萬曆二十五年正月十三日，加藤清正率領兩百多條戰船、一萬陸軍從對馬島出發，於十四日抵達竹島，與竹島的日本留守部隊匯合，從釜山東側的機張登陸，當天前鋒便攻陷了釜山以北的重鎮梁山。
他的這次行動，標誌著暫停了四年的明日戰爭再度爆發。萬曆二十五年是丁酉，因此中國與朝鮮稱之為丁酉再亂；而日本則用當年的天皇年號，稱之為慶長之役。
這一次與壬辰之戰不同的是，加藤清正的番號，不再是第二軍團，而是第一軍團。這份榮耀，既是秀吉對他在伏見城奮不顧身救主的褒獎，也是小西行長失去信任的直接體現。
到了十五日，小西行長——現在他是第二軍團了——的一萬四千人進入釜山外洋，並在豆毛浦登陸。相比起第一軍團的張揚，第二軍團的再臨十分低調，登陸以後沒有急於打仗，而是在釜山城內外深挖洞，高築牆，搞起了工程建設。
小西行長也沒辦法，他之前那個錯誤犯的太大了，大到一直到現在他摸摸自己脖頸都涼嗖嗖的。他之所以還能以第二軍團的身份再度出征，一方面是因為他的軍團擁有豐富的對朝作戰經驗，秀吉不會忽視這一點；另外一方面，小西行長走了夫人路線，拼命討好淀姬。淀姬為秀吉生下秀賴，地位紅得發紫，她稍微吹了吹枕邊風，便讓秀吉打消了讓小西切腹的念頭。
加藤清正和小西行長登陸以後，各自給朝鮮人發了一道告示，告示的內容大同小異，基本上用一句話能概括：“我胡漢三又回來了。”
不過第一、二軍團登陸以後，除了佔領梁山以外，暫時沒有採取其他動作。加藤清正屯兵西生浦，小西行長返回釜山城，表現得很安生，與上一次登陸的張狂完全不同。
上一次登陸，狂妄的日軍根本沒把大明和朝鮮看在眼裡，滿心打算兩三個月靠閃擊戰滅亡朝鮮再進攻北京。經過一年的正面作戰和四年的對峙，日本人對明軍的實力和明軍保衛朝鮮的決心都有了清楚的了解，早已放棄不切實際的幻想，腳踏實地，認認真真要和明軍打一場拉鋸戰。
第一、第二軍團的總兵力達到了兩萬多，但這些兵力還遠遠不足以與大明抗衡。
因此，加藤清正和小西行長的首要任務，是鞏固日軍在釜山附近的防守，確保後續部隊渡海登陸的安全。等到諸軍齊至，糧草與裝備都儲積完畢，日軍才會徐徐展開，開始進攻。
二月二十二日，秀吉下達了總動員令。於是除了加藤清正、小西行長以外，陸續趕赴朝鮮戰場的還有小早川秀秋（代替已隱居的養父小早川隆景）、黑田長政、鍋島直茂、毛利秀元（代替了已患病的養父毛利輝元）、宇喜多秀家、島津義弘、蜂須賀家政等西國大名。日軍的入朝總兵力約十二萬人，要少於壬辰之戰的十五萬人。
就是這十二萬人，秀吉也沒法一下子湊出來，必須得分批次前往朝鮮。島津軍團在五月一日才正式駐屯加德島；小早川秀秋軍團一直拖到五月二十二日才從大阪出發，抵達釜山已是七月十七日；毛利秀元、宇喜多秀家兩個大軍團合計有四萬人，到了七月二十七日才開始渡海。跟壬辰戰爭跨海時一氣呵成的銳氣相比，這次派兵的效率簡直就是山羊拉屎——稀稀拉拉。
截止到丁酉年六月，日軍的部隊配置在西生浦（加藤部）、釜山（小早川秀秋、宇喜多秀家、毛利秀元部）、加德城（島津部）、安骨浦（毛利吉成部）、竹島城（鍋島父子）和熊川城（小西部），日軍主力鏖集於沿海列島。
從這兩次出征兵力的數量差異和動員效率，很容易便能推想出日本已是力不從心，自身經濟很難再支撐一場大規模跨海戰爭——何況他們要面對的，是實力百倍於日本的大明。除了那個自大狂秀吉以外，從東國霸主德川家康到豐臣家心腹石田三成，沒人看好戰爭的前景。
秀吉也知道東國和近畿大名的不滿，所以這一次沒有勞動他們，主力部隊完全由豐臣嫡系和毛利、島津兩係部隊組成。
這一次出征陣容之中，特別值得注意的是島津家。島津家在壬辰之戰中隸屬於第四軍毛利吉成，毛利吉成這次不知道為什麼沒來，島津家一萬三千人成為一支獨立作戰兵團，由家主島津義弘統率。這個小小的人事變化，後來卻成為了決定丁酉再亂的一個關鍵因素，這個容後再說。
