1954年4月，中共中央任命馬明方為中央副秘書長、中央組織部副部長。 8月，馬明方從西北大區到中央接任新職，協助中央秘書長兼中央組織部部長鄧小平工作。
1955年12月28日，中央政治局根據形勢發展的需要，決定成立中共中央財政貿易工作部（簡稱中央財貿部），馬明方任部長，裴孟飛任副部長，後又增加姚依林、白潛為副部長。
中央規定中央財貿部的任務是：管理財貿部門的干部工作，檢查黨的決議和政策在財貿部門的執行情況，管理財貿部門黨的基層組織工作，指導財貿部門政治機關的工作。
馬明方堅決地執行了中央規定的四項任務，提出財貿部的干部要深人基層，熟悉情況，鑽研經濟工作，積累經驗，加強理論和政策的學習，爭取在兩三年內打好工作基礎的方針。經過五年的踏實工作，在政治上、思想上、組織上取得顯著成績，有力地推動了全國財貿工作的發展。
財貿部門的工作面廣，同工農業生產和人民生活有密切的聯繫。全國財貿系統有十幾萬基層單位，遍布城市和農村，是財貿部門的基礎力量。黨的一切決議政策和財貿部門的各項工作，都要通過基層單位去實現。基層工作的好壞，直接影響整個財貿工作的好壞。因此，馬明方強調各級財貿部都要把抓基層、打基礎作為一項經常的重要工作，尤其要用很多的時間和精力，切實加強黨的基層組織工作，充分發揮黨的基層組織的戰鬥堡壘作用。 1955年底，全國財貿部門800多萬職工中，只有黨員43萬人，佔職工總人數的5％多一點，黨員的分佈很不平衡，有些部門和企業中黨員很少，有的甚至沒有黨員，多數企業中沒有單獨建立支部，所有支部都是執行機關支部的任務。不改變這種情況，就不能加強基層單位的工作。
1956年2月，中央財貿部召開了12省市黨委財貿部部長座談會，研究討論了1956年至1957年幾項工作的計劃要點。馬明方在座談會上的總結髮言中指出：加強黨的基層組織的建設，是各級財貿部的首要任務。他提出：各級財貿部門必須注意從基層單位的店員、營業員、財務會計人員和知識分子中吸收一批具備入黨條件的積極分子人黨，經過幾年努力，使黨員人數達到職工人數的10％左右。在發展黨員工作中，必須堅持“積極慎重”的方針，注重黨員的質量，防止單純追求數量的偏向。凡有黨員三人以上的企業單位，都應單獨建立黨的支部；黨員不足三人者，可由黨員和團員組成黨團小組，以便加強企業中黨組織的工作。企業支部除執行一般支部的任務外，還應對行政工作加以保證和監督。他的總結髮言，報經中央批准後，印發各級黨委執行。
1957年2月，中央財貿部召開了第一次全國財貿部門黨的基層組織工作會議。這次會議召開時，財貿部門已新發展黨員十多萬人，不少企業已單獨建立起黨的支部，實行了黨委領導下的經理負責制。一部分支部經過整頓，調整了乾部，加強了對經濟工作的領導。馬明方在這次會議的總結髮言中提出：1957年財貿部門黨的基層組織應當以發動群眾、廣泛開展增產節約運動為中心任務。為了把這個運動組織好，領導好，就必須進一步加強黨的基層組織的建設，紮紮實實地打好基層組織的工作基礎，切實加強黨的基層組織的領導核心，堅持群眾路線的工作方法。要充分發動群眾揭發工作中存在的問題，特別是在商品流通、資金周轉、物資保管、財務管理、農副產品收購運輸等方面的浪費問題，並依靠群眾，一項一項地進行整改。要堅決批判那些認為財貿部門增產節約“油水不大”、“浪費不多”等不符合實際的錯誤觀點，發揚勤儉建國、勤儉辦企業的精神。