1909年5月11日，黃子文出生在陝西省西安府三原縣白鹿原甘露池村一個富裕的農民家庭。
黃子文，又名成章，曾化名王文。祖輩以耕種為業，勤儉操持，家業逐漸興旺。父親黃銘，字敬庵，善於經營，家境富裕，有房、窯二十餘間（孔），土地三百餘畝，耕畜農具齊全，但富而不名，凡向他求助援濟的窮人只要開口，總是欣然答應，立即兌現，因而當地群眾稱“黃善人”。黃銘思想進步，早年參加於右任在三原組織的同盟會。後為維護當地社會治安，自己籌款買了十多支槍，組織了數十人的“農民自強社”，打擊匪盜，保護地方安全。這期間，為了響應孫中山先生的“護法”鬥爭，帶領“農民自強社”參加了駐耀縣曹世英（俊甫）的靖國軍。他崇拜仗義疏財的劍仙俠客，故給長女起名劍仙，二女起名俠仙，又把長子黃子祥送到韶關講武學堂學習。母親王氏，勤勞賢慧，心底善良，在丈夫的影響下，也養成了樂於救濟窮人，熱心幫助鄰里的好品德。
1909年5月，黃銘之妻王氏在有一男二女之後，生了一個胖小子。丈夫在外，她出於“—個男孩，只要能謀生路，父母便無牽掛”之心，給孩子起了個乳名“謀”。黃銘回來後，聽了王氏給孩子起的小名，高興地說：男孩子“足智多謀”、“長於謀略”好呀！這個二小子，就是後來創建渭北革命根據地的黃子文。
1918年，9歲的黃子文在私塾接受啟蒙教育。他的啟蒙先生是個很有文化根底的老人，在教學之餘，愛給孩子講歷史典故，講當地的民間傳說。十歲的黃子文在熟記所授課程的同時，對先生講的垂韁銜環、岳母刺字等故事亦記於心間，從小就懂得了舍生取義、精忠報國的道理。在家裡，父親給他講靖國軍反對帝國主義及其走狗北洋軍閥的革命主張，以及英勇頑強的革命犧牲精神。這一切都在黃子文幼年的心靈上打下了烙印，對他後來在人生道路上的抉擇奠定了思想基礎。