案件結束之後，重案組並未立即返回，因為吳華忠懷疑盧承明也許會與那個神秘的盤古組織有關，於是，在劉暢的配合下，吳華忠對盧承明進行了深入的調查。調查的結果，令人十分吃驚，重案組在盧承明寵物店的保險櫃中找到了幾個假身份證，還有幾張銀行卡。
經過與銀行部門聯繫得知，盧承明在過去的三年期間，賬戶上有三百多萬元來歷不明。這更加引起了重案組的重視，他們立刻申請了搜查令，前往盧承明家中搜尋。在盧承明的家中，重案組查到了一本盤古日記和一部手機，吳華忠翻開日記，而這本日記所記錄的很像是一個女人的生育過程：
2001年11月13日，她受孕成功，這是她今年以來的第三次懷孕，一切正常，只是妊娠反應相對嚴重，相信這種情況還要持續相當長一段時間。
2002年2月6日，B超顯示，子宮內有血跡，可能需要持續保胎，相同的跡象再次發生，恐怕這次受孕又會失敗，一般人的體質還是很難承受他的存在。
2002年10月3日，終於可以長出一口氣，度過了最艱難的一段時間，現在只要保持住，相信一定可以成功的。
2003年5月3日，交接成功，雖然不夠完整，卻已經是近年來最好的一個了。
這是這本日誌最近的一次記錄，重案組的幾個人看完日誌，面面相覷，所謂懷胎十月，為什麼這個胎兒會那麼久之後才出生？
卞虎拿起放在面前的手機，輕輕打開，裡面彈出一條短信，信息上寫道：10月12日，晚上9點，運城賓館，方舟啟航。
“今天是幾號？”卞虎皺著眉向黃怡婷詢問道。
“12號，怎麼了？”黃怡婷疑惑地望著卞虎，卞虎將手機遞給她，說道，“12號，方舟啟航是什麼意思？”
“糟了，應該是盤古組織的人在通知他撤退！”吳華忠驚慌地說道，“現在幾點？”
“8點20！”卞虎看了看表說道。
“走，立刻出發，我們去運城賓館。”說完吳華忠立刻帶著幾個人向外奔去。坐上車之後，吳華忠愣了一下，說道：“沈玄呢？”
“沈玄？”此時大家才注意到，自從昨天晚上的抓捕開始，便一直沒有看到沈玄的身影，之後太過忙碌，直到現在才意識到沈玄不見了。吳華忠隱隱有種不祥的預感。
他太了解沈玄的性格了，更相信沈玄的洞察力，這也是當初吳華忠堅持讓沈玄進入重案組的原因。同時，吳華忠也知道，沈玄這個人太危險了，必須把他留在自己身邊，這是吳華忠留下沈玄的另一個原因。
沈玄的身上有太多的秘密了，一旦沈玄離開，或者被盤古組織利用，後果簡直不堪設想，而現在的種種跡象表明，沈玄極有可能已經去了運城賓館，必須阻止這一切的發生，一定要阻止。想到這裡，吳華忠拍了拍卞虎的肩膀，說道：“加快速度，一定要盡快趕到運城賓館。”
正如吳華忠所猜測的那樣，沈玄的確比所有人都先註意到了這一點，自從發生了魔術師案之後，沈玄的腦海中一直盤桓著于冠雲的那句話：“我和我是一樣的。”這句話就像是一句揮之不去的詛咒，一直縈繞在沈玄的心頭。他發現自己確實與別人不一樣，他對罪獸有一種與生俱來的洞察力，這種洞察力，讓他感到吃驚的同時，也覺得很害怕。
許多時候，他閉上眼睛，甚至能感覺到出現在自己身邊的罪獸所散發出來的氣味，以及它們的呼吸、它們的思想。
而讓沈玄改變最大的，還是河神案。當他為了救黃怡婷，與河神一起墜入冰冷刺骨的河水中的時候，沈玄的腦海中閃過一些從未有過的影子，那些影子熟悉而陌生，他們是沈玄所熟悉的人，但是沈玄為什麼從來不記得有他們的存在呢？河神在自己身邊遊走，它對沈玄勢在必得，而沈玄那時卻已經虛脫無力，雙眼微微閉上，等待死亡的到來。