這一次出征陣容之中，特別值得注意的是島津家。島津家在壬辰之戰中隸屬於第四軍毛利吉成，毛利吉成這次不知道為什麼沒來，島津家一萬三千人成為一支獨立作戰兵團，由家主島津義弘統率。這個小小的人事變化，後來卻成為了決定丁酉再亂的一個關鍵因素，這個容後再說。
總之日軍這一次的襲來，看似氣勢洶洶，實則中氣不足，虛得很。他們登陸之後隻死死咬住一個字：拖。一定要拖到主力登陸，千萬不能讓日軍聚齊之前，被明軍和朝軍率先進攻，各個擊破。
對於日軍的再度襲來，朝鮮人這次反應倒是很快，加藤清正一登陸，附近的守軍便連滾帶爬地跑回漢城去匯報。
經過那場幾乎亡國的戰爭以後，朝鮮君臣對日本和朝鮮軍事實力也有了足夠清醒判斷，知道朝鮮兵根本靠不住，大明在朝鮮半島的那點兒駐軍也不夠使，還得指望大明像上次一樣發大軍前來才行。為此，朝鮮採取了一個方略，拖。一定要拖到明軍入朝，千萬不能讓日軍先發起攻擊，再演一次從漢城逃亡的悲慘經歷。
於是李昖半點猶豫都沒有，立刻派遣使者前往遼東和北京求救。在慶尚道，朝鮮人花了四年時間修了數道防禦工事，希望能夠層層阻截日軍，遲滯他們的進攻速度——朝鮮人著實是被上次小西與加藤的大暴走給嚇怕了。
與此同時，他還請僧兵之祖休靜大師的繼承人惟政前往西生浦，跟加藤清正談判，能拖日本人一陣算一陣。
惟政作為第二代“八道僧兵總管”，在壬辰戰爭中也浴血奮戰過，根本不怵加藤清正。兩人在西生浦見了面，各說各的話，加藤說朝鮮人沒誠意，惟政說日本人沒道義，誰也說服不了誰。說到最後，加藤也不想正經談了，隨口問惟政朝鮮國有什麼寶貝。惟政回答說有啊，就是將軍您的腦袋，您舍給我算啦……
而大明此時在幹什麼呢？
就像前頭我們說的那樣，大明那時候還沒從沈惟敬的“國際玩笑”中回過神來，正忙著捋清“封貢”背後到底有多少貓膩。一直到朝鮮人的陳奏使把日本入侵的戰報送過來，朝廷才如夢初醒，
不過這一次大明出兵的決定速度，比壬辰戰爭前那一波三折的磨難快太多了。在沈惟敬的騙局敗露之後，萬曆皇帝立刻委派郉玠、楊鎬、麻貴三人籌備援朝事宜。
這次人事安排能看得出萬曆是煞費苦心。上次援朝明軍的領導班子是宋應昌與李如鬆一文一武，等級差不多，誰也制不住誰，石星又遠在背景，結果搞得文武互相鬥法，烏煙瘴氣，險些誤了大事。萬曆吸取了上次的教訓，在經略和提督上頭增設了總督。經略負責後勤統籌，提督負責前方作戰，總督負責管著經略和提督，不許他們鬧矛盾——可惜這個設計後來沒有完全得到實現。
開戰之前，大明在朝鮮半島的駐軍已經所剩無幾。前線只有楊元駐南原的三千人馬，還有吳惟忠為數不多的南兵。派兵勢在必行，而且不能少派。
可動員軍隊是一件極耗時間的事，從決定出兵到真正出兵，中間不知要多少時日。因此大明在這期間的方略也只有一個字：拖！一定要拖到明軍完成動員，大軍入朝，糧草都運過去，千萬不能等到朝鮮亡國了，再讓明軍從平壤從頭打起……
於是在萬曆二十五年的朝鮮戰場，出現了這樣一番有趣的場景：儘管戰爭在一月十四日已經開始，可參戰的三方誰都不希望戰爭進度太快，大家都很默契地保持著克制，源源不斷地積蓄著力量，使得丁酉再亂的前半年時間，顯得相當和平與安詳，很有後世歐洲“靜坐戰”的風範。
其實北京還有另外一個構想，就是在朝鮮屯田。壬辰戰爭期間明軍吃夠了糧草不足的苦頭，朝鮮人又不擅治劇，四年積蓄以來，糧草積儲仍舊不足。懲於這種原因，在明廷決定出兵以後，內閣提出一個建議，希望能在開城、平壤開府，按照大明地方選派官員進行管理，進行屯田。
