劉典趕到紹興時，也正逢大批守城太平軍將士出城去慈溪參戰。
劉典命所部按兵不動，等太平軍去遠，這才躍起攻城，竟一戰而下，並順勢將紹興相鄰的桐廬捎帶攻取。
富陽、紹興兩地都屯有大量的太平軍糧草等物品，劉典還在紹興發現了三千餘支太平軍新從西國購進的快槍。劉典在紹興稍作佈置，即率軍殺奔慈溪。
慈溪的這場戰爭整整持續了兩天兩夜，五萬多太平軍除三萬多人被殺外，只有一萬餘人逃離出去。
湘楚各路人馬也傷亡頗大：五千餘人喪生，受傷者也達三千餘人；蔣益澧、劉松山、劉典三人都有不同部位受了輕傷。
這是左宗棠督師入浙以來與太平軍發生的最大的一場惡戰，也是一場決戰。
左宗棠敢用三萬人迎戰李秀成的五萬人，主要還是沾了器械精良的光。太平軍損失如此慘重，一則是因為連失富陽、紹興、桐廬三城使人心渙散，再則也是此時太平軍手裡的器械實不如湘楚各軍器械之精良。
左宗棠在上奏朝廷時這樣寫道：“此次三日之內，連克府縣四堅城，在事文武均屬著有微勞。布政使蔣益澧，功績卓著，應請交部從優議敘，或懇天恩頒賞物件；按察使劉典，出兵迅速，克復紹郡立有頭功，請旨交部從優議敘；老湘統領提督銜劉松山，在慈溪被圍兩日，為收復紹興、富陽、桐廬等三城創造了機緣，其受累最多，兵勇受創最重，請旨交部從優議敘；署衢州鎮總兵劉培元，應請賞給勇號，並加提督銜；按察使銜三品京卿楊昌浚，雖未參戰，但因連日籌餉籌糧，使官軍順利收復四地；候補道胡雪巖亦隨楊昌浚籌餉籌糧，以上二員應否請旨給予破格天恩……”
左宗棠回到嚴州不久，獎賞聖旨頒下。旨曰：“左宗棠調度有方，深堪嘉尚。仍著督飭各軍節節進剿，盡殲醜類。浙江布政使蔣益澧，戰功卓著，著賞給小卷江綢袍料一件、江綢馬褂一件、白玉翎管一枝、白玉扳指一個、大荷包一對、小荷包兩對，並交部從優議敘。按察使劉典賞二品頂戴，並交部從優議敘。提督銜劉松山交部從優議敘。署總兵劉培元，著賞給銳勇巴圖魯名號，並賞加提督銜。按察使銜三品京卿楊昌浚，著賞加布政使銜，以二品京卿幫辦浙江軍務。候補道胡雪巖賞加三品頂戴按察使銜。”聖旨隨後又道：“耆齡、左宗棠務當乘此破竹之勢，會督閩浙諸軍星夜進搗杭州，為一鼓殲除之計；一面分軍規取永康、武義，以清後路。毋稍延誤。欽此。”
其實，早在聖旨到前，左宗棠已遣劉松山、劉典與劉培元水師大營，分頭圍向杭州。
蔣益澧則會同楊昌浚分赴紹興等地辦理安民事宜。
胡雪巖也已回到嚴州，此時正陪著左宗棠、史致諤二人，商量裁遣常捷軍的辦法。一道聖旨由八百里加急飛速遞進巡撫衙門。
左宗棠此時正同史致諤、胡雪巖及兩名師爺，在簽押房逐一核對楊昌浚新交付的辦理捐輸冊頁，聞聽聖旨到，左宗棠不由一邊起身一邊撫須笑道：“好消息一個接著一個，不知上頭又獎賞了哪位大員。”
左宗棠大步走進官廳，傳旨差官一見，急忙高喊一聲：“聖旨下，左宗棠接旨！”
左宗棠見傳旨差官面色有變，口氣有異，心頭不由一動，慌忙跪地接旨。
傳旨差官展旨讀道：“本日據閩浙總督耆齡奏稱，浙境漸平，閩省卻爛，全因左宗棠督剿不力所致。左宗棠接辦浙事以來，自募楚軍六千，後續添募至一萬五千人，又有湘軍劉松山所部，又有蔣益澧等多路省外官軍助剿，兵力不謂不厚，但每逢與發逆接仗，從未奮力殲除，只以收復城池多寡邀功，致使浙省發逆盡竄閩省，局面大壞。閩省原有發逆，經官軍多路規剿，已大半殲除，復經浙省發逆竄入連克州縣，形勢逆轉，閩省各路官軍始料不及，新復州縣相繼淪陷，發逆甚撅。奏請將欺君罔上之左宗棠革職交部問罪，另調派統兵大員接辦浙事等語。覽奏曷勝憤懣！左宗棠入浙，剿匪本其專責，所統各軍不為不眾，所濟餉糧不為不多，卻不能殲除匪賊於境內，致使竄入閩省，全局敗壞。實屬有負委任，著實可恨可惱。著將左宗棠革職留任，迅速督軍，會同閩浙總督耆齡，盡殲閩浙賊匪。如仍因循，必將從嚴治罪，決不姑息！欽此。”
左宗棠未及聖旨宣完已然驚得目瞪口呆，他無論如何都沒有想到，閩浙總督耆齡，會在這個時候參他一本。因為這個參本，朝廷竟然把他所有的功勞都抹殺掉，把他革職留任了。閩省局面不好，是因總督耆齡、福建巡撫徐宗幹征剿不力所致，怎麼能推到他左宗棠身上呢？