財貿部門的各項工作都要發動群眾去進行，黨的集體領導如果離開了群眾路線，就變成形式的、空洞的、沒有生氣的、軟弱無力的東西，甚至會犯錯誤。因此，在增產節約運動中，必須對黨員進行一次群眾路線的教育，使黨員尤其是領導幹部在實際工作中學會走群眾路線，和群眾取得密切聯繫，這不僅是一個理論問題，而且是加強黨的建設、黨的領導的一個實際問題。這次會議對於加強和改善黨的基層組織工作，推動財貿部門的增產節約運動起了很大促進作用。
1958年，財貿部門黨的基層工作又有了新的發展。財貿部門共有黨的基層組織4萬多個，黨員60多萬人，大多數企業單位建立起支部，許多地方對支部書記進行了訓練。經過整風運動，各地普遍地進行整頓黨的基層組織的工作，黨員的政治思想水平有了進一步提高，黨的組織進一步鞏固了，黨的領導作用增強了，“三參”（幹部參加勞動，職工參加管理，群眾參加監督）“一改”（改善經營管理）和職工代表大會、民主管理委員會等先進管理經驗，普遍得到推廣，一大批先進支部湧現出來，成為黨的基層組織學習的榜樣。中央財貿部和各省市財貿部都編印了基層組織工作經驗彙編，向全國財貿部門介紹了上百個先進支部的經1959年1月，中央財貿部召開了第二次全國財貿部門黨的基層組織工作會議，總結和交流了1958年財貿部門黨的基層組織工作的經驗，確定了今後工作的任務。馬明方在會議上了總結言。他指出：這次會議的大會發言60多篇，書面發言20多篇，講了黨委對財貿工作的領導，黨的基層組織工作、社會主義和共產主義教育，開展紅旗運動、技術革新和改善管理制度，黨的政治工作、群眾工作和人民公社的財貿工作。會議上的發言，反映出各地、各方面都有許多好的經驗，需要互相之間虛心地、認真地研究和學習，根據本地區、本單位的實際情況，加以採用。他提出，要繼續加強黨的建設，首先要加強黨的基層組織的領導核心，改進支部委員會的工作。目前全國財貿部門黨的基層組織，大約有半數左右領導核心較強、工作做得較好；也有近半數左右的基層組織領導還不夠強，工作和組織生活還不很健全，還有大約百分之幾的基層組織，領導核心還沒有形成，組織渙散，工作處於落後狀態。因此，有必要首先註意把黨的基層組織的領導核心加強起來，要把政治堅定、幹勁很足、作風好、受到群眾擁護的同志，吸收到支部委員會中來，使基層組織的領導核心增加新的力量。對那些領導薄弱的單位，要抽調一批政治上強的干部充實基層，首先把支部書記配備強。怎樣才算形成強有力的領導核心呢？這就是說：黨的支部委員會應當逐步做到：能夠堅持黨的政策、方針和原則，善於按照實際情況出主意、想辦法，把黨的政策、方針和原則貫徹到實際工作中去，並且善於總結實踐經驗，不斷地改進工作，提高領導水平，能夠團結和組織全體黨員，團結和組織積極分子和廣大職工，充分發揮積極性和創造性，正確地完成各項工作任務，能夠向各種錯誤傾向正確地進行批評和鬥爭，同時又能夠傾聽黨內和職工中的各種不同意見，善於分析問題，講清道理，不斷提高黨員和職工群眾的思想水平。只有具有這樣的領導核心，黨的基層組織才有戰鬥力，才能充分發揮黨的領導作用。我們應當爭取在一定時期內，經過努力，使所有支部都達到這樣的水平。會議經過集體研究討論，制定了《關於進一步加強財貿部黨的基層組織》的文件，印發各級黨委財貿部參照執行。這次會對於進一步加強黨的基層組織的建設有重要意義。