換句話說，就是成立開城與平壤經濟特區，交給明朝官員按照明朝規矩託管，等到戰事結束以後，再交還朝鮮。這個建議從實效來說，能夠極大改善後勤狀況，很有吸引力——可是地方政權更迭涉及到主權問題，太過敏感，所以萬曆特意寫信給李昖，解釋了一下，表明大明沒別的意思，就為種點糧食，只要打完仗就還給朝鮮。
李昖接到這個請求，悄悄叫來柳成龍商量。柳成龍一聽，當即斷然表示拒絕：“元朝設征東省於昌原，而久留貽弊；今此奏文，不須斷然防之，只陳難行之事可矣！”居然拿大明與元朝相比，可見所謂的“小中華”，對大明也不是全然信賴，心裡還在打著自己的小算盤，生怕被吞併。至於屯田帶來的好處，他們不在乎或者假裝沒看見，反正那是明軍的問題。
李昖接到這個請求，悄悄叫來柳成龍商量。柳成龍一聽，當即斷然表示拒絕：“元朝設征東省於昌原，而久留貽弊；今此奏文，不須斷然防之，只陳難行之事可矣！”居然拿大明與元朝相比，可見所謂的“小中華”，對大明也不是全然信賴，心裡還在打著自己的小算盤，生怕被吞併。至於屯田帶來的好處，他們不在乎或者假裝沒看見，反正那是明軍的問題。
屯田的事就這麼被朝鮮委婉地拒絕了，到了開戰時，漢城把附近京畿道所有的口糧加種子多划拉到一起，存糧不過二十二萬石米，二十二萬石豆，打起仗來還得仰仗大明從山東和遼東運糧過來。
朝鮮求援的書信送到北京，大明朝廷上到萬曆，下到言官都頗為不平，覺得朝鮮人實在有點不識抬舉。早幫你你不要，房子著火了你倒湊過來藉水桶。朝廷為你國耗費錢糧軍馬，你們就這麼不信任我們？咱們後面能看到，邢玠因為別的事給朝鮮國王下文申飭，口氣十分惡劣，帶著一種不耐煩的情緒，根子就在於熱臉貼了冷屁股的結果。
屯田的事黃了，那麼只能換一種辦法去拖延日本人。楊鎬在戰爭行將爆發前的五月，煞有其事地給秀吉寫了一封信，勸誡他盡快收兵回國。
他在信中寫道：“爾已六十餘歲，壽命幾何？子未足十齡，孤弱何恃？聞各島之酋，俱覘爾隙，欲為複仇，報怨之舉……一旦諸島內變，若蕭牆禍起，清正諸將，各個思欲為王，豈肯各居爾下耶，將來又肯居爾子之下者也！”
你已經六十多歲了，還能活多久？你兒子連十歲都沒有吧？萬一你死了，他們孤兒寡母靠誰去？你們日本島上大大小小的諸侯，都等著你死了以後報仇呢。萬一那些人野心勃勃打起來，就是一場不得了的內戰，加藤清正那些人肯定各個都想當草頭王，都不會甘居你之下，更不會甘心在你兒子，到時候可怎麼辦喲。
楊鎬的預測，與秀吉死後的日本局勢驚人地相似。先是加藤清正與石田三成的決裂，然後是東、西軍在關原的會戰，最後德川家康一步步逼近龜縮大阪城的豐臣秀賴與淀姬，結束了短命的豐臣政權，開創了德川幕府。
這倒不是什麼特異功能。只要是人類社會，無論國情、政治體系、文化經濟、意識形態的差異有多大，政治和利益的運轉規律都大抵相同。楊鎬這樣浸淫於大明官僚體系許多年的專家，打仗不見得行，搞這一套分析那是行家里手。
歷史上沒留下秀吉看到這封信的反應——以秀吉那時的心性，估計看了也是嗤之以鼻——他更沒有因此而中止戰爭的步伐，實在可惜了這一封預言書。
很快時間便推移到了七月十五日，丁酉再亂的第一個高潮。
從萬曆二十五年年初開始，日軍部隊源源不斷地從九州經對馬島登陸朝鮮，持續了半年多的時間。這是日軍最虛弱的半年，如果能夠在對馬與釜山之間的洋面予以截擊，輕則打亂日軍部署，重則直接廢掉日軍的這次攻勢。
要做到這一點，需要有一支強大的水軍。
這可真是撞到槍口上了。
朝鮮別的什麼都缺，惟獨不缺強大的水師。儘管李舜臣不在了，但朝鮮水師還是原本人馬，中層與基層指揮官都是身經百戰的老兵，艦船陣容比壬辰時還要龐大許多。
可奇怪的是，從一月十四日到七月十四日這六個月時間裡，朝鮮水師卻是紋絲不動。
在這寶貴的六個月時間裡，朝鮮水軍幹嘛去了？
別忘了，他們有一位號稱“自沉大將軍”的統帥——元均。
元均在這六個月時間裡，只做了一件事：搗亂，給自己人搗亂。
