黃子文辭別張文華後，到渭南車站，準備下河南繼續做販牛生意。因怕遇到熟人，他特意換了件破棉衣，戴了頂舊帽子，夾雜在眾人中。
真是怕怕處遇“鬼”。黃子文剛一到車站，便碰上了乘車去西安開會的國民黨渭南行署專員史直。史直以老同學的名義，硬纏住他一塊去西安。黃子文再三推辭，史直只是不准，說：“西安有咱們的同學、朋友，多年不見了，一塊敘敘舊，機會難得呀！”黃子文見脫不了身，只好一同上車。
路上，史直問道：“聽說你把劉志丹從渭南救走後，當了紅軍的政治部主任，怎麼落到這麼個結局？”
“我早被開除黨籍了，現在做販牛生意。”黃子文淡淡地說。
“噢，有這麼回事！”史直抬起頭，眼珠一轉道：“老同學，這可太委屈你了。這樣吧，既然你沒事可干，我到西安給你謀個差事！”
“那就托老同學的福了！”黃子文沒想到自己一句話，竟讓史直鑽了空子，只好信口而答。
到西安後，史直要去開會，專門留下一個護兵“招呼”黃子文。
第三天，史直將程建文領來見子文。程建文是省委被破壞後叛變組織的，現在在“三青團”工作。程在任三原共青團書記時，認識了黃子文，並知道黃子文直來直去的性格，今天一見，略略寒喧，便話歸正題，要黃子文寫個脫黨聲明，與他一塊幹事。
子文強笑道：“我早已被開除了黨籍，還寫什麼聲明。我的老婆和孩子尚在陝北，加入你們的組織，豈不害了她母子！”
程建文知道難以說服黃子文，便讓黃子文去他家，想慢慢磨。
黃子文知道擺脫不了史、程的糾纏，便說：“那好，我就留下，省保二團團長魏志毅讓我給他組建一支武裝，我去聯繫一下，還有宋文梅等幾個朋友，我也想會一會。”隨後，黃子文特意邀程建文一起先後拜訪了國民黨陝西省銀行行長王鴻俊、原楊虎城部特務營營長宋文梅及魏志毅等，黃子文在與這些人告別時，總要加一句“今後我在西安干事，還望多加照顧，鼎力協助啊！”這給程建文和被訪者留下了他決定留在西安的印象。
程建文為將黃子文拉入他的團伙，多次要給子文找妻室，均遭拒絕。
幾個月後，黃子文見程建文對他的防範與監視仍未改變，他想搞的一些工作，無法進行。於是，黃子文便與曾在三原中學任過體育教師的曾福印結了婚，並住在她家。又以安家需錢為名，找王鴻俊貸款做倒賣食鹽的買賣。這樣以來，使程建文吃了定心丸，黃子文這才有了行動自由。
同年9月，黃子文通過王鴻俊在三原政界的關係，擔任了陵馬柏嵯四鄉指導員，回到三原陵前。他聽陳玉秀講，劉光遠派聯絡員吳志玉從邊區下來了解他的情況。他高興地說：“看來，黨組織還在關心我這個人。”又叮嚀陳玉秀：“志玉再來，請他轉告劉光遠，我黃子文無論到什麼地步，也絕不做背叛黨和人民的事。”自此以後，黃子文經常來往西安和三原，積極進行革命活動。他多次從西安駐軍處購買子彈，讓弟妻韓秀雲藏於懷中，扮成孕婦運出西安城門，再由弟弟黃子武、馬志軒運回三原。
1945年8週，日本侵略者投降後，國民黨反動派發動了內戰。黃子文意識到：人民當家作主，翻身求解放的日子，還要經過艱苦的鬥爭，才能實現。
在西安，他通過宋文梅、李孟華等人，從國民黨第四集團軍留守處購買長、短槍30餘支，子彈500餘粒，密藏在北大街通濟坊，為重建地方武裝做準備。在三原，他為了便於開展工作，和一些黨員相商，想方設法奪取地方政權機關和群團機構的領導權。通過各種關係，先後將一批共產黨員和進步人士安插到魯橋、長孫、陵前、馬額等鄉公所。以種種藉口，抵制國民黨政府的苛捐雜稅，減輕人民負擔。一次，他從魯橋商會副會長王致道處得知商會準備改選，即與王相商，分頭做工作，將進步人士王振鑫選為正會長，使國民黨涇陽縣黨部常委德軒欲當會長的美夢落了空。從此，商會不僅為革命提供了大批資金，且成為探聽敵情，護送北上人員的聯絡站。共產黨員孫志正擔任陵前鄉副鄉長後，派共產黨員郭立三擔任鄉民代表會主席，從而控制了鄉民代表會。
1946年春，經孫志正、郭立三向國民黨三原縣縣長張法傑上呈，張法傑任黃子文擔任陵前鄉鄉長。黃子文到任後，立即改編了鄉自衛隊，讓一些共產黨員和進步青年掌握了槍桿子。為了掌握更多的武裝力量，他以自己擔任陵、馬、柏、嵯四鄉指導員的身份，使陵、馬、柏、嵯的政權和武裝基本上由共產黨員和進步人士所掌握，為後來的陵前起義奠定了基礎。
同年3月，國民黨在召開了六屆三中全會後，調兵遣將，向解放區發起進攻。在陝西，國民黨政府除了增加包圍陝甘寧沈區的軍隊外，不斷派遣特務，潛入邊區，蒐集我軍情報，暗殺、綁架共產黨員和革命人士。在這種形勢下，黃子文利用自己的特殊身份，多次送出情報，保護了革命人士和地下黨員。一次，他得知三原駐軍聯絡鄉自衛隊，準備襲擊在柏嵯一帶活動的由劉光遠、朱龍江帶領的“武工隊”，便立即派共產黨員孫景元給劉光遠送信，囑咐他們注意安全，警惕敵人伏擊。劉光遠得信後，及時改變了行動方案，保存了革命武裝。
同年6月，敵人在三原召開“渭北肅反會議”，決定捕殺在雲陽等地開展革命活動的崔貫一、馮一航、趙曼青等人。黃子文立即派人送信，讓其“馬上躲避”。
7月，黃子文去渭南辦事，偶爾從曲正平處聽到敵人要殺害張文華、王璋峰，他立即去張文華家告知此事，見張文華不大在意，他急了“沒你說的，你快走！”張文華這才知道情況緊急，出去躲了半年，免遭殺害。張文華至今回憶起此事，仍十分感動地說：“子文是在冒著生命危險救同志的啊！”