1960年2月，中央財貿部召開了第四次各省市自治區黨委財貿部部長會議。馬明方在會上提出，根據幾年來財貿部門黨的基層組織發展狀況，1960年應當著重提高全體黨員的思想水平和黨的領導水平。要建立起堅強有力的通政治通業務的集體領導核心，它既要把黨的政治思想工作和組織工作做好，又要把經濟工作管理好，領導好。會議討論通過了《進一步提高財貿部門黨的領導水平》的文件，經中央批發各級黨委執行。
1960年9月，中央決定撤銷中央財貿部。經過五年來的工作，財貿部門黨的基層組織工作打下了一定的基礎。 1956年初，財貿部門黨的基層組織2.3萬多個，黨員43萬人，到1960年9月，黨的基層組織發展到7.5萬多個，配備了3萬多名專職支部書記，黨員發展到85萬人，黨員的政治素質和業務水平都有很大提高，黨的基層組織的領導作用加強了，並積累了一定的政治工作、群眾工作和經濟工作的經驗，從而有力地推動了財貿工作的發展。
馬明方在中央財貿部工作期間，十分重視幹部管理和教育工作，提出把“培養又紅又專的干部隊伍”作為各級財貿部門幹部工作的努力目標。
財貿部門的干部隊伍是很大的。 1955年底統計，全國財貿部門共有乾部160萬人，其中，新中國成立以前參加工作的37萬，新中國成立以後參加工作、具有三年以上工作經歷的100萬人。從文化程度上看，具有大專程度的4萬人，具有高中程度的19萬人，具有初中畢業程度的70萬人，初中文化以下的70萬人。縣科級以上乾部5萬人，區級幹部30萬人。這160萬幹部是財貿部門的骨幹力量，在財貿戰線上發揮著重要的作用，在各方面工作中積累了一定的經驗。但是從工作發展的需要看，財貿系統的各級領導幹部的數量還是不足的，幹部的政治水平和業務水平一般還是不高的，一部分乾部的政治情況和思想情況還比較複雜，幹部管理制度還不健全，幹部工作還落後於政治形勢和經濟工作發展的需要，這種狀況需要逐步改變。
1956年2月，馬明方在中央財貿部召開的12省市黨委財貿部部長座談會的講話中指出：加強財貿部門的干部管理和教育工作，是各級財貿部門的一項經常重要的工作。目前幹部工作的主要問題是：幹部工作和政治、業務結合不夠，對乾部情況不熟悉，幹部工作缺乏遠大的目標，在提拔幹部中有嚴重的保守思想，必須採取有效措施，迅速扭轉這種落後被動的局面。他提出：必須制定乾部工作的全面規劃。要有兩個規劃，今明兩年的規劃和七年規劃，並使這兩個規劃銜接起來。在製定乾部規劃的時候，必須切實做好調查研究工作，全面了解各部門的干部情況和今後發展的需要，使乾部工作規劃建立在可靠的基礎上。他提出：必須積極地培養幹部，大膽地、破格地提拔各方面工作中急需的德才兼備的干部。打破“資歷”、“班輩”、“級別”等條條框框的束縛，從深入考察了解幹部的過程中去識別乾部和提拔幹部。在提拔幹部的時候，必須注意提拔知識分子乾部特別是高級知識分子和技術專家；必須注意提拔非黨幹部和婦女幹部；在少數民族地區要注意培養和提拔少數民族幹部；在公私合營企業中要特別注意提拔優秀的店員擔任領導工作。他提出：必須做好乾部的教育和訓練工作。切實整頓和加強現有各級各類幹部學校，堅持“政治與業務相結合、理論與實際相結合，提高思想水平和業務水平”的教學方針，爭取五年到七年，對區、縣兩級財貿部門的領導幹部輪訓一遍。對現有文化水平不急初中的干部應有計劃地組織他們學習文化。