然而，就像是冬眠，沈玄沉沉地睡去，當他醒來的時候，就像是做了一場噩夢，自己出現在一片荒草地上，和煦的陽光照在他的身上，他睜開眼睛，所有發生的一切，又在他的腦海中被抹去了。
再次回到重案組，沈玄心中只有一個希望，找到魔術師于冠雲所屬的那個神秘的組織——盤古。而毒狼的出現，讓沈玄產生了太多的疑惑，盧承明是絕對不可能馴服罪獸的，在他的身後很有可能存在盤古的影子，於是在重案組圍捕毒狼的晚上，他悄悄地來到了盧承明的家中，並且找到了那個筆記本和那部手機。
這麼多年來，沈玄一直在追查著殺害女友的真兇，而現在他更想知道于冠雲那句話的含義，所以這恐怕是他唯一接近盤古的機會，他絕對不能錯過。
於是沈玄悄悄地離開了重案組，帶上槍，獨自一人來到了運城賓館。運城賓館是運城市最豪華的賓館，賓館前面停著很多豪車，這些車在別處可能罕見，但是在運城這個礦業發達的新興城市並不為奇。
他掏出警官證，在前台查詢了運城賓館808房間的登記入住客人名字，當他看到那個名字的時候，不禁身體猛然一顫，那個客人不是別人，正是于冠雲。于冠雲，那個魔術師，因為墜樓事件至今依然昏迷不醒地躺在病床上，那麼這個于冠雲必定是假的。知道于冠雲的名字，那麼這個入住人肯定是盤古組織的人。
沈玄進一步詢問後，得知于冠雲只是提前兩天預訂了該房間，但是迄今為止並未入住。沈玄有些失望，他詢問了一下，得知隔壁807房間沒有客人預訂，於是他交了訂金，下午的時候便住進了807房間。為了不打草驚蛇，沈玄從進入807房間之後，便再也沒有出去。他將窗簾拉上，站在窗簾的縫隙裡，小心地向外張望，尋找可疑的人。正如于冠雲所說，“你是和我一樣的”，如果出現和自己一樣的人，沈玄相信自己能夠感覺得到。
時間一分一秒地流逝，沈玄從下午一直站到晚上，可是始終沒有發現任何可疑人員。他感覺有些累，倒在床上，側著耳朵，傾聽著隔壁的動靜。方舟啟航，方舟究竟是什麼東西？
最讓沈玄疑惑的還是那本盤古日誌，那上面記錄的只有一個不太正常的女人的妊娠過程，難道那日誌中還隱藏著什麼自己看不出來的信息？沈玄想著，忽然他想起來，在周心如案件中，之所以會鬧醫，是因為嬰兒的丟失，極有可能李薇和孫珊珊都參與了那次事件，而在盤古日誌上的最後那句話“交接成功”，難道所指的交接也是嬰兒？難道這所謂的盤古組織真的與那些嬰兒有關？
夜幕降臨，天也已經黑了下來，沈玄沒有開燈，躺在床上，屏住呼吸，他的大腦在飛速旋轉，想將自己所知道的所有細節聯繫起來，然而卻只有支離破碎的片段，他感覺有些頭疼。正在這時，沈玄的耳邊傳來了一陣輕微的腳步聲，沈玄掏出手機看了看，此時正是晚上9點。
沈玄屏氣凝神地站起身來，悄悄走到門口，透過貓眼，看到一個男人鬼鬼祟祟地走到808房間門口，然後輕輕地打開房門。時機終於成熟了，這是沈玄這麼多年一直在等待的時刻，他有些激動，但是卻在極力按捺著自己的情緒，他輕輕轉動門把手，打開門，走出來之後站在808房間門口。他咽了嚥口水，掏出槍，打開保險，在心中默數幾個數，然後猛然一腳上去踹在門上，房門應聲而開。 808房間內漆黑一片，沈玄伸手摸到門口的開關，輕輕按下，瞬間房間亮了起來，而沈玄看著房間中的一切，整個人都怔在了原地……