耆齡卻參得有理有據。耆齡說，浙江局面漸好，但福建卻被太平軍給打爛了。為什麼呢？因為左宗棠根本就沒有消滅太平軍，只是把他們趕進福建了事。耆齡接著質問左宗棠：你自己有楚軍六千，後來又添募了一萬五千人，曾國藩又把劉松山所部派給了你，朝廷又從外省調兵給你，你有這麼多人馬，為什麼不能把太平軍剿盡蕩平？不剿盡蕩平也就算了，你還累次向朝廷請功邀賞，居心何在？
許久許久，左宗棠才眼含熱淚接過聖旨面北謝恩。
左宗棠臉色灰白地被人扶進簽押房，對著史致諤、胡雪巖說道：“本部院剛剛接到聖旨，本部院因對浙省發逆督剿不力，已革職留任，下一步可能就是摘掉頂戴，押赴京師問罪了！”話畢，左宗棠氣憤地坐到木椅上，兩眼愣愣地發起呆來。
史致諤大驚道：“上頭這是怎麼了？大人督軍入浙以來，克州复縣，眼看大功告成，怎麼就讓人參了？這是誰人做的手腳？”
胡雪巖道：“不用問，這肯定是哪位都老爺發燒吃錯了藥！”
左宗棠長嘆一口氣道：“你們大概想不到，參本部院的人非是別人，乃是閩浙總督耆齡！”
“耆齡？”史致諤愈發吃驚，“大人怎麼和他有了過節？”
左宗棠沉思著說道：“本部院與耆制軍實未謀面，只是有過幾次書信上的往來。本部院思來想去，實在想不出這其中緣由。自從本部院遭官文誣參以後，本部院就盡量避免與一些滿員過從甚密。本部院接旨之後頭有些發漲，想到上房去歇息片刻。各位接著辦差吧，本部院一會兒再來陪各位喝茶。”
胡雪巖跨前一步，一邊扶左宗棠起身，一邊小聲道：“大人，職道派人去外面請個郎中吧？”
左宗棠苦笑著搖頭道：“雪巖言重了，本部院受這點打擊，還抗得住。革職問罪都不打緊，可總得讓人明白是怎麼回事啊！”
望著左宗棠的背影，史致諤忽然自言道：“這大清國的官真不是人幹的！等常捷軍的事情辦出眉目，我是決意回籍了！購置幾畝良田，築他一座好宅院，燈下觀書，林間看鳥，田頭望月，豈不快哉！”
當晚，左宗棠發起高燒，侍妾香姑娘整整忙了半夜才安枕。早飯時分，胡雪巖又請了兩名郎中來為左宗棠把脈，史致諤則帶人繼續辦理未竟之公事。
耆齡素未與左宗棠謀面，他怎麼好端端地便參了左宗棠一本呢？
原來，耆齡與湖廣總督官文是兒女親家，耆齡參劾左宗棠這件事，全是官文在幕後籌劃而成。
耆齡是滿洲正黃旗人，字九峰，舉人出身。歷任員外郎、郎中、刑部主事。道光二十六年（公元1846年）外放江西，出任撫州、吉安、贛州等知府。咸豐五年（公元1855年）擢吉南贛寧道。咸豐六年，賞二品頂戴署江西布政使，旋實授。是年，曾國藩奉命統率水陸湘軍進江西對太平軍作戰，他的翰林同年江西巡撫陳啟邁掣肘，導致湘軍糧餉俱困。
曾國藩一怒之下狠參了陳啟邁一本，上將陳啟邁革職逮赴京師問罪，著耆齡署理巡撫印綬。耆齡接署巡撫後，一改陳啟邁的做法，主動與曾國藩配合，要餉他便著人四處籌餉，缺糧他便讓人八方去購糧，使江西戰事漸由被動轉為主動。咸豐九年（公元1859年），調任廣東巡撫。同治元年（公元1862年）督軍赴閩辦理軍務，該年七月得賞頭品頂戴升授閩浙總督。
在當時的大清國，耆齡尚屬能員行列，只是對漢人太過蔑視。他當初不敢對湘軍掣肘，一是怕江西局面壞成不可收拾，一是怕自己重蹈陳啟邁的覆轍。曾國藩在京師署刑部侍郎時，奉命審理過侯爺琦善的案子，轟動了朝野。耆齡自忖無法與琦善相比，自然也不敢與手握重兵的曾國藩相抗衡。
左宗棠督軍入浙時，耆齡已經在福建督辦軍務，但朝旨卻把浙江劃歸曾國藩節制，左宗棠與他並無統屬關係。耆齡得授閩浙總督後，浙江已不再由曾國藩節制，自然重歸閩浙總督管轄。耆齡要參左宗棠，受官文挑唆只是原因之一，還有另一層原因：朝廷幾次下旨命左宗棠調派兵勇援閩，左宗棠卻反复搪塞，根本不派一兵一卒，只是一心經營浙事。耆齡是無論如何都咽不下這口氣的。
按他自己的話說，像左宗棠這種目空一切又自以為是的人，不狠狠參他一本，天理都難容。耆齡在參奏左宗棠不久，又暗上一本，密保正在江寧圍剿的吉字營統領江蘇布政使曾國荃出任浙江巡撫。
耆齡這麼做也是官文給出的主意。官文函告耆齡說：“保舉曾老九出任浙撫，使天下人相信，參奏左宗棠非耆九峰本意，實乃曾滌生指使也。無非是為江寧克復後，為胞弟謀一封疆缺分。”
官文老謀深算，此舉真正叫做惡毒，無非是想讓漢員之間相猜，最後再發展成相鬥，滿人才好從中取利。
心性率直的左宗棠怎麼能不被氣病呢？