1932年4月18日，陝甘游擊隊在旬邑馬家堡整休後，分編為三、五兩個支隊，黃子文被任命為五支隊政委，閆紅彥任隊長，楊重遠任參謀長。
同月21日，五支隊按上級指示，南下武字區。黃子文到武字區後，即派人找區委負責人，商議組織農民聯合會會員，配合五支隊消滅馬額王茂臣民團事宜。區委委員王曲賢到後，方知區委已於當月12日遭敵破壞，書記馬先民被捕，王茂臣帶民團逃跑，黃子文遂與閆紅彥率部隊進駐馬額轄區的文龍堡。 22日中午，武字區農聯會在文龍堡召開歡迎陝甘游擊隊第五支隊大會。 “到會的三千餘人，一律武裝，鏢如森林似的排列起來。”“農民對游擊隊的態度，如同出遠門的家人父子團聚一樣，高興到了極點！”“大會公選黃子文同志為主席，同時代表群眾（致歡迎詞），在他的致詞中，群眾的掌聲真是如雷鳴一樣。刪隨五支隊南下的中共陝西省委書記杜衡代表省委講話。會議決定：由三原黨組織、五支隊和武字區農民聯合會的代表七人組成革命委員會，擬在三原、富平、耀縣接壤一帶，開展分糧分地鬥爭，執行土地革命任務，取消敵區公所，解散民團，由革命委員會向蘇維埃中央政府及全國各革命團體發通電等五項決議。”
至此，黨在渭北建立的農民聯合會游擊隊、渭北特委、渭北革命委員會和三原中心縣委領導人民進行武裝鬥爭，政權建設，實行土地革命，根據地全面發展。國民黨得知這一情況於23日就緊急從西安調來三營兵力，又聯絡富平胡景銓二百人，耀縣特務團上千人，分三路包圍武字區，實施鎮壓剿洗。黃子文等分析了形勢，為保存革命實力，放棄原計劃，揮師北上，巧妙地甩開了敵人。黃子文此時雖知妻子李盛雲已由北平返回家鄉，但亦難以顧及。
同月底，黃子文、劉志丹等以中國工農紅軍陝甘游擊隊名義，向全中國革命民眾發出宣言，譴責國民黨軍隊在西安屠殺革命學生造成的“4·26”慘案，號召工農兵學武裝起來，推翻國民黨統治，建立民眾政權，以求中華民族的徹底解放。
5月10日，三、五支隊在清水原會合，恢復了總指揮部，黃子文任政治部主任。游擊隊北上途中，駐紮在旬邑馬欄的國民黨軍隊兩個連進行阻攔。戰鬥打響，黃子文和閏紅彥率五支隊擔任主攻，一舉將敵全殲，繳獲槍械百餘支，彈藥無數，有力地保障了北上活動。
6月底，因陝甘游擊隊在韓城轉戰中失利，人員減少。黃子文根據北方各省委聯席會議決議中“在已開始生長成為紅二十六軍的游擊部隊中，應該毫不延緩的徵調大批工人與吸收雇農、貧農及可靠的中農進去”的精神，帶一班戰士回武字區“擴紅”，在區委負責武裝工作的黃子祥的協助下，三天就有80多名青壯年報名參加，隨即集中於小道口村，加入了陝甘游擊隊，壯大了武裝力量。