他接替李舜臣以後，把之前李舜臣所有的規矩都廢除了。這個心理可以理解，新官上任嘛，不否定前任怎麼體現自己的能耐？關鍵是，廢除了舊規矩以後，元均根本沒能力拿出新的水軍條例來代替，這一下子整個朝鮮水軍處於既無規矩也無條理的混亂狀態。偏生元均還剛愎自用，極其敏感，誰敢有半點怨言，就立刻大板子招呼過去，搞得水軍個個人心惶惶，士氣以極快的速度跌至谷底。
面對這番亂象，元大都督根本不予理睬，每天只知道酗酒和大吃大喝。他一頓飯能吃多少呢？史料記載是一斗白米飯，五條魚、三四隻雞，可以算得上是海量了。六個月胡吃海塞下來，朝鮮水軍亂象橫生，元均自己倒吃成了一個大胖子，連走幾步路都氣喘吁籲。
古今中外的無能將領有很多，但像元均這種全身心無能到如此徹底的，還真是不多見。
這邊廂元均吃得腦滿腸肥，那邊廂日本已經開始磨刀霍霍，打算拿朝鮮水軍開刀了。
朝鮮水軍在壬辰戰爭期間威名赫赫，打得日本人聞風喪膽，秀吉以下惶惶不可終日。即使如今李舜臣已經被幹掉了，可日軍仍舊不敢小覷這支群龍無首的海上雄師。為了能夠徹底打垮朝鮮人的艦隊，日本幾個方面軍破天荒地開始了聯合作戰，制定了一個相當毒辣的“朝鮮艦隊攻略作戰”計劃。
這個攻略計劃仍舊由小西行長開局。
朝鮮水軍在壬辰戰爭期間威名赫赫，打得日本人聞風喪膽，秀吉以下惶惶不可終日。即使如今李舜臣已經被幹掉了，可日軍仍舊不敢小覷這支群龍無首的海上雄師。為了能夠徹底打垮朝鮮人的艦隊，日本幾個方面軍破天荒地開始了聯合作戰，制定了一個相當毒辣的“朝鮮艦隊攻略作戰”計劃。
這個攻略計劃仍舊由小西行長開局。
小西行長首先派出了金牌小細作要時羅，讓他再次前往慶尚右兵使金應瑞的營中探訪。金應瑞一見要時羅來了，十分親熱，好酒好肉地款待——要知道，當時李舜臣剛被貶謫，朝鮮方面仍舊認為要時羅上次送來關於加藤的情報是真的，也就仍舊天真地認為他是朝鮮人民的老朋友。
要時羅酒足飯飽，告訴金應瑞：日本將於近期對釜山展開一次大的增援行動，會有大批物資運抵朝鮮。如果朝鮮水軍能夠於半路截擊，將會大有收穫。金應瑞不虞有詐，立刻把這份情報通報給權憟，權憟當即通知元均，讓他尋機殲敵。
元均其實並不太願意動彈，可李舜臣正是因為不願出擊而被彈劾，自己如果也按兵不動，搞不好會被柳成龍他們以同樣的理由弄下去，那可就太虧了。
權衡再三，元均終於不太情願地帶著朝鮮水軍出發。為了確保萬一，他把三道水軍的主力都帶上了，足有船艦四百餘艘，浩浩蕩盪地逶迤一路。
而這一切，早被日軍安排在附近山頭的間諜看得一清二楚，朝鮮水師出擊的消息，很快傳回釜山本陣。小西行長寫了封信：“敵人已經到，接下來看你們的了。”收信人是藤堂高虎、加藤嘉明、脅坂安治。
七月初八，元均所部來到了熊川前洋，這裡距離釜山已經不遠了。前鋒慶尚右水使裴楔帶著兩條大船與島津家的幾條海哨遭遇，裴楔很快打敗了，還搶到了兩百多石糧草。元均一聽，膽子大了一點，傳令全軍前進至絕影島附近海域。
到了絕影島附近，忽然急促的警報傳遍了整個朝鮮艦隊：“日軍千餘艘船，蔽海而來！”。
元均一聽，樂了，這大概就是要時羅說的日軍補給艦隊了吧，可又過了一陣，他發覺不對勁了。日軍這些黑壓壓的全是戰船，甲板上裝的不是糧草，而是盔明甲亮的日本武士。
這支艦隊，是日本新水師——因為老的已經被李舜臣燒得差不多了——的主力部隊，以藤堂高虎、脅阪安治、島津忠恆為先鋒，加藤嘉明為後援，還安排餓了鍋島勝茂作為預備隊，總兵力達到了五六千人，這些李舜臣的手下敗將摩拳擦掌，準備一雪前恥。
為了這次攻擊能夠順利進行，日本水師下了血本，不僅艦船七成以上都是和談期間造的新船，而且連指揮系統都做了變更：不再像從前幾個小大名帶著不同籍貫的海賊各自為戰，而是統合到了一起，給了一個第六軍團的番號，以長曾我部元親作為統帥，行動效率較之以往大幅提高。
