長大後的耶律乙辛，雖然沒有很高的學識，但憑藉俊朗的外貌入仕做官，按部就班地做到了北院樞密使。直到公元1063年，耶律重元和耶律涅魯古父子發動了皇太叔叛亂，才使耶律乙辛有機會成為朝中重臣。那麼耶律乙辛是如何通過一場叛亂，成為朝廷重臣並逐漸把持朝政的呢？
在平定皇太叔之亂的時候，耶律乙辛跟耶律仁先倆人立了大功。耶律涅魯古發動叛亂前，知道耶律仁先不好對付，耶律仁先是南院樞密使，掌兵權，為人又極其忠義。如果要叛亂的話，耶律仁先肯定會擋他們的道，所以他們就想把耶律仁先調出朝廷，到外地做官。
道宗皇帝是個昏君，整天只知道打獵、飲酒，不理朝政，所以就打算同意這件事。正待批准的時候，隨口問了耶律乙辛一句，涅魯古他們想把仁先弄出朝廷，你看這事怎麼樣？很不經意地隨口一問，沒想到耶律乙辛回答：“仁先舊臣，德冠一時，不宜補外。”（《遼史耶律仁先傳》）仁先是先帝的舊臣，道德文章天下楷模，這個人不宜外補，應該留在朝中輔佐皇上。皇上一聽有道理，就把耶律仁先留在朝中了。反正皇上也沒什麼主意，他任命官員經常靠擲骰子或者硬幣，正面你就去，背面你沒戲。或者讓大臣來抓鬮，現在有一個樞密使的空缺，你們四個人抓，誰抓到是誰的。
耶律乙辛為什麼保耶律仁先呢？因為他當時的勢力還不夠大，所以要攀附仁先。畢竟仁先德冠一時，名氣比他大得多，他保住耶律仁先，一方面可以爭取美名，這樣忠貞的大臣是靠我保住的；另一方面，也可以在耶律仁先那兒討好，老大，皇上本來要把你踢出去，是我把你保住的。
平定皇太叔之亂，耶律仁先和耶律乙辛的功勞最大，耶律仁先是正人君子，忠奸不並立，耶律乙辛就想辦法排擠仁先。耶律乙辛讓手下人誣告啊，寫匿名信啊，各種卑鄙手段無所不用其極。最後，耶律仁先終於被排擠出京，擔任南京留守，直到去世，也沒能返回朝廷。