在紀檢部門的配合下，反貪局對蘇阿福揭發的四十八個受賄者的偵查進行得比較順利，在確鑿的證據面前，包括周秀麗在內的十二名受賄幹部，對其在“八一三”大火案中的受賄瀆職事實供認不諱。但由於蘇阿福舉報面廣，涉及的人比較多，許多受賄者的受賄行為又發生在多年之前，和大火案無直接關係。葉子菁和院黨組，院檢察委員會慎重研究，並向市委、市政法委匯報後，決定將這部分和大火無關的案件另案處理。其中包括市人大副主任李大偉和另外兩個副市級領導幹部的受賄案。
二〇〇一年十一月十五日，“八一三”特大火災案正式開庭審理。鑑於此案案情重大，影響廣泛，庭審時可能會出現許多難以預測的複雜情況。葉子菁親臨起訴一線，和起訴處長高文輝等九人以國家公訴人的身份集體出庭支持公訴。應該說，這一起訴陣容是比較強大的，在長山市人民檢察院的起訴歷史上還從沒有過。但被告的陣容更強大，除查鐵柱和蘇阿福之外，涉嫌瀆職、濫用職權、受賄的犯罪嫌疑人多達三十五人，每個被告又根據法律規定聘請了一到兩名辯護律師，辯護群體高達六七十人。市中級人民法院的審判庭無法容納這麼多人，何況許多人還要來旁聽，只好另選合適的庭審場所。選來選去，就選中了市政府經常用來開會的人民舞台。
審判地點一定下來，高文輝就找葉子菁嘀咕了，說是人民舞台能容納一千二百人開會，不知多少人會來旁聽此案的審理。此案涉及的瀆職幹部和瀆職單位又這麼多，免不了有人會在審理過程中搗亂，建議葉子菁出面和法院溝通一下，控制旁聽人數。葉子菁沒接受這一建議，反倒把檢察院餘下的二十張旁聽票也讓給了市城管委——城管委辦公室主任劉茂才說要讓城管委多去些同志旁聽受教育。
後來才知道，城管委來“受教育”的同志真不少，有八十多人，在旁聽席上形成了一個喝倒彩的方陣，明白無誤地支持被告席上的前領導周秀麗。
十一月十五日開庭那天，到場旁聽的有九百人，基本上是按單位劃定的座位。葉子菁率領起訴處長高文輝和其他七位國家公訴人走上公訴席時，就感到了一種無形的壓力：她沒想到，城管、工商、城建、公安、消防、稅務、文化市場管理等部門的三百多名幹部竟然全部著裝來旁聽庭審，也不知他們是不是事前串通好的？事後回憶起來，葉子菁還說，她當時的感覺就是：所面對的不僅僅是被告席上的被告和人數眾多的律師團，還有一種勢力——一種對她和檢察機關的抵觸勢力。
好在那天受害者家屬代表來了不少，也有五百多人。儘管這些代表沒人組織，但他們的到來，他們目光中流露出的渴望和期待，給了她信心和力量。在公訴席第一公訴人的位置上坐下後，葉子菁注意到，她此前看望過的祁老太也來了，癡呆呆地坐在旁聽席第一排居中的座位上。葉子菁眼前便又及時浮現出了0211號物證——祁老太那燒得焦黑一團的十歲的小孫子，心里便想，如果今天誰敢冒天下之大不韙，要在這里和法律事實進行一番較量，那就請他站出來試試吧！
公然跳出來的人沒幾個，但明顯的敵意卻充斥著整個審理過程。在這種敵意情緒掩飾下的法庭辯論充滿了前所未有的火藥味，又讓葉子菁大開了一回眼界。
