中日兩國一衣帶水，文化交流源遠流長，不少日本人喜愛中國文化，十分珍惜中國典籍。其間也產生了一些文化強盜，念念不忘想把中國典籍文物弄到日本。歷史上，中國是個世界大國、強國，這種覬覦往往不能得逞。甲午戰爭之後，由於清朝政府的腐敗，日本文化強盜便利用這個機會開始掠奪中國古代的典籍。竊取敦煌經卷，購買皕宋樓善本古籍就是這一行動的發端。 1937年“七七事變”後，日軍常常採取了三種作法，以達目的。
首先，在日軍佔領區，以查封沒收方式，瘋狂掠奪我國的珍貴文物和圖書。日軍對淪陷區的出版社和圖書館的圖書進行檢查，凡見到好書，就以種種藉口加以沒收，如1941年在商務印書館檢查時，一次就沒收圖書21.3萬冊。當1938年日軍佔領南京後，除了進行令全世界震驚和髮指的“南京大屠殺”外，日本政府還派出各類科學家和版本學家對南京中央圖書館、中央研究院等70多處地方進行搜查，動用卡車310輛次，將88萬冊圖書劫往日本。這次搶劫的書刊當中，有1938年以前完整的中國各級政府的公報，當時中國產業調查和計劃，還有3000多冊清朝歷代皇帝實錄等文獻。不少正直的日本人認為這是一起“文化大屠殺”。
對於私人藏書樓，日軍照樣搶掠。日軍命令中國藏書者“自動繳呈”，並以幫助繳呈為名進入私人藏書樓，按目索書，大肆掠奪。吳興嘉業堂、常熟鐵琴銅劍樓等著名藏書樓，經常受到日本文化特務的騷擾，不少圖籍被抄去。
其次，對於數量很多一時難以搬運的圖書文獻，盡力焚毀。
江蘇國學圖書館多藏宋元以來歷代珍本書，抗戰中為防日寇掠奪，該館將這批圖書寄存在蘇北興化縣，被日寇發現，結果使這批木刻圖書與方志6803冊全被敵人焚毀。另外，該館保存的清朝咸豐、同治、光緒、宣統四代江南各官署的檔案，已清理好的6486宗，未清理的60個大簍，全部被毀，片字不留。 1944年日軍入侵桂林，廣西省立桂林圖書館的20萬冊圖書全數被焚毀。
最後，日軍在戰爭中還專門針對圖書館進行砲擊、轟炸，焚毀圖書典籍。 “七七事變”後，日軍不顧國際公法中不得對文化設施、學校、醫院和平民採用武力的規定，放肆地狂轟濫炸學校。南開大學圖書館於1937年7月被日軍炮火夷為平地。 1937年8月松滬戰役中暨南大學圖書館在日軍炮火下化為灰燼。 1938年11月日軍飛機對湖南大學連續投彈50枚，半個小時內有八萬餘冊的圖書館和整個學校變成廢墟。最令人痛心的是上海商務印書館東方圖書館的被焚，藏書達50萬冊的商務印書館的東方圖書館，於1932年1月28日晚遭日軍海軍陸戰隊炮火攻擊，29日飛機密集轟炸，日機在商務印書館投下六枚炸彈，在得知東方圖書館沒受到根本性破壞時，又派浪人潛入該館縱火，一座設備現代化、館藏十分豐富、且有許多稀世珍藏的東方圖書館毀於一旦。
當日寇侵略意圖已經十分露骨的時候，我國圖書館界為了保存珍貴的文化遺產，開始了圖書的內遷、疏散的工作。
1931年“九一八事變”，東北淪陷。緊接著日軍指使漢奸策劃“華北五省自治運動”，眼看華北將陷入敵人魔爪當中。 1934年政府當局決定北京國寶南運，當時南遷的除有北京圖書館的古籍善本外，還有歷史博物館和故宮博物院的珍貴文物。南遷的北圖善本書籍，有原屬甲乙兩個庫藏的善本書約5000餘種，六萬餘冊，另外還有敦煌寫經9000餘卷，金石碑帖數百件，在運抵上海後，存放在公共租界的倉庫裡。 1937年11月上海淪陷，上海的租界日軍尚未佔領，成了孤島。當時北京圖書館副館長袁同禮與駐美大使胡適聯繫，欲將此批善本運往美國，托請美國國會圖書館代為保管，以避戰亂損失。 1941年初，袁同禮秘密赴滬佈置安排，由徐森玉和王有三兩人選出部分最為珍貴的古籍善本精華，計2954種20970冊，分裝成102箱。其中有宋刻本72種，金刻本12種，元刻本120種，交由北圖上海辦事處錢存訓辦理。為了躲避日人耳目，安全通過海關，箱子分成10批，每隔幾日，便報關運走一批。最後一批運走的時間是1941年12月5日，事隔兩天，即12月7日發生了珍珠港事變，美日宣戰。多次啟運一事雖引起日本華北興亞院方面的注意，無奈書已運走，只有望洋興嘆了。抗日勝利後，北圖曾有把書運回的動議，因國內戰爭又起，遂議暫緩。 1965年2月，前北圖館長袁同禮在美病故，台灣中央圖書館館長蔣复璁〔cong聰〕建議將這批圖書運往台灣，由該館代為保存。取得美國國務院、國會圖書館同意後，這批珍貴圖書於1965年11月運抵台北。台灣中央圖書館發布消息，聲明代北京圖書館保存，一俟條件成熟將返還北京圖書館。
抗戰當中，許多圖書館為了保存民族文化遺產，將重要珍貴的典籍內遷。國立中央圖書館，於1937年8月15日，在日機襲擊南京後，立即停止閱覽，將重要圖書裝成263箱封存疏散。 11月奉命西遷，由南京遷武漢，再遷長沙，最後遷至重慶。 “七七事變”之後，日軍開始向華北進攻，7月30日，平津陷落。北京大學在城內，圖書全部陷於敵人手中，清華圖書館搶運出來的圖書文獻，中途遭敵機轟炸，損失慘重。南開圖書館已被日寇炮火焚燒殆盡。所以三校最初在長沙組成臨時大學之時，僅有中外文圖書6000餘冊。與此同時，山東大學、唐山工學院、中央大學、復旦大學、上海醫學院、武漢大學等校的圖書館都輾轉遷徙。遷移當中有的損失是很慘重的，如中央大學圖書館40萬冊圖書，1937年遷往重慶，途中民船沉沒，損失不少，後遭敵機轟炸掃射，又焚毀了一部分。直至1948年該校藏書只有18萬冊，一直未能恢復原有數量。廣東、安徽、湖北、湖南等8個省圖書館都進行了遷移，途中，由於雨淋、日曬、風吹、蟲鼠為害，都損失了大批藏書。日本侵略者的鐵蹄踐踏了我們的國土，槍殺了我們的人民，還焚毀了記錄中國文明的典籍，然而華夏兒女胸膛中跳動著一顆中國心，始終為反對侵略戰爭和繁榮中華文化而奮鬥。