陸軍已發覺盟軍要反攻了。
軍方設計了包括內南洋群島的“絕對國防圈”。為了維護國體，一定要死守南方諸島。
昭和十七年一月二日，日軍佔領了馬尼拉。這時，陸軍的細菌研究機關決定，研究所向南方發展。馬尼拉佔領後，盟軍的士兵就容易得到了。
由於關東軍防疫給水部的研究，細菌繁殖，細菌爆炸等研究項目已大致完成。現在的問題僅在於嚴寒的西伯利重與酷熱的南方，細菌的使用不同。既然已查明了有在冬季嚴寒下能猖獗的鼠疫菌，那麼與此相反的鼠疫菌也應有。在開戰的同時，陸軍接收了庫拉西島的熱帶傳染病研究所，並在那兒進行研究。
在馬尼拉陷落的同時，軍方決定著手進行最後的實驗——人體實驗。
在哈爾濱進行被稱為“丸太”的實驗。其人體應有盡有，但是，以盟軍為對手的細菌戰，與以中國人、滿洲人和蘇聯人等為對手的不同，存在著體格和其它方面的問題。而且，若不進行在熱帶自然狀態中的實驗，便不會奏效。無論如何得需要美國人。馬尼拉的陷落，為此創造了有利條件。
軍方極其秘密地著手進行活人實驗。哈爾濱的防疫給水部有龐大的設施。雖說這樣，也還是設法嚴防各國諜報機關的間諜。可是，各國諜報機關還是偵探到一個梗概。在南方的一個孤島，不用為此擔心，但為防止意外情況發生，人員都是從其它各個部隊抽調來的，在軍歷上也無記錄。當時，軍方就已擬定出一套以戰敗為假定對策的各種方案。在戰爭罪犯中，研究、使用細菌者要受到更為嚴重的處罰。正因為這樣，所以要絕對保密。
島中和中岡兩名大佐被派遣去了。
俘虜也運來了。
雖說是俘虜，可其中有很多都不是投降的俘虜，所以若從中提走一些人而沒有返回的話，就會遭到抗議。戰爭勝利了則罷，倘若失敗，戰勝國常常會徹底地追查這些事情。
被擊落的敵機機組成員、艦船船員、治安部隊、秘密逮捕的問諜、破壞者——這些人在徹底秘密作戰的幌子下，由海軍的二式大艇在深夜送來。
在這裡，俘虜也被稱為“丸太”。丸太被帶上鐵腳鐐再加上鐵鎖，關禁在臨時的木房中。
研究的方法，由於關東軍防疫給水部積累了經驗，因而僅僅需要調查極寒和極暑的不同點以及在這中間人體的差異和抵抗力等。
軍方並沒考慮到把細菌武器用於對付在群島登陸的盟軍。研究倘若完成，就預定開始進攻東南亞和其它的盟軍基地。
雖然丸太陸續送來，但一個又一個地都被殺了，其中多是下級士兵，可是也有高級將領、平民百姓。他們全部都是白人和黑人，是以破壞者和間諜的嫌疑而悄悄逮捕的。
細菌一經移入，人就發高燒而死去。這裡與哈爾濱收容所不同，庫拉西的研究所地勢狹窄，丸太們不能分開隔離。帶著腳鐐的丸太們很快就明白自己是被進行細菌研究而死的。
無論會發生什麼事情，一旦進了這裡，就休想再生還。
但是，無法抵抗。丸太們整天哭泣，到後來大都是精神失常了。精神失常不成其為問題，對進行活人實驗說來，甚至效果更好。死者被沉入海底。這里和哈爾濱不同，處理屍體很方便——沉入海底、腐爛、被魚吞噬而無影無踪。
“布蘭克”黑唇，使是島中精心挑選，用“丸太”製造的殺人機器。由於用細菌藥品的原因，嘴唇髮烏變黑，更添幾分凶狠。
深夜被二式大艇悄悄地送來的丸太中，時而也混雜有女人，是二十至三十歲的女人。並沒有明確的嫌疑。被送來的女人邊哭泣邊爭辯、懇求，說是沒有任何理由，突然就被捕了。
無論怎麼申述，都沒有用。
一個女人，在下一個女人沒到來之前，可暫免一死，作為解悶排遣之用。從進來開始，直到玩膩以前，歸軍官所有。說到軍官，僅僅只有島中、中岡和下面的三名軍曹。