開庭第一天，公訴方為了形像地說清楚火災發生的過程和違章門面房的有關情況，要求播放一部事先製作好的三維動畫說明片。被告席上，周秀麗聘請的兩位律師立即提出反對，說這有誘導庭審法官做出錯誤判斷的可能。高文輝代表公訴方據理駁斥說，庭審不可能在大富豪火災現場進行，大富豪娛樂城內部結構複雜，門前的違章建築又已拆除，如果不用三維動畫進行複原，很難準確陳述事實。
周秀麗聘請的兩個律師中，有一位來自省城，姓劉，名氣很大。這位名氣很大的劉律師指出了虛擬電子製作物的虛擬性質，爭辯說：“如果這種虛擬的電子製作物也能作為陳述案情的手段，那以虛構為特徵的電視劇也能做證據了！”劉律師帶著嘲諷問高文輝，“你們為什麼不精心搞一部電視劇來說明案情呢？”
劉律師話一落音，旁聽席上立即響起一片熱烈呼應的掌聲。
葉子菁注意到，這片掌聲主要來自城管制服構成的“受教育”方陣。
高文輝久經沙場，沒被劉大律師搞糊塗，也沒受那片掌聲的影響，提請審判長注意：電子製作物的虛擬性和火災過程的真實性是完全不同的兩回事，公訴方提出播放三維畫面只是為了說明真實的案情經過，並沒有作為證據使用的意圖。作為證據使用的將是現場錄像和相關人證、物證，公訴方將在以後的庭審中提交法庭。
審判長心裡有數，和身邊的幾個審判員交換了一下眼色，判定律師反對無效。
不料，審判長話音剛落，城管方陣里馬上發出了一片譏諷的噓聲。
審判長被這一公然的蔑視激怒了，在一片噓聲中，指著旁聽席上的城管方陣警告說：“請你們安靜一些，遵守法庭規定，否則，就請你們馬上退場！”
也許是仗著人多，法不責眾吧？城管方陣的噓聲並沒有因此停止。城管委辦公室主任劉茂才從座位上站了起來，時不時地看著被告席上的周秀麗，指著審判長公然叫道：“審判長，你們被告席上是不是少了一個被告啊？方清明在哪啊？”
方清明的貪污犯罪問題因和“八一三”大火案無關，已決定交由鍾樓區另案處理，不過審判長沒義務解釋，站起來指示法警說：“把旁聽席上的這個人驅逐出去！”
兩個法警馬上走到劉茂才面前說：“請吧，你的旁聽資格被取消了！”
劉茂才非但不走，反而大大咧咧在自己的座位上坐下了：“怎麼？怎麼？光許州官放火，不許百姓點燈啊？被告席上就是少了個被告嘛，也是腐敗分子嘛！”
兩個法警根本不睬，架起劉茂才就往外面走，也不管劉茂才如何掙扎。
幾個城管幹部圍了上來，扮著笑臉阻止法警執法，旁聽席上的秩序大亂。
法院顯然在事先預料到了這種情況，那天配備的法警不少。這時又有十幾個法警及時地跑了過來，七手八腳將圍在劉茂才身邊的四個城管幹部一起趕了出去。
劉茂才被拖出去之前，仍在不管不顧地大喊大叫：“我要替周秀麗主任作證，我們週主任是受了腐敗分子方清明的陷害！我們週主任是好人，是大好人……”
被告席上的周秀麗受到了鼓舞，竟然衝著劉茂才和城管方陣招手致意。
儘管法庭採取了強制措施，驅逐了劉茂才和其他四個旁聽者，可來自城管方陣的敵意仍沒消除。只是換了一種敵意形式，不再用噓聲表現，而是用目光錶現了。葉子菁和高文輝注意到，城管方陣投射到他們公訴席上的目光是那麼陰沉可怕。其他一些制服方陣上的目光也大都不太友善，消防支隊一些官兵臉上明顯掛著譏諷。
葉子菁在出庭之前，她和起訴處的同志們想到過來自瀆職單位的壓力和反彈，卻怎麼也沒想到壓力和反彈會這麼大。劉茂才竟會公然跳出來大鬧法庭！法律的尊嚴何在？這些瀆職單位幹部的法制觀念何在？這也太過分了！