一見日軍氣勢洶洶的陣勢，元均居然不害怕，下令迎擊。他跟在李舜臣後頭也打了好幾仗，早克服了對日軍的恐懼心理，擁有心理優勢。按照他的想法，同樣一批艦隊，李舜臣那個小癟三都能打敗日本人，我為什麼不能？
可元均偏偏忘了，為將者要審時度勢，具體情況具體分析，戰法不能一概而論，李舜臣帶兵，每一戰都是精密籌劃，從來沒有說只要一看見日本人就拉竿子上。
當時朝鮮軍的所在位置是絕影島與大陸之間的狹窄海域，而日軍是自上風處自東向西進攻。這日、朝近一千條船簇擁在如此局促的海域，誰也無法展開陣形，最終會演變成一場混戰——而朝鮮水軍的作戰習慣，或者說李舜臣的作戰習慣，是在寬闊洋面以高效率的陣形跟敵人打運動戰，利用自己船大火器犀利的遠程優勢消滅敵人。
所以這時候，朝鮮水軍應該做的事情，是撤退。
這一點元均沒看出來，有人看出來了。
這一點元均沒看出來，有人看出來了。
先鋒官裴楔是李舜臣麾下的老人，對海上戰法十分熟稔。他見勢不妙，對元均說此時風高浪急，又趕上陰天，而且絕影島海域狹窄，不宜倉促應戰，應該後退觀望。
可元均膽色上來了，壓根不聽裴楔的建議，仍舊堅持進攻。
既然主帥堅持開戰，要打就打唄，總比自己鑿沉了強。於是朝鮮水師一邊嘟囔著自家主帥的“光榮”戰績，一邊緩緩展開隊形，按照李舜臣制定的作戰條例準備戰鬥。
這時候元均又開始添亂了。他看到遠處日軍的戰艦不斷增多，不斷靠近，開始心虛了。他不斷地下達各種命令，一會兒要求來個鶴翼陣，一會兒又下令編個雁行，過了一陣又改主意了，讓全軍環繞在旗艦周圍。
要知道，朝鮮水師規模不小，絕影島附近又狹窄，因此每一次陣位的調動都要大費周章。元均的這些前後矛盾的命令，讓水軍無所適從，疲於奔命。這個時候，就體現出統帥的重要性了。元均這個大外行的命令前後不一，讓朝鮮水軍一會兒進，一會兒退，再好的隊伍，也經不起這麼折騰。
等到了日、朝艦隊差不多要接戰的時候，元均看著水面密密麻麻的船隻，忽然想通了，他意識到裴楔言之有理，連忙下達了一個讓全軍大吃一驚的命令：後撤。
可這時候跟剛才情勢不同，敵人已經壓了上來，後撤只會自亂陣腳。可元均是一軍之主，水師又是一個極其講究紀律性的團隊，朝鮮艦隊沒有別的選擇，只得硬著頭皮後退。
萬幸的是，李舜臣給日軍留下的陰影太大了。一直到現在，日本水軍仍舊沒有下決心進行突襲——他們以為即便李舜臣不在，他一手調教出來的艦隊戰鬥力仍舊很可怕，日本水軍不想用“一次敵傷一千我損八百”的硬戰打垮朝鮮軍。
於是日本人尾隨著朝鮮艦隊前進，既不靠得太近，也不離得太遠。
一方退的莫名其妙，一方跟得有耐心，就這樣，雙方的陣線逐漸移到了位於釜山西側的加德島海域。托元均的福，朝鮮水軍的櫓手一直徒勞地把碩大的板屋船與龜船劃來劃去，做了一大堆無用功，已經累的精疲力盡，連手都抬不起來了，船隊不得不把速度降下來。
這個破綻，很快被藤堂高虎發現。他一改以往的冒進，顯得十分謹慎，沒有吩咐全軍展開突擊，而是把船隊分成幾十個小分隊，分散開來，對朝鮮艦隊進行襲擾。
數百條生龍活虎的日本小船開始無休止地突進，放槍放炮，等到敵人轉向反擊的時候，又急速掉頭，飛快撤退。朝鮮的大船劃不動，但又不能不動，結果就像是一個跟隨日軍節奏舞動的拙劣舞伴，被牽著鼻子一步步帶入混亂之中。
這一場戰鬥的強度不大，持續時間卻非常長，一直到了日落方才結束。朝鮮水軍的損失沒多少，但整個陣形卻被完全折騰散了。三百多條船東、西一堆地分佈在洋面上，散亂不堪。
元均花了好大力氣，才把這些船隻收攏到一處。此時朝鮮水軍的承受能力已經到達極限，他們劃了整整一天的船，喝光了攜帶的淡水，現在口乾舌燥，根本無力再戰。