他提出：必須加強和改進財貿系統的干部管理工作，各級黨委財貿部應當根據中央關於部分分級管理幹部的規定，迅速地確定各自管理幹部職務名稱表，經常考察幹部的實際工作情況，以利正確地配備和使用乾部。他提出；要做好乾部管理工作，緊緊依靠黨委財貿不少數人是不行的，必須加強財貿部門認識機構，組織各方面力量共同去做。這次財貿部長座談會，討論制定了《中央財貿不關於1956年至1957年幾項工作的計劃要點》，報經中央批轉各級黨委執行。這個計劃要點基本上是正確的，各級黨委財貿部的工作基本上是按這個計劃要點進行的，並作出了一定的成績。
1956年8月，中央財貿部召開了第二次各省市自治區黨委財貿部部長會議，這種討論了非黨幹部的使用問題、幹部訓練問題和財貿部門的干部管理問題。 1957年2月，中央財貿部召開了第三次各省市自治區黨委財貿部部長會議，馬明方在會上講話指出：一年來財貿部門幹部已經發展到213萬人，提拔和配備了縣科級以上乾部2萬人，區供銷社主任以上乾部14萬人，領導幹部缺額問題已基本解決。這16萬人是財貿部門幹部管理工作的重點，管理幹部部門要深入到實際工作中去了解幹部的業務能力，思想水平，學習情況。系統地研究幹部政策和工作經驗，把這16萬幹部培養和管理好。就能帶動全部做好工作。同時提出，要在增產節約運動中，發現和表揚好的干部，克服和糾正部分乾部中出現出現的各種不良傾向。 1958年3月，馬明方在八省黨委財貿部部長會議上講話指出，在整風運動中，要從反對保守、浪費入手，對乾部中揭發出來的貪污浪費、官僚主義等問題，要實事求是地嚴肅地批評和處理。我們的方針是治病救人，廉潔奉公，而不是把人一棍子打死。
1958年6月，馬明方在全國各省市自治區黨委和政府財貿部門負責人參加的廣東新會現場會議上的總結講話中提出，我們在幹部工作上的長遠目標，是培養又紅又專的干部隊伍，必須有計劃地培養一支有共產主義覺悟、有文化科學知識、精通業務，能夠密切聯繫群眾的干部隊伍，這是財貿部門的一項基本建設。 1959年4月，馬明方在中央財貿部專門召開的干部會的總結報告中指出，在整風和大躍進中，財貿幹部隊伍發生了重大變化，全國財貿部門精簡了60萬人，其中40多萬調到工業、農業部門，加強工業、農業戰線的工作，下放勞動鍛煉的干部20萬人，以後還要繼續輪流下放。要注意在政治上幫助他們，給他們便利的條件進行學習，幫助他們在勞動中鍛煉思想，堅定無產階級立場，和勞動人民打成一片，建立同勞動人民的感情，這是培養幹部的一個重要途徑。
1960年2月，馬明方在第四次各省市自治區黨委財貿部部長會議上的講話中提出，1960年財貿部門幹部工作的重點，是加強幹部的教育，組織幹部學習，對各級領導幹部要有計劃地分期分批地組織他們系統地學習毛澤東著作，進一步提高幹部的理論政策水平。
經過近五年的努力，在中央和各級黨委的領導下，財貿部門的干部工作做出很大成績，制定和執行了乾部工作規劃，確定和完善了各級黨委財貿部的管理幹部職務名稱表，加強了乾部培養和管理工作，對乾部特別是各級領導幹部的工作情況進行普遍地全面地考察了解。中央財貿部辦了500多名高中級幹部的任免手續，審批了170多名廳局級以上乾部的審查結論，給邊疆抽調了2400多名幹部，到22個省檢查了乾部工作情況和乾部執行黨的決議和政策的情況，各級財貿部門提拔了30多萬名幹部，其中，縣局行長以上乾部5萬多名，直接從工人、店員中選拔了5萬多名幹部，處理了10多萬幹部的各種問題，輪流下放勞動鍛煉的干部30萬名，科技人員由4000多人增加到1萬多人。