在一片令人壓抑的靜寂中，葉子菁徵得審判長的同意，緩緩開口了，先是對著審判長席，後又對著旁聽席說：“審判長，同志們，作為國家公訴人，今天我們長山市人民檢察院根據《中華人民共和國刑事訴訟法》的規定，在這裡，在這個莊嚴的法庭上依法起訴'八一三'大火案的三十七名犯罪嫌疑人，履行法律賦予我和長山市人民檢察院的神聖職責。可我在這裡看到了什麼呢？我看到了一些同志的抵制和敵視，看到了有人蔑視法庭，蔑視法律，公然為被告席上的犯罪分子鳴冤叫屈！”
劉律師馬上舉手，再次提出反對：“審判長，根據我國法律無罪推定原則，公訴方對我的委託人使用了犯罪分子這一稱謂，這是我的委託人無法接受的！”
審判長肯定了反對意見，提醒道：“公訴人，請使用犯罪嫌疑人的稱謂！”
葉子菁這才發現，自己衝動中出現了技術上的錯誤，對審判長做出承諾後，又平靜地說了起來，卻把話題引向了別處：“剛才，在某些單位、某些同志大發噓聲時，我突然想起了一個事件，一個發生在文革動亂之中的血腥事件：一九六六年八月，在一片紅色恐怖的口號聲中，法制崩潰，天下大亂，我們共和國國家主席的公民權利已得不到保障。就在那個八月，就在我們共和國首都，在北京大興縣，一些喪心病狂的傢伙在光天化日之下公然活埋一批所謂出身不好的公民。一位抱著孩子的老奶奶被推到坑里，這些殺人犯們用鐵鍁一鍁鍁往老奶奶和孩子身上填土。不懂事的孩子說，奶奶，土瞇眼！老奶奶說，孩子，閉上眼，一會兒就不瞇眼了……”
法庭上一下子靜極了，無數雙眼睛投向葉子菁，顯然都被這血腥的歷史一幕震驚了。連一直對公訴方緊追不放的劉律師也沒因為這番話與案子無關提出反對。
葉子菁沒細說下去，把話頭引到了今天：“這件事好像和今天的庭審無關，可細想想，還是有些關係的！法律必須受到應有的尊重，任何單位，任何個人都有維護法律尊嚴的責任和義務！不要認為這種歷史悲劇不會重演了，如果法制崩潰，天下大亂，我們在座各位都有可能成為那個被活埋的老奶奶和孩子，這種無法無天的事就會落到我們每個人的頭上！”看著旁聽席上的城管方陣，葉子菁又說，“你們某些同志不要搞錯了，不要以為我這個檢察長和長山市人民檢察院要和誰作對，就算把我換下來，換一個檢察院，這些被告人仍然要被送上被告席！我們的法律必須承擔起懲罰犯罪，保護公民合法權利的責任！我請問一下你們某些同志，當你們為你們涉嫌瀆職犯罪的領導喊冤時，有沒有想過在大火中死去的一百五十六名受害者？如果這些受害者是你們的父母妻兒，你還會對公訴席大發噓聲嗎？良知何在啊！”
一片熱烈而正義的掌聲終於響了起來，掌聲大都來自死難家屬代表的席位。
嗣後，庭審得以正常進行。高文輝和起訴處同志們精心製作的三維動畫按公訴方的要求當場播放了，一場驚心動魄的大災難和整個肇事起火過程形像地再現在審判長和眾人面前。三維動畫上復原的違章門面房阻礙消防車救援的情形，和“八一三”現場的錄像幾乎沒有什麼誤差，讓能言善辯的劉律師也無話可說。儘管來自各瀆職單位的敵意沒有徹底消除，葉子菁和公訴方還是牢牢掌握了庭審主動權……