離吐魯番道路迂直、險夷不一，程途遠近攸分，應各確計日期，以為啟行先後之準；其師期悉由劉錦棠酌定。”檄飭最後寫道：“庶彼此進止合度，不致先後參差，協力並規，公期週妥。”
左宗棠拜折的同時，亦上《籌劃俄人交涉》一片。
左宗棠在片中主要提出這樣一個建議：以後與俄人辦交涉，能不能由我一人主辦？免得他說一套，我又說一套，俄人應該聽誰的？
左宗棠為什麼往自己頭上攬這個差事呢？因為左宗棠既不相信榮全，也信不過金順。
左宗棠在原片的最後這樣寫道：“現在邊方將軍、都統各大臣除金順外，臣多未曾謀面。一切因應之宜，有函牘所不能詳者，亦有未可形諸函牘者，相距過遠，並有多處業已見之行事而臣猶無所聞者。事關中外交涉，誠慮議論分歧，無以示遠人而昭畫一。合無仰懇天恩，敕下將軍、都統各大臣，於俄人交涉事件，除現行事宜本有定章，應各照常辦理，此外遇俄人交涉新疆者，應諮臣定見主辦，不必先與商議，致遠人無所適從，庶期徑路絕而軌轍可尋，論說少而爭辯自息，似亦省心省事之一道也。”
獎賞聖諭很快頒下：“西寧道劉錦棠，著賞給騎都尉世職。提督譚拔萃、譚上連、餘虎恩、譚和義、席大成，均著賞給雲騎尉世職；黃萬鵬、蕭元亨，均著賞穿黃馬褂。參將董福祥，著免補參將、副將，以總兵交軍機處記名。”旨後還有一大串獎賞有功之員，並陣亡將弁優恤名單。
針對左宗棠所上之《籌劃俄人交涉》一片，朝廷單下旨給左宗棠及幫辦軍務金順、伊犁將軍榮全二人，指出：“新疆與俄境毗連，時有交涉事件，輕重緩急，自宜審慎以圖，以免後患。嗣後遇有與俄人交涉之事，著榮全先行知照左宗棠酌度情形，由該大臣主持辦理。”
朝廷終於把與俄國的交涉大權交給了左宗棠。
接旨後，左宗棠又給劉錦棠發密函一封，商討進攻南路之事，指出：向南疆進兵之前，必須鞏固好北疆，而且要與蜀軍、嵩武軍同進，不可孤軍冒進。至於具體進兵日期和三路人馬進軍路線，由劉錦棠相機決定。左宗棠隨後又向劉錦棠講述了南疆八城的來歷及名稱，說：南疆八城是乾隆二十四年（公元1759年）平定叛亂後建立的。他們分別是：喀什噶爾（即今新疆喀什市）、英吉沙爾（即今新疆英吉沙）、葉爾羌（即今新疆莎車）、和闐（即今新疆和田）、阿克蘇、烏什、庫車、喀喇沙爾（即今新疆焉耆）。吐魯番因居南北二疆的中部，不在南八城之列。吐魯番轄托克遜，喀喇沙爾轄蘇什巴台。吐魯番是南疆的鎖鑰，蘇什巴台則處在南疆最前端。
該函又對收復南路如何進兵談了自己的看法：“以常理論，進攻南路，須俟金景亭到始夠佈置而策萬全，然此軍到烏垣，總須冬臘之交。如軍機不能久待，則俟瑪納斯收隊回營，古、濟各營搜山事畢，桂、方、章到齊，亦可稍資指揮。其蜀軍、嵩武之進規吐魯番，師期應由尊處酌定，乃期有當也。”
左宗棠的書信送到劉錦棠手中時，正是深冬時節，新疆北路一帶大雪狂舞，寒風勁吹，滿眼的冰天雪地。
劉錦棠考慮到雪天行軍有諸多不便，何況麾下各營尚有部分兵勇沒有領到寒衣，加之給養轉運困難，若決然南下恐有後顧之憂，於是給左宗棠复函一封，提出全軍休整，等明年解凍時節再向南路推進的建議。
左宗棠接到劉錦棠的來信，口裡先道出一句：“毅齋所言極是！吾之所言欠周詳耳！”
左宗棠於是連夜回信一封，稱：“節交冬令，冰雪載途，亦非用兵之時，似宜蓄銳以待，方期週妥也。唯乘此閒暇，將後路搜剿清楚，乃為妥便。”
其間，左宗棠又接一旨：“烏里雅蘇台參贊大臣著榮全補授，伊犁將軍著金順補授，烏魯木齊都統著英翰補授。”聖旨最後又特別指示金順：“所部進兵，自酌進止。”聖旨中所說的烏里雅蘇台，就是現在蒙古國境內的紮布汗省省會扎布哈朗特。
顯然，慈禧太后仍對金順寄予重望，並賦予他“自酌進止”的權力，等於是在關外設立了兩位總統。
左宗棠接旨後卻憂心忡忡地長嘆一口大氣。他在當日給劉錦棠的信中這樣嘆道：“和甫為人，只知居功，不能做事。”
不久，署烏魯木齊都統英翰，由京師風塵僕僕地趕到肅州，來向左宗棠禀到，商量出關赴任等事。
左宗棠於是又提起精神，與英翰周旋了兩天，直到英翰出關才得歇息。望著英翰的背影，左宗棠悄悄嘆息了一聲，不由暗道：“烏魯木齊新復，邊務正當繁重，朝廷卻打發來這麼一個大煙鬼出任都統，也真做得出來！”
左宗棠發此感慨不是沒有緣由的。