在全國財貿部門的149所干部學校中，輪訓了35萬名幹部，其中，區級以上乾部15萬人。在進行上述工作的同時，結合日常工作，組織幹部認真學習馬列主義和毛澤東著作，學習黨的路線、方針和政策，學會做政治工作、經濟工作和群眾工作，全面加強生產觀點、政治觀點、群眾觀點和全局觀點，絕大多數幹部在紅專道路上前進了一大步。當然，幹部工作中還有許多缺點，特別是在反右派鬥爭中，各級財貿部門錯劃了1000多名右派，雖然以後陸續給一些人摘帽，特別是黨的十一屆三中全會以後給所有錯劃的同志都做了改正結論，但的確傷害了一些同志，應該認真汲取教訓。
馬明方一貫重視政治思想工作。 1956年1月3日，他在中央財貿部成立時的干部會上就提出，要努力做好政治思想工作，積累經驗，推動工作。 1956年陳雲提出，在財貿部門的全體職工中，要樹立生產觀念、政治觀點和群眾觀點。馬明方完全贊成，並以此作為財貿不政治思想的基本方針。理論結合實際，他在工作做過多次重要的、深入簡出的闡述。
馬明方在各種會議上和外出巡視時，多次反復強調指出：馬克思列寧主義政治經濟學深刻地論述了社會的生產、分配、交換和消費是統一過程的各個環節，其中起決定作用的是生產。生產是根本，未有生產不發展而財貿工作很好開展的，唯有經濟不發展而財政問題可以很好解決的，財貿工作必須處處從生產出發，盡一切努力促進生產的發展。生產決定分配，交換和消費，但同時，分配、交換、消費又反過來影響生產，在一定的條件和範圍內有時甚至對生產起決定性影響。財貿部門的主要工作是主管交換、分配和消費的。財貿部門為生產提供資金、原料，銷售產品，滿足人民生活和生產的需要，因此就必須明確地樹立生產觀點，通過自己的經營活動，支援生產，為人民提供更多更好的商品，並從人民對消費品數量和質量的需求，反饋到生產部門，促進生產的發展和改進。那種認為財貿部門只是做調、轉、運、存、掙的單純的片面的業務觀點是錯誤的。
馬明方多次強調指出：“政治工作是經濟工作的生命線”。財貿工作人員必須牢固樹立政治觀點，使政治經濟緊密結合起來。那種只顧經濟，不問政治的觀點是錯誤的。
馬明方多次指出：財貿工作是為人民服務的，財貿工作人員必須明確樹立群眾觀點，走群眾路線。財貿部門同人民生產和人民生活有直接的密切聯繫，必須通過自身的業務活動，積極主動地及時了解群眾生產和生活上的需要，並通過自己的工作盡可能滿足群眾千差萬別的需要，如果心裡沒有群眾，在工作中不走群眾路線，一心只想掙錢，那就會喪失社會主義財貿工作的特性，就會脫離群眾，引起群眾的不滿。
馬明方反復強調，政治工作要上櫃檯，要落實到日常經濟活動中去；提高財貿部門的服務質量，是提高和改進財貿工作的中心環節。服務質量是一個綜合指標，是政治工作、經濟工作、群眾工作的結合點和集中表現，是經濟效益和社會效益統一的具體表現。這不僅包括服務態度、服務內容、服務方法，也包括各項經濟指標和經營方式。只有良好的服務質量，才能有效地支援生產和滿足人民的需要，才能使財貿工作得到發展和改善。而良好的服務質量，是無聲的宣傳，它能吸引群眾看到社會主義的優越性，從而調動群眾的積極性，團結在黨的周圍，為社會主義事業而共同奮鬥。如果老是板著一張臉，不熱情地為群眾服務，不熱情地做好經濟工作，就自然不能得到群眾的擁護和支持，社會主義的優越性也就表現不出來。這不僅是一個經濟問題，也是一個政治問題。