元均沒辦法，只得下令全軍就近在加德島登陸，諸軍依次下船登島汲水。可當第一批四百名水軍踏上加德島時，忽然四周鐵炮轟鳴，喊殺四起。原來日軍早已在此埋伏了大批士兵，專等朝鮮人上鉤。這一戰毫無懸念，四百餘名水手被全數殺死，無一倖存。
面對巨變，元均駭得亡魂四冒，當下也不休息了，拽著全軍一口氣撤到了巨濟島附近的漆川梁，這才停下腳步。日本水軍這次表現得彬彬有禮，並未進行認真追擊，只是略作鼓譟，當即收兵回營。
能看得出來，日軍這一次並未打算硬拼，他們的目的只是為試探朝鮮軍虛實，看看沒有李舜臣的水師戰鬥力會下降到什麼程度——答案令他們很滿意。
日本將領很滿意，朝鮮將領就會不滿意。
朝鮮都元帥權僳在接到戰報之後，特別不高興：三道水軍傾巢而出，居然毫無戰果，反被敵人逼退了數百里，這實在說不過去。在他的戰略構想裡，必須要第一時間癱瘓日本水軍，斷絕日本赴朝的運輸線路。元均這麼一再退縮，實在不符合朝鮮水軍以往的威名。
為此，七月十一日權僳親自從南原趕往固城，把元均叫了過去，沒鼻子帶臉痛罵了一頓，說國家給你那麼高工資，你光知道吃喝玩樂？你如果再這麼下去，就等著死吧！誰也幫不了你！罵完以後，權憟還叫人拿來板子，劈裡啪啦給他痛打了一頓。
元均捂著屁股灰溜溜地返回艦隊駐地，他極好面子，當眾受了這麼大羞辱，心情可想而知。可是權憟已經下令反攻，他不敢回麗水軍營，只得讓全軍漂蕩在巨濟島附近。元均在這期間做了什麼呢？不是積極偵查敵人動向，也不是與部下討教水戰之道，從頭到尾他只下了一道命令：“進據釜山”，沒有詳細指示也沒有後續規劃，其他時間就只是每天關起門來獨自喝悶酒，喝完了倒頭就睡，誰也見不著他。
朝鮮水軍就在這種荒謬的情況下，稀里糊塗地第二次前往釜山附近。
七月十四日，他們又遭遇了日軍的主力艦隊。不過這次日軍只有五百艘船，一看到朝鮮水師的影子，立刻四散而逃。元均大喜，信心又恢復了一些，連忙下令艦隊追擊。
這個命令遭到了全軍上下的反對，所有人都認為，這麼一路不知虛實地追下去，實在太危險了。
這其中有客觀原因，也有主觀原因。客觀原因是元均從水工櫓手那裡聽到的：“水嶺已過，馬島將迫，運舡失便，我無生道，千萬水兵，未剿一賊而自蹈大禍，今日之事，誰任其咎？”
至於主觀原因，則是所有人都對這位大爺的指揮能力徹底喪失了信心，與其跟著他打，還不如不打……
七月十四日，他們又遭遇了日軍的主力艦隊。不過這次日軍只有五百艘船，一看到朝鮮水師的影子，立刻四散而逃。元均大喜，信心又恢復了一些，連忙下令艦隊追擊。
這個命令遭到了全軍上下的反對，所有人都認為，這麼一路不知虛實地追下去，實在太危險了。
這其中有客觀原因，也有主觀原因。客觀原因是元均從水工櫓手那裡聽到的：“水嶺已過，馬島將迫，運舡失便，我無生道，千萬水兵，未剿一賊而自蹈大禍，今日之事，誰任其咎？”
至於主觀原因，則是所有人都對這位大爺的指揮能力徹底喪失了信心，與其跟著他打，還不如不打……
元均雖然剛愎自用，但一聽到“今日之事，誰任其咎”八個字，立刻就不傻了。這種擅於鑽營的人，對責任最為敏感。他知道士氣已不可用，索性從善如流，立刻下令全軍迴轉。
可此時洋流處於逆向，艦隊活動十分艱難，在撤退途中，全羅水營的七條大船飄散到了東海深處。這是一個不祥之兆。
朝鮮軍一退，藤堂高虎又開始不遠不近地跟上來，像一頭跟隨著負傷麋鹿的狼，隨時準備撲上來咬一口。
朝軍水師徐戰徐退，又退至加德島附近。這次元均學乖了，不敢派人登島補給，而是讓艦隊北移，靠近大陸的永登浦。誰知道這一步早就在日軍預料之中。藤堂家和島津家已經派了五十條快船，載著大批士兵先搶到永登浦附近埋伏起來。結果朝軍在永登浦再一次遭遇伏擊，損失慘重。
元均嚇得連救援都顧不得，揚帆，一口氣後撤到了溫羅島附近，最終又回到了巨濟島北側的漆川梁駐留。而日軍則繼續如影跟隨，分成許多小隊不斷襲擾。