島中和中岡玩膩了，就交給士兵。一旦交給士兵們，那個女人連一個月也活不成。有二十名士兵每天夜裡折磨，生殖器很快地就發炎了，並由於遭強姦而出血，不能再供享用，這時，就對這個女人種殖細菌。
中岡從那時起，就有虐待狂的怪癖。中岡說，那是在關東軍防疫給水部形成的二次性的性徵。在對待丸太時，內心深處就湧出一種象搔癢似的焦躁。為了鎮靜，只有拼命虐待丸太。這是一種精神痙攣——伴隨著對己醒悟到要死可又只能默默地作為實驗的丸太的憐憫，心裡感到憤慨，可無視人性的罪惡意識又使中岡內心的彈簧彎曲，形成一種反饋，萌發了陰暗的芽。
女人送來後，最初由中岡玩弄。島中多少次地看見這種情景。中岡讓女人站著，冷不防地用手打在她臉上。女人因為還不知道自己的悲慘命運，便抗議。中岡就扭住胳膊按倒在地，扒下衣服。這時，女人才清楚，是被敵國的敵人抓住了，已不能不徹底覺悟了，因為雪白的肌體，已被按倒在床上。
中岡對女人揮舞著鞭子，這是毫無必要的，女人悲鳴了，雪白的皮膚很快她浮起紅腫的條痕。
一陣兇殘暴打之後，中岡站在女人的面前，命令對方舔自己的生殖器。女人邊流淚邊舔舐。有時中岡揪住女人的頭髮，將生殖器放入女人的口中撒尿。女人若不飲，就用鞭子抽打。僅有一個女人不飲。中岡把那女人赤裸裸地捆在木樁上不能動彈，全身用魚的腐爛液體塗滿。庫拉西島的銀蠅異常可怕，就是那種被士兵們稱之身“孔索利”的大型的發銀白色光的傢伙。數分鐘之內，從腳尖到被搬開的性器、肛門，到眼睛、鼻子、嘴，全被銀蠅埋沒。這種最像即使男人也會肉麻。
那個女人，在此之後，只好銜著中岡的生殖器飲尿。
一旦知道中岡的心情不佳，那個女人都要參拜在地上乞求可憐。
島中和中岡正好相反。島中在關東軍防疫給水部時代未能倖免，也沾染上類似二次性性徵這類的東西。從學校出來不久，就被放入那隨意殺丸太的生活中。越純潔就越容易被污染。同時，島中也不具備士兵那種豁出性命拼搏的大膽精神。
最初，在防疫給水部工作時，不是丸太，而是島中自己便出現了精神異常。那是個恐怖的經驗。不久，便對此習慣而不動搖了。但是，這僅是在表面上，內心的二次性性徵正在形成。
中岡由對丸太的憐憫而變成怒火。島中則變成內向性的精神痙孿，一想到伴隨命令而被殺害的那囚犯，就湧出異樣的激昂。試著把自己置身於那種立場，通過那種衝擊，不禁地出現受難忍辱的被虐待的顫栗。經常將蹂躪者和被蹂躪者、虐待者和被虐待者進行比較，認為被害一方精神振幅大，從中感到一種陰暗的、變態的喜悅火焰。
可以感到，虐待者的精神亢備較淺。不久島中便從被虐待者的傷心中，產生了深深的變態。
島中接過被中岡折磨得半死的女人，命令她虐待自己。女人無論什麼命令，都得服從。為滿足島中的要求，在密室裡用腳踢踏赤身裸體的島中。島中的命令與中岡的相反，他仍從中得到劇烈的快感，而由白人女人進行就更增添了這一效果。即便是對島中拳打腳踢，可女人想到什麼時侯就要被殺，總是戰戰兢兢。那種內心和行動的奇妙的不平衡狀態，那種島中趴在白人女人腳下用語言乞求饒恕的行徑，島中都視為自己的東西而激昂亢奮。
昭和十九年二月。
島中和中岡由於得到了軍方的命令，封閉了研究所而回國了。
在約兩年的時間內，送到庫拉西熱帶傳染病研究所的丸太，是一百三十六人，其中二十九名女人。在一百三十六人中，無一人活著出島，全部成為細菌的犧牲品而消失在南海裡。