馬明方多次強調指出：財貿部門必須參與組織和安排人民生活，指導人民的消費。 1958年以來，由於“大躍進”和人民公社化引起的社會經濟大變動，糧食和日用工業品短缺，人民生活產生了許多困難。馬明方提出，財貿部門要千方百計地組織和安排人民等生活，合理分配不足的商品，指導人民有計劃地消費，勤儉持家，細水長流，反對“走後門”等不良傾向。馬明方多次強調指出：財貿工作人員是經濟工作人員，同時也政治工作人員，群眾工作人員。在經濟工作中要貫徹執行黨的政策等，用馬列主義、毛澤東思想的立場、方法去處理各種問題，要發揚共產主義精神，團結友愛，發奮圖強，互相幫助，通力協作。要向群眾耐心宣傳有關政策，關心群眾的疾苦，做群眾的貼心人，並依靠群眾，做好工作。
馬明方還提出：財貿部門要積極主動地同工業、農業、交通運部門密切配合，協同動作，發揚共產主義協作精神，使工業農業的原料供應、工農業產品的收購、資金的周轉、商品的運輸和農副產品的加工等環節，一環扣一環地密切聯繫起來，形成工農商交一條龍大協作，堅決反對那種固步自封、互相扯皮、不顧全局的錯誤思想。
馬明方多次強調指出：財貿部門要積極組織幹部和職工認真學習毛澤東著作，特別是要普遍學習毛澤東《經濟問題與財政高題》、《關心群眾生活，注意工作方法》、《必須學會做經濟工作》、《關於正確處理人民內部矛盾的問題》等著作以及黨的路線方針政策以武裝自己的頭腦儘管在“大躍進”、人民公社化等“左”的指導思想下，馬明方財貿部門的工作人員不可能不受到影響，但馬明方的上述指導思想，對財貿部門的工作起了積極的作用。那個時期，財貿部門的政治工作做得很活，很有生氣，有效地提高了財貿部門幹部和職工的思想水平。今天看來，馬明方的上述觀點，也是完全正確的。
1956年開始，全國財貿部門開展了先進工作者運動，財貿部門的各行各業都湧現了一批先進工作者。 1957年2月，馬明方在中央財貿部召開的第三次各省市自治區黨委財貿部部長會議上的講話中指出：去年開展的先進工作者運動是有成績的。缺點是先進工作者的標準偏低，有些單位把只完成了一般任務的職工也評為先進工作者，有些單位先進工作者佔職工總數的百分之五十、六十，這就降低了先進工作者的作用。他提出，先進工作者應當是在工作中做出突出優異成績或有重大貢獻，為群眾公認的標兵。抓典型、樹標兵是一個很好的領導方法，應該繼續推廣。
1958年，許多地方開展了紅旗競賽運動。北京市商業部門首先抓住了天橋百貨商店這個典型，總結經驗，加以推廣，迅速在全國開展了學習天橋百貨商店經驗的群眾運動。馬明方親自視察了北京天橋百貨商店，稱讚它幾個主要方面的工作都做得好。 1958年3月，馬明方在八省黨委財貿部部長會議上的講話中說，大家參觀了北京天橋百貨商店和馬連道倉庫等先進單位，深受感動。現在很多地方財貿部門都發現了先進單位和先進地區，如湖北的麻城縣、蘄春縣，河北的徐水縣、亮甲台信用社，山東冠縣的信用社，四川的江油縣，湖南的衡陽縣，都做出了突出的成績。各級財貿部門都應抓典型，樹標兵，開展紅旗競賽運動，推動財貿工作的發展。 1958年，中央財貿部從推廣北京天橋百貨商店、湖北省的麻城、蘄春的先進經驗開始，先後召開了天津、雙城、漢口、江油、衡陽等地的現場會議，總結和推廣了財貿工作的先進經驗。