這次戰鬥的過程，和數天前的戰鬥過程幾乎如出一轍。藤堂高虎已經摸透了元均膽小怯懦、猶豫不決的個性，故意在反复拉鋸戰中消磨朝軍的體力，等待著他們犯下更多錯誤。
漆川梁位於巨濟島與半島大陸之間的馬山灣附近，附近有漆川島，距離安骨里城和鎮海都不遠。這里海域狹窄，水深頗淺，並不適合朝鮮水軍駐屯。但元均不知為什麼，非要停留在這裡不可，怎麼勸都不聽。
七月十五日，朝、日兩軍圍繞著漆川島持續了一整天的低烈度戰鬥，朝鮮水軍處於劣勢，但尚不致崩潰。雙方一直到太陽落山方才收兵休戰，疲憊不堪的元均把所有的將領都集合過來，神情沮喪地說：“現在情況如此艱難，只怕咱們只有殉國一途了。”
裴楔一听就火了，說我軍連續打輸了好幾場，士氣沮喪，已無再戰之力，不如及早撤退保存艦隊實力。裴楔的建議從軍事角度上來說是對的，海軍的價值在於“存在”，只要艦隊還在，哪怕麗水丟了，都還有機會東山再起。
但從政治角度來說，這個建議最糟糕不過。元均若是就這麼回了麗水，等待自己的將是無數的彈劾奏章，到時候別說柳成龍不會放過自己，尹鬥壽也不會幫一個落水狗。
元均想到這裡，擺了擺手說：“死而後已，汝勿多言。”裴楔一聽，知道這人油鹽不見，索性不談了，回去偷偷跟自己手底下的十二條船商量撤退的事。
十六世紀的海戰，基本上都是白晝戰，一到晚上海面會變得極黑，缺乏遠光照明設備的船隊連保持隊形都很困難，遑論作戰。因此基本上兩軍一打到太陽落山，就很有默契地各自休戰，有什麼事來日再說。因此“夜間不戰”，是屬於這個時代水軍的常識，
元均和朝鮮水師認為這是理所當然的常識，可藤堂高虎不這麼認為。
十五日深夜，元均睡了，藤堂高虎沒睡，他派了自己侄子藤堂高刑和一個叫箕浦忠光的心腹，帶著二十幾條叫做鼻居舠的小船，悄悄地潛伏在朝鮮水師船之間。當時夜裡太黑，朝鮮水師的警戒又很鬆弛，居然被這些小船悄無聲息地貼近了數艘巨艦。鼻居舠，顧名思義，船的一頭高高翹起來，像是一隻鼻子，正好可以貼到大船的側舷吃水線上部，而且這些船裡裝滿了引火之物，幹什麼用的一目了然。
藤堂高虎又派了一支分艦隊，冒著走散的危險繞到朝鮮水師的身後去，這才安心睡去。
七月十六日黎明一破曉，忙碌了一夜的日軍突然發動了突襲。
突襲的第一彈是來自於鼻居舠。這些小船突然出現在艦隊之間，把鼻子緊緊貼在許多板屋巨艦之上，然後引燃了熊熊大火。而藤堂高刑等人則趁此機會，用鐵鉤鉤住船首，爬上去殺光甲板上的人，再放火。
此舉讓許多艦船幾乎同時冒起黑煙，彼此不能相顧，引發了極大的混亂。猝不及防的朝鮮人剛睡醒就遭到了這麼強烈的打擊，都紛紛爭先恐後地調轉船頭，想離開這一片火勢。元均的旗艦連連擊鼓鳴鑼，試圖示警，反而起了反作用，讓船隊更為驚慌。
如果是李舜臣處於這種狀況，和元均做同樣的事情，麾下士兵肯定會慢慢鎮定下來，向旗艦靠攏。可惜元均不是李舜臣，他的警報只會讓軍心更加動搖。由此可見，平日里培養士兵對指揮官的信心，是一件多麼重要的事情。
在這一片混亂中，日軍嗷嗷地從前後兩個方向衝了上來，登時槍聲大作，硝煙四起，密集的彈丸像暴雨一般落在朝鮮艦隊頭頂，整個洋面都被火焰與鮮血覆蓋。被夾擊的朝鮮水師潰不成軍，不得不各自為戰，兩軍的船隻雜亂地穿插到了一起，完全陷入一場混亂——或者按照英國海軍的叫法，DOGFIGHT。
前面說了，朝鮮水軍的優勢是遠程火力加運動戰，現在卻被日軍欺近搞埋身白刃戰，讓對手發揮出了單兵戰鬥力強勁的優勢，勝負之勢，一望可知。
此時朝鮮軍裡唯一還保持理智的，只剩裴楔一個人。他早就約束部下做好跑路的準備，見勢不妙，立刻帶著十二條船撥轉方向，準備撤退。元均遠遠看到裴楔臨陣脫逃，下令把他攔住。可這時日軍的突襲已經開始，誰也顧不得誰了。