馬明方根據毛澤東的指示，在廣東新會縣召開了更大規模的現場會，介紹和總結了新會縣財貿部門的先進經驗。新會縣的財貿部門1958年1月至4月，挖掘40萬擔肥料支援生產，銀行幫助農業社安排資金，糧食局積極解決豬飼料，供銷社積極收購農副產品，並幫助農戶解決了38萬頭豬的飼料，商業部門積極解決工業原材料，組織農業社用稻草作原料增產草紙，生產磚瓦，種植藥材，增產瓜子、蓮子、草菇、茶葉，上門收購，滿足市場需要。同時組織200多個貨郎隊、2000多人下鄉流動售貨，組織小商販回收廢品，加工利用，全縣計劃利用280多種，價值相當於1億斤稻穀。各地還設立了美化家庭服務組，幫助居民清理廢品，美化家庭。財貿部門成為生產上的得力助手，人民生活的組織者。馬明方在新會現場會議的講話中指出，新會縣的經驗是農村財貿工作的方向，為財貿部門樹立了旗幟。旗幟是經過乾部和群眾正確地進行了工作之後建立的，而不是任何人強加於某個單位和地區的。旗幟出現之後，要抓住它，培養牠，把它放在顯著的地位，作為學習的榜樣。
1959年6月，馬明方親自主持起草了題為《論目前財貿戰線的紅旗運動》的文章，送《紅旗》雜誌發表。文中指出：去年財貿戰線上展開的紅旗運動，是一個群眾性的社會主義競賽運動，各地都湧現出大批先進單結合的標誌。越是開展紅旗運動，工作就越要做得深入、細緻、踏實。必須防止和克服那種滿足於轟轟烈烈華而不實的傾向。紅旗運動是先進帶動落後、落後趕上先進、先進更先進的活動，是互相學習，共同提高的一種組織形式。開展紅旗運動的目的，是總結和推廣先進經驗，推動財貿工作的發展，必須注意在政治和經濟上帶來實際效果。一定要防止形式主義、錦標主義，搞花架子，過分渲染和鋪張浪費等現象。給先進單位以紅旗單位的稱號，為的是鼓勵後進學先進。絕不允許對那些工作不是先進的單位給以白旗、黃旗、黑旗的符號，否則就會打擊一大片，挫傷大多數人的積極性，就會脫離群眾。
1959年11月2日和24日，馬明方先後出席了全國財貿部門群英大會和全國金融工作先進集體和先進工作者經驗交流大會，並在兩個會上作了講話。他一再提出，在繼續發動群眾的基礎上，使紅旗運動的政治內容和經濟內容更加豐富，群眾運動更加宏偉，使紅旗競賽運動成為群眾的自覺活動。
1960年2月，馬明方在第四次各省市自治區黨委財貿部部長會議的總結髮言中指出：五年來，全國財貿部門湧現出了大批紅旗單位和近百萬個先進工作者，他們是財貿戰線的先頭部隊，聯繫著千百萬群眾，起著團結、教育和組織群眾的重要作用，對不斷提高財貿工作的水平有深遠的影響。
馬明方在中央財貿部工作期間，勤勤懇懇，實實在在，堅決執行中央的決定，一步一個腳印。他對中央財貿部的同志，熱心愛護和關懷，經常教育大家，深入實際，深入基層，調查研究，總結經驗，努力學習政治，學習業務，苦練基本功，把工作、學習、寫作緊密結合起來。對某些同志的不健康思想和行為提出誠懇的批評。他在“大躍進”中雖然也說過一些過頭話，但從總的方面來看，他是反對浮誇，力主實事求是的；在反右派鬥爭的大氣候下，他在中央財貿部也將一個同志錯劃為右派，對三個同志給了錯誤的處分。在反右傾鬥爭中，他只做了傳達，沒有在部裡開展反右傾運動。他在工作中也有缺點，多次在於部會上作了自我批評。大家都認為他是說老實話、做老實事、當老實人的忠厚長者。