藤堂高虎成功地把朝鮮軍拖入亂戰之後，格外興奮，親自揮刀殺上去，專挑個頭大的砸；另外一位敗軍之將脅阪安治更是身先士卒，浴血奮戰，前後親自奪取的戰艦就高達十六條。
加藤嘉明原本是擔任後軍，一直在兩軍接戰後才叢趕到。他一看這陣勢，心想不行，不能讓藤堂搶了太多功勞，二話不說，帶著自己外甥等人一口氣殺到了最前方。他的打法更加凶悍，先是強行登了一條船，殺光水手，再找另外一條船。中途他數次落海，抓著小船浮上來，抹掉臉上的海水，繼續殺。
一時間，慘叫聲、喊殺聲、火器射擊聲和船隻沉沒發出的斷裂聲交織到了一起，成為一場死亡交響樂。日本水軍的這幾員大將個個如同嗜血的鯊魚一樣，瘋狂地殺戮著，他們等待這一刻，等的實在太久了。這些李舜臣的手下敗將，終於找到了出氣的機會。
一直到戰鬥快要結束了，駐屯竹島的鍋島勝茂這才匆匆趕到現場。他發現朝鮮艦隊被消滅的差不多了，十分沮喪，這時他手下一指，說岸邊還有好幾條吶。他心中大喜，衝上去把這些船搶到手，也算立了功勞。他還不忘派了成富茂安突入戰場，也砍殺七百餘人。
鍋島勝茂甚至還有心情坐下來欣賞海戰，說我小時候被秀吉大人帶著去欣賞過芳野的櫻花，而眼前這番美景，比芳野櫻還要絢爛奪目啊。
這一場大戰持續了半天，朝鮮水師幾乎全軍覆沒。李舜臣的親密戰友、全羅道右水使李億祺、忠清水使崔湖等人在一片混亂中相繼投水而死，這些水師精英的淪亡，令人扼腕嘆息。
三道水軍的最高統帥元均看到大勢已去，只得收攏附近的二十餘艘船隻，朝著岸邊靠攏，希望能登岸逃出生天。
元均也不想想，同樣的虧他都已經吃過兩次了，日本人怎麼會不准備第三次？
等待元均的，是島津義弘早早埋伏好的三千生力軍。這支部隊原來駐屯在唐島，開戰後悄悄移至漆梁川附近，就是為了伏擊慌不擇路的朝鮮水軍——由此可見，日軍這一次的水軍攻略，是早有預謀，而且籌劃相當周密，水、陸兩軍錶現出了驚人的默契。
這一戰下來，朝鮮水師所剩無幾的殘兵，被毫無懸念地屠戮一空。元均在亂軍之中試圖逃跑，可惜因為體型太過肥胖，動彈不得，只好靠在一棵松樹旁喘息，被追來的日本士兵一刀殺死。後人有詩讚曰：閒山一島國南門，底事朝廷易將頻，不是元均初負國，元均之腹負元均。
另外還有一種說法認為元均沒有戰死，只是被俘，或者逃出生天了——但無論哪方面的史料，從此都再沒有關於這個人任何活著的記錄。因此，即使他僥倖活下來，“元均”這個名字也已經在漆梁川劃上了句號。
不管怎麼說，元均總算是力戰而死，因此後來他被李朝追授為從一品左贊成，原陵君，身後恩榮不輸給其他殉國的朝鮮將領，與李舜臣平級。時人對元均似乎還頗有同情，說“均雖敗死，似非不忠不義所致。”
他當然不是不忠不義，他只是無能。在戰爭期間，無能對高級將領來說，也是一種罪過。
戰鬥結束以後，藤堂高虎和加藤嘉明都認為自己立的功勞最大，幾乎大打出手。最後還是松浦鎮信出來打圓場，說藤堂先在夜里安排下哨船，又乾掉了元均，理應頭功。秀吉聽說以後，封了藤堂高虎總督天下海船之政，賜了桐花徽號，茜紅舟幕，以表彰他的功勞。
朝鮮水軍在這一役，不必提損失有多少，只要知道還剩多少就知道了：十二艘板屋船。這還是裴楔當機立斷才保存下來的。可見在漆川樑的戰鬥中，朝鮮水軍是毫不誇張地全軍覆沒。
裴楔從戰場撤退後，直接退回閒山島。他知道不可再守，就遣散了島民，燒毀了軍器物資，返回麗水。他的十二艘戰船，為朝鮮水師留下了寶貴的種子。不過裴楔到底算是拋棄主帥臨陣脫逃，就連李舜臣都無法原諒他，也算是個悲劇性的人物。
漆川樑的敗戰傳到漢城，朝鮮君臣如被雷擊，全都傻了眼。
怎麼辦？只能再度啟用李舜臣。
於是，漆梁川海戰結束後的第十天，李舜臣官復原職，來到麗水。等待他的只有裴楔的十二條船，這是三道水師全部家當。
